Protein–RNA interactions for Protein: P24723

PRKCH, Protein kinase C eta type, humanhuman

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Length 683 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKCHP24723 NPY-203ENST00000407573 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
PRKCHP24723 PMS2P2-201ENST00000425039 1128 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
PRKCHP24723 MKNK2P1-201ENST00000437526 628 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
PRKCHP24723 DARS-AS1-203ENST00000438432 768 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
PRKCHP24723 SLC25A6P2-201ENST00000497974 877 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
PRKCHP24723 IL18BP-211ENST00000531053 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
PRKCHP24723 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
PRKCHP24723 OVCA2-201ENST00000572195 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PRKCHP24723 AC002398.2-201ENST00000587767 660 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
PRKCHP24723 MRPL34-205ENST00000600434 793 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
PRKCHP24723 PHGDH-223ENST00000641597 2585 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
PRKCHP24723 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PRKCHP24723 LFNG-207ENST00000614382 1969 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
PRKCHP24723 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PRKCHP24723 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
PRKCHP24723 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PRKCHP24723 AC007381.1-201ENST00000457668 2005 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
PRKCHP24723 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
PRKCHP24723 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
PRKCHP24723 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PRKCHP24723 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
PRKCHP24723 NUP50-202ENST00000396096 1895 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
PRKCHP24723 CBWD2-204ENST00000433343 1411 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
PRKCHP24723 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PRKCHP24723 TCP1-203ENST00000420894 1671 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
PRKCHP24723 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PRKCHP24723 ELL2P1-201ENST00000413990 1906 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
PRKCHP24723 CRY2-211ENST00000616080 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PRKCHP24723 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PRKCHP24723 SSH1-201ENST00000326470 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
PRKCHP24723 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
PRKCHP24723 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PRKCHP24723 LINC00472-203ENST00000426635 2958 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
PRKCHP24723 OVOL1-203ENST00000532448 1774 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PRKCHP24723 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PRKCHP24723 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
PRKCHP24723 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
PRKCHP24723 SPACA4-201ENST00000321762 972 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
PRKCHP24723 AL162231.1-204ENST00000423809 477 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
PRKCHP24723 AC087163.2-201ENST00000457299 853 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
PRKCHP24723 FBXL21-206ENST00000495672 589 ntTSL 4 BASIC17.39■□□□□ 0.37
PRKCHP24723 FCHSD1-204ENST00000519800 802 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
PRKCHP24723 AC069503.2-201ENST00000546333 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
PRKCHP24723 ACTL9-202ENST00000612068 1252 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
PRKCHP24723 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PRKCHP24723 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PRKCHP24723 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PRKCHP24723 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PRKCHP24723 GULP1-209ENST00000410051 1595 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PRKCHP24723 FOXS1-201ENST00000375978 1319 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
PRKCHP24723 FAM131A-207ENST00000450976 1335 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
PRKCHP24723 SEMA3B-213ENST00000618865 2925 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
PRKCHP24723 SLC25A35-202ENST00000577745 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PRKCHP24723 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PRKCHP24723 LRRC14-205ENST00000529022 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PRKCHP24723 DMRTC2-204ENST00000596827 1675 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
PRKCHP24723 EVA1A-205ENST00000410113 1747 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PRKCHP24723 LIMS2-208ENST00000410011 2335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PRKCHP24723 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PRKCHP24723 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PRKCHP24723 ZNF133-204ENST00000396026 2717 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PRKCHP24723 ZMYM3-203ENST00000373981 1841 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PRKCHP24723 FRMD8P1-201ENST00000440433 1524 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
PRKCHP24723 SGO2-202ENST00000409203 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PRKCHP24723 FAM58CP-201ENST00000435741 640 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
PRKCHP24723 FAM185BP-201ENST00000443595 716 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
PRKCHP24723 SLC26A4-AS1-202ENST00000449741 586 ntTSL 4 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PRKCHP24723 CEND1P1-201ENST00000451006 455 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
PRKCHP24723 AC074386.1-202ENST00000463561 864 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
PRKCHP24723 CD99L2-206ENST00000466436 988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PRKCHP24723 AKR1A1-204ENST00000471651 1018 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PRKCHP24723 DDIAS-202ENST00000524921 607 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PRKCHP24723 AL031432.2-201ENST00000566714 459 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
PRKCHP24723 AL928711.1-201ENST00000570165 459 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
PRKCHP24723 LINC00668-203ENST00000579012 605 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PRKCHP24723 AC007192.2-201ENST00000600364 463 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PRKCHP24723 AC007064.4-201ENST00000637740 555 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
PRKCHP24723 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PRKCHP24723 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PRKCHP24723 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PRKCHP24723 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PRKCHP24723 WDR74-204ENST00000525239 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PRKCHP24723 KCNQ2-215ENST00000629241 2853 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PRKCHP24723 GPR137-212ENST00000539851 1843 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PRKCHP24723 FAM57B-201ENST00000279389 1481 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PRKCHP24723 FAM53B-AS1-202ENST00000448422 1491 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PRKCHP24723 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PRKCHP24723 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PRKCHP24723 FBXO24-206ENST00000468962 1901 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PRKCHP24723 L1CAM-203ENST00000370055 4655 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PRKCHP24723 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PRKCHP24723 KPNA2-202ENST00000537025 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PRKCHP24723 RAPGEFL1-209ENST00000544503 2079 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PRKCHP24723 SLC19A2-202ENST00000367804 2976 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PRKCHP24723 KCNIP2-208ENST00000370046 923 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PRKCHP24723 HSD17B8-203ENST00000374662 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PRKCHP24723 C1orf226-202ENST00000426197 1049 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PRKCHP24723 LINC01503-203ENST00000436710 901 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PRKCHP24723 AC007364.1-201ENST00000449714 1022 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PRKCHP24723 AC093714.2-201ENST00000489626 763 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
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