Protein–RNA interactions for Protein: P22307

SCP2, Non-specific lipid-transfer protein, humanhuman

Predictions only

Length 547 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCP2P22307 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SCP2P22307 TOM1L1-204ENST00000570371 2442 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SCP2P22307 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SCP2P22307 NRN1L-201ENST00000339176 710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SCP2P22307 C2orf49-202ENST00000410049 854 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SCP2P22307 PMS2P4-201ENST00000412466 1052 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
SCP2P22307 FALEC-201ENST00000416894 566 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SCP2P22307 WDR53-204ENST00000433160 887 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SCP2P22307 FBXL21-206ENST00000495672 589 ntTSL 4 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SCP2P22307 KRT19P2-202ENST00000557173 1012 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
SCP2P22307 WT1-AS_2.1-201ENST00000613208 137 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
SCP2P22307 TATDN3-214ENST00000532324 1381 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SCP2P22307 HPSE-207ENST00000513463 1458 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SCP2P22307 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SCP2P22307 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SCP2P22307 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SCP2P22307 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SCP2P22307 CDK16-202ENST00000357227 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SCP2P22307 LSP1-202ENST00000381775 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SCP2P22307 MIER1-206ENST00000371016 1802 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SCP2P22307 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SCP2P22307 REM2-202ENST00000536884 1331 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SCP2P22307 CDC42EP4-201ENST00000335793 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SCP2P22307 ZDHHC20-209ENST00000542645 5315 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SCP2P22307 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SCP2P22307 GDA-201ENST00000238018 2074 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SCP2P22307 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SCP2P22307 PRR15-201ENST00000319694 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SCP2P22307 GTF2H1-203ENST00000453096 2707 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SCP2P22307 TMED9-201ENST00000332598 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SCP2P22307 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SCP2P22307 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SCP2P22307 ATP23-201ENST00000300145 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SCP2P22307 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SCP2P22307 DDT-204ENST00000404092 805 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SCP2P22307 MCCD1P2-201ENST00000423228 335 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
SCP2P22307 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
SCP2P22307 TSPAN32-207ENST00000451520 1236 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SCP2P22307 GSTK1-207ENST00000479303 1185 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SCP2P22307 AP000892.1-201ENST00000504906 488 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SCP2P22307 NMU-203ENST00000507338 658 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SCP2P22307 IL32-212ENST00000526464 1198 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SCP2P22307 IL32-217ENST00000530538 674 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SCP2P22307 MAL2-202ENST00000531508 892 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SCP2P22307 AC109635.5-201ENST00000533593 962 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
SCP2P22307 PAX9-204ENST00000554201 1289 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SCP2P22307 CYP2A7P1-201ENST00000595391 815 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
SCP2P22307 TSKU-205ENST00000612930 2666 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SCP2P22307 MGEA5-203ENST00000370094 3314 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SCP2P22307 ZNF213-206ENST00000574902 3208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SCP2P22307 SIK3-205ENST00000446921 3858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SCP2P22307 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SCP2P22307 SLC22A5-203ENST00000435065 1746 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SCP2P22307 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SCP2P22307 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SCP2P22307 ESR2-201ENST00000267525 1518 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SCP2P22307 UBE2G1-204ENST00000572484 1514 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SCP2P22307 HNRNPA3-201ENST00000392524 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SCP2P22307 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SCP2P22307 BCAR1-209ENST00000546196 1340 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
SCP2P22307 HARS-203ENST00000431330 1774 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SCP2P22307 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SCP2P22307 AC099508.1-201ENST00000499110 1666 ntTSL 4 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SCP2P22307 ENC1-205ENST00000510316 5381 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SCP2P22307 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SCP2P22307 EED-202ENST00000327320 2033 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SCP2P22307 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SCP2P22307 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SCP2P22307 RASGRP2-206ENST00000377494 2983 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SCP2P22307 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SCP2P22307 SLC34A2-202ENST00000503434 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SCP2P22307 WDR45-206ENST00000376368 1381 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SCP2P22307 TYROBP-201ENST00000262629 568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SCP2P22307 RNF151-201ENST00000321392 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SCP2P22307 C22orf39-201ENST00000333059 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SCP2P22307 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SCP2P22307 KCNIP2-208ENST00000370046 923 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SCP2P22307 FABP5-202ENST00000396359 986 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SCP2P22307 AP000695.1-201ENST00000429588 893 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SCP2P22307 FIS1-203ENST00000442303 631 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SCP2P22307 AC074386.1-202ENST00000463561 864 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
SCP2P22307 MRVI1-AS1-203ENST00000529979 784 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SCP2P22307 RNF151-203ENST00000569714 796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SCP2P22307 ELOF1-204ENST00000587806 1172 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SCP2P22307 AC007193.2-201ENST00000596807 472 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SCP2P22307 HNRNPDL-206ENST00000602300 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SCP2P22307 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SCP2P22307 SLC8B1-210ENST00000550047 2493 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SCP2P22307 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SCP2P22307 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SCP2P22307 WDR53-201ENST00000332629 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SCP2P22307 TEAD4-202ENST00000359864 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SCP2P22307 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SCP2P22307 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SCP2P22307 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SCP2P22307 KHK-202ENST00000260599 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SCP2P22307 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SCP2P22307 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SCP2P22307 PIGW-204ENST00000614443 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SCP2P22307 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.7 ms