Protein–RNA interactions for Protein: P19429

TNNI3, Troponin I, cardiac muscle, humanhuman

Predictions only

Length 210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNNI3P19429 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TNNI3P19429 AL590787.1-201ENST00000568856 1315 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
TNNI3P19429 ADD1-201ENST00000264758 4045 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TNNI3P19429 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TNNI3P19429 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TNNI3P19429 ZFYVE28-208ENST00000511071 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TNNI3P19429 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
TNNI3P19429 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TNNI3P19429 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TNNI3P19429 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TNNI3P19429 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TNNI3P19429 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TNNI3P19429 CA12-203ENST00000422263 2556 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TNNI3P19429 CNTNAP3-205ENST00000377659 2649 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TNNI3P19429 GRM5-205ENST00000455756 7927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TNNI3P19429 CTDSP2-201ENST00000398073 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TNNI3P19429 BLOC1S5-202ENST00000397457 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TNNI3P19429 AC116353.5-201ENST00000638148 1699 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
TNNI3P19429 PI4KAP1-204ENST00000612579 1703 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
TNNI3P19429 DDX19B-207ENST00000563206 1765 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TNNI3P19429 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TNNI3P19429 NR4A3-204ENST00000618101 5706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TNNI3P19429 ITSN1-204ENST00000381285 6107 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TNNI3P19429 AGGF1P2-201ENST00000426656 2106 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
TNNI3P19429 MST1L-201ENST00000442552 2185 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
TNNI3P19429 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TNNI3P19429 DYNC1I1-212ENST00000630942 2249 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TNNI3P19429 PCDHA14-201ENST00000506751 2298 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
TNNI3P19429 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TNNI3P19429 SRGAP2B-207ENST00000641863 2367 ntAPPRIS P5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TNNI3P19429 FAM76B-201ENST00000358780 3952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TNNI3P19429 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TNNI3P19429 BCL11A-201ENST00000335712 5942 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TNNI3P19429 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TNNI3P19429 GDF6-201ENST00000287020 3701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TNNI3P19429 SGF29-201ENST00000317058 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TNNI3P19429 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TNNI3P19429 TMEM59-202ENST00000371337 600 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TNNI3P19429 YDJC-202ENST00000398873 1066 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TNNI3P19429 AL031587.1-201ENST00000410099 1055 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TNNI3P19429 AL590627.1-203ENST00000421194 1026 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
TNNI3P19429 SLC4A1APP2-201ENST00000424054 1259 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
TNNI3P19429 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TNNI3P19429 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TNNI3P19429 AP006621.3-203ENST00000525941 610 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TNNI3P19429 AC069287.3-201ENST00000527297 589 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TNNI3P19429 FGFR1OP2-206ENST00000546072 956 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TNNI3P19429 AC133919.2-201ENST00000565965 589 ntTSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TNNI3P19429 AC002091.2-201ENST00000585297 402 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TNNI3P19429 FBF1-204ENST00000586631 621 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TNNI3P19429 CYGB-205ENST00000590175 830 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TNNI3P19429 LINC01666-201ENST00000623794 845 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TNNI3P19429 HFE2-204ENST00000475797 1381 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TNNI3P19429 LINC00894-202ENST00000425602 1597 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TNNI3P19429 CHRM2-201ENST00000320658 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TNNI3P19429 EWSAT1-206ENST00000558922 1725 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TNNI3P19429 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TNNI3P19429 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TNNI3P19429 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TNNI3P19429 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TNNI3P19429 AL365277.1-202ENST00000331856 2241 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TNNI3P19429 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TNNI3P19429 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TNNI3P19429 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TNNI3P19429 LRP8-207ENST00000465675 2670 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TNNI3P19429 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TNNI3P19429 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TNNI3P19429 TSHZ1-204ENST00000580243 3582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TNNI3P19429 SLC30A5-202ENST00000396591 4360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TNNI3P19429 VAV2-201ENST00000371850 4837 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TNNI3P19429 ANKRD26-201ENST00000376087 6591 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TNNI3P19429 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TNNI3P19429 NFATC4-211ENST00000554344 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TNNI3P19429 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TNNI3P19429 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TNNI3P19429 GDF5-201ENST00000374369 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TNNI3P19429 PPP1R3B-202ENST00000519699 2334 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TNNI3P19429 OSBPL9-222ENST00000531828 2210 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TNNI3P19429 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TNNI3P19429 TMEM127-201ENST00000258439 6266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TNNI3P19429 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TNNI3P19429 COPS8-202ENST00000392008 1654 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TNNI3P19429 TBC1D1-203ENST00000402522 1567 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TNNI3P19429 INHA-201ENST00000243786 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TNNI3P19429 SNTG2-202ENST00000407292 1436 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TNNI3P19429 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TNNI3P19429 AFTPH-202ENST00000238856 4040 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TNNI3P19429 STIM2-203ENST00000467011 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TNNI3P19429 AQP12A-201ENST00000337801 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TNNI3P19429 AC073621.1-201ENST00000392730 636 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
TNNI3P19429 AC098831.1-202ENST00000438821 336 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
TNNI3P19429 RPS15P9-201ENST00000494093 319 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
TNNI3P19429 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
TNNI3P19429 LMX1B-203ENST00000526117 1195 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TNNI3P19429 HEXA-210ENST00000567213 1000 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TNNI3P19429 NAA60-217ENST00000572942 1089 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TNNI3P19429 ABHD15-201ENST00000307201 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TNNI3P19429 DNAJC10-210ENST00000616986 5783 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TNNI3P19429 CES3-203ENST00000543856 3178 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TNNI3P19429 SH3BP4-203ENST00000409212 5231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.4 ms