Protein–RNA interactions for Protein: P17661

DES, Desmin, humanhuman

Predictions only

Length 470 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DESP17661 TBC1D1-203ENST00000402522 1567 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
DESP17661 CCNL2-203ENST00000408952 1857 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
DESP17661 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
DESP17661 PSMC5-202ENST00000375812 1494 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
DESP17661 DIXDC1-201ENST00000440460 5897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
DESP17661 PCDHA4-203ENST00000530339 5251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
DESP17661 AC067930.6-201ENST00000623257 4947 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
DESP17661 KRT8P49-201ENST00000604166 1432 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
DESP17661 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
DESP17661 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
DESP17661 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
DESP17661 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
DESP17661 RBFOX1-212ENST00000550418 4775 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
DESP17661 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
DESP17661 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
DESP17661 LSP1-217ENST00000612798 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
DESP17661 ITPRIPL2-201ENST00000381440 7247 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
DESP17661 XXYLT1-205ENST00000437101 2149 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
DESP17661 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
DESP17661 TRAPPC3-210ENST00000617904 1305 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
DESP17661 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
DESP17661 ALDH3A2-225ENST00000630662 1558 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
DESP17661 SSFA2-202ENST00000409001 4987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
DESP17661 EVPLL-201ENST00000399134 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
DESP17661 TRIM7-204ENST00000393319 2320 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
DESP17661 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
DESP17661 FAM99B-201ENST00000382166 1067 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
DESP17661 POMC-203ENST00000395826 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
DESP17661 TIMM17B-202ENST00000396779 1099 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
DESP17661 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
DESP17661 KRT18P67-201ENST00000432816 1264 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
DESP17661 SNHG17-206ENST00000436764 973 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
DESP17661 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
DESP17661 AC136632.2-201ENST00000512891 861 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
DESP17661 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
DESP17661 AC012615.5-201ENST00000592720 581 ntTSL 4 BASIC17.8■□□□□ 0.44
DESP17661 GRTP1-205ENST00000620217 1073 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
DESP17661 TMEM155-202ENST00000394394 1753 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
DESP17661 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
DESP17661 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
DESP17661 WDR74-204ENST00000525239 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
DESP17661 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
DESP17661 IL12RB1-201ENST00000322153 1902 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
DESP17661 C14orf93-205ENST00000397379 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
DESP17661 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
DESP17661 LARP6-201ENST00000299213 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
DESP17661 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
DESP17661 CKMT2-202ENST00000424301 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
DESP17661 LSS-205ENST00000457828 4390 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
DESP17661 CAP2-202ENST00000378990 1812 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
DESP17661 DCLK2-201ENST00000296550 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
DESP17661 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
DESP17661 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
DESP17661 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
DESP17661 QRFPR-202ENST00000394427 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
DESP17661 RDX-201ENST00000343115 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
DESP17661 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
DESP17661 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
DESP17661 TSTD1-204ENST00000423014 593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
DESP17661 RPS2P1-201ENST00000434010 821 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
DESP17661 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
DESP17661 GOLGA7-203ENST00000518270 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
DESP17661 HIST1H2AK-201ENST00000618958 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
DESP17661 AC005593.1-201ENST00000624894 515 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
DESP17661 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
DESP17661 CCDC50-201ENST00000392455 8429 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
DESP17661 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
DESP17661 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
DESP17661 SIN3B-201ENST00000248054 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
DESP17661 HDAC5-202ENST00000336057 5040 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
DESP17661 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
DESP17661 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
DESP17661 LAT2-201ENST00000275635 1869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
DESP17661 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
DESP17661 BSG-203ENST00000353555 1616 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
DESP17661 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
DESP17661 JPT1-209ENST00000482348 1614 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
DESP17661 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
DESP17661 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
DESP17661 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
DESP17661 IL12RB2-201ENST00000262345 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
DESP17661 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
DESP17661 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
DESP17661 NFKBIA-201ENST00000216797 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
DESP17661 DUS3L-202ENST00000320699 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
DESP17661 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
DESP17661 ZNF140-210ENST00000544426 2340 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
DESP17661 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
DESP17661 SLFNL1-205ENST00000439569 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
DESP17661 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
DESP17661 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
DESP17661 EWSAT1-206ENST00000558922 1725 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
DESP17661 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
DESP17661 MIF4GD-204ENST00000577542 1531 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
DESP17661 SAMD4A-204ENST00000554335 3003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
DESP17661 VAV3-210ENST00000527011 4510 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
DESP17661 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
DESP17661 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
DESP17661 CARD11-203ENST00000396946 4366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
DESP17661 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.3 ms