Protein–RNA interactions for Protein: P11926

ODC1, Ornithine decarboxylase, humanhuman

Predictions only

Length 461 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ODC1P11926 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ODC1P11926 SLC25A35-205ENST00000580340 1541 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ODC1P11926 GPS1-228ENST00000624957 1825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ODC1P11926 ASAH1-231ENST00000636577 2129 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ODC1P11926 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ODC1P11926 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
ODC1P11926 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ODC1P11926 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ODC1P11926 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ODC1P11926 YY1-201ENST00000262238 6697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ODC1P11926 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ODC1P11926 IRF5-215ENST00000619830 1652 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ODC1P11926 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ODC1P11926 METTL26-202ENST00000338401 544 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ODC1P11926 IL32-205ENST00000396890 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ODC1P11926 AL645939.2-201ENST00000427340 991 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
ODC1P11926 RANGRF-203ENST00000439238 1140 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ODC1P11926 IL32-206ENST00000440815 920 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ODC1P11926 IL32-207ENST00000444393 892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ODC1P11926 AL355140.1-201ENST00000457328 398 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ODC1P11926 HLA-J-203ENST00000494367 1087 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
ODC1P11926 AL391335.1-201ENST00000504583 535 ntTSL 4 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ODC1P11926 IL32-219ENST00000531965 746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ODC1P11926 IL32-223ENST00000534507 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ODC1P11926 IL32-226ENST00000548476 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ODC1P11926 IL32-227ENST00000548652 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ODC1P11926 IL32-233ENST00000552664 731 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ODC1P11926 GNAO1-210ENST00000569295 930 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ODC1P11926 AC093028.1-201ENST00000622998 982 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
ODC1P11926 LINC00628-201ENST00000628516 1289 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
ODC1P11926 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ODC1P11926 ZNF57-201ENST00000306908 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ODC1P11926 ZNF57-205ENST00000614108 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ODC1P11926 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ODC1P11926 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ODC1P11926 ENC1-207ENST00000618628 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ODC1P11926 MUTYH-201ENST00000354383 1744 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ODC1P11926 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ODC1P11926 SERF2-203ENST00000381359 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ODC1P11926 COPS3-212ENST00000539941 1699 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ODC1P11926 TPGS2-220ENST00000610723 1426 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ODC1P11926 GYG1-201ENST00000296048 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ODC1P11926 SLC22A12-201ENST00000336464 1854 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ODC1P11926 NPM2-203ENST00000397940 1874 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ODC1P11926 AL391256.1-201ENST00000443260 1855 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
ODC1P11926 BNIP2-212ENST00000607373 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ODC1P11926 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ODC1P11926 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ODC1P11926 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ODC1P11926 ZDHHC4-206ENST00000405731 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ODC1P11926 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ODC1P11926 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ODC1P11926 IGSF8-205ENST00000614243 2191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ODC1P11926 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ODC1P11926 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ODC1P11926 TPM2-201ENST00000329305 1018 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ODC1P11926 YIF1B-201ENST00000329420 964 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ODC1P11926 PNMT-202ENST00000394246 821 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ODC1P11926 PCAT6-201ENST00000417262 748 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ODC1P11926 KRT18P34-201ENST00000488218 1270 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
ODC1P11926 RPS3A-212ENST00000514682 985 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ODC1P11926 FXYD6-209ENST00000530956 579 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ODC1P11926 LSM12-202ENST00000585388 942 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ODC1P11926 AC008267.7-201ENST00000624570 1194 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
ODC1P11926 AL732314.4-201ENST00000627627 515 ntTSL 4 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ODC1P11926 AL356481.3-201ENST00000630523 575 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ODC1P11926 BORCS8-203ENST00000477565 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ODC1P11926 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ODC1P11926 TCP1-203ENST00000420894 1671 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ODC1P11926 ZNF446-201ENST00000335841 1889 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ODC1P11926 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ODC1P11926 WLS-202ENST00000354777 2037 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ODC1P11926 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ODC1P11926 TRIP10-201ENST00000313244 2153 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ODC1P11926 ANTXRL-206ENST00000622632 1964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ODC1P11926 WDR74-206ENST00000529106 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ODC1P11926 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ODC1P11926 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ODC1P11926 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ODC1P11926 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ODC1P11926 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ODC1P11926 HLA-B-249ENST00000412585 1547 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ODC1P11926 UXT-AS1-201ENST00000590504 1525 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
ODC1P11926 AMMECR1-201ENST00000262844 5504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ODC1P11926 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ODC1P11926 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ODC1P11926 WDR90-209ENST00000547944 1672 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ODC1P11926 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ODC1P11926 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ODC1P11926 UPK2-201ENST00000264031 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ODC1P11926 STOML1-203ENST00000359750 984 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ODC1P11926 YWHAZ-204ENST00000395953 994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ODC1P11926 MIPEPP3-202ENST00000424756 347 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ODC1P11926 SLC25A36-204ENST00000453248 1040 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ODC1P11926 VASH2-211ENST00000517399 1068 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ODC1P11926 IGLL5-201ENST00000526893 1050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ODC1P11926 RFPL4AP1-201ENST00000530883 850 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
ODC1P11926 IGLL5-202ENST00000531372 882 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ODC1P11926 AC025678.2-201ENST00000562061 970 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
ODC1P11926 AL138781.1-202ENST00000563018 775 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.3 ms