Protein–RNA interactions for Protein: P0DI81

TRAPPC2, Trafficking protein particle complex subunit 2, humanhuman

Predictions only

Length 140 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC2P0DI81 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
TRAPPC2P0DI81 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
TRAPPC2P0DI81 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
TRAPPC2P0DI81 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
TRAPPC2P0DI81 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
TRAPPC2P0DI81 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
TRAPPC2P0DI81 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
TRAPPC2P0DI81 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
TRAPPC2P0DI81 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
TRAPPC2P0DI81 MAPKAP1-201ENST00000265960 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
TRAPPC2P0DI81 IPO8-201ENST00000256079 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
TRAPPC2P0DI81 NEBL-203ENST00000417816 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
TRAPPC2P0DI81 SMIM13-202ENST00000416247 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
TRAPPC2P0DI81 MED16-207ENST00000589119 2772 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
TRAPPC2P0DI81 TLE3-202ENST00000440567 2657 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
TRAPPC2P0DI81 AC092198.1-201ENST00000447651 2691 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
TRAPPC2P0DI81 MPP1-205ENST00000413259 2195 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
TRAPPC2P0DI81 JPH4-205ENST00000622501 3489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
TRAPPC2P0DI81 AC096667.1-201ENST00000640078 3465 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
TRAPPC2P0DI81 PI16-203ENST00000611814 2083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
TRAPPC2P0DI81 IRAK1-204ENST00000393687 2049 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
TRAPPC2P0DI81 PLAA-205ENST00000520884 2041 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
TRAPPC2P0DI81 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
TRAPPC2P0DI81 MAP7-207ENST00000616617 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
TRAPPC2P0DI81 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
TRAPPC2P0DI81 CD8A-201ENST00000283635 2873 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
TRAPPC2P0DI81 EPB41L3-206ENST00000544123 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
TRAPPC2P0DI81 TRPM2-208ENST00000621064 1669 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
TRAPPC2P0DI81 TTLL13P-202ENST00000438251 2738 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
TRAPPC2P0DI81 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
TRAPPC2P0DI81 HELZ2-202ENST00000427522 7827 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
TRAPPC2P0DI81 SEPT9-244ENST00000592420 2588 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
TRAPPC2P0DI81 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
TRAPPC2P0DI81 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
TRAPPC2P0DI81 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
TRAPPC2P0DI81 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
TRAPPC2P0DI81 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
TRAPPC2P0DI81 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
TRAPPC2P0DI81 SHC1-204ENST00000368450 3059 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
TRAPPC2P0DI81 SHC1-205ENST00000368453 3062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
TRAPPC2P0DI81 B4GALNT1-201ENST00000341156 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
TRAPPC2P0DI81 ELAVL3-201ENST00000359227 4729 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.08
TRAPPC2P0DI81 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
TRAPPC2P0DI81 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
TRAPPC2P0DI81 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
TRAPPC2P0DI81 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
TRAPPC2P0DI81 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
TRAPPC2P0DI81 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
TRAPPC2P0DI81 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
TRAPPC2P0DI81 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
TRAPPC2P0DI81 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
TRAPPC2P0DI81 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
TRAPPC2P0DI81 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
TRAPPC2P0DI81 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
TRAPPC2P0DI81 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
TRAPPC2P0DI81 GPR17-201ENST00000272644 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
TRAPPC2P0DI81 EPOP-201ENST00000621654 3719 ntAPPRIS P1 BASIC14.52□□□□□ -0.09
TRAPPC2P0DI81 MINDY1-202ENST00000361738 1961 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
TRAPPC2P0DI81 GTF3C4-201ENST00000372146 9043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
TRAPPC2P0DI81 REEP2-211ENST00000613650 1944 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
TRAPPC2P0DI81 C6orf106-203ENST00000374026 4232 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
TRAPPC2P0DI81 TMEM19-201ENST00000266673 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
TRAPPC2P0DI81 WBP4-201ENST00000379487 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
TRAPPC2P0DI81 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
TRAPPC2P0DI81 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
TRAPPC2P0DI81 AC021683.3-202ENST00000592572 4440 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
TRAPPC2P0DI81 OSGIN1-201ENST00000343939 2391 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
TRAPPC2P0DI81 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
TRAPPC2P0DI81 PSMD9-201ENST00000261817 2307 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
TRAPPC2P0DI81 PES1-202ENST00000354694 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
TRAPPC2P0DI81 SERPINE3-204ENST00000524365 2293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
TRAPPC2P0DI81 RIOX2-202ENST00000360258 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
TRAPPC2P0DI81 UGDH-202ENST00000501493 2826 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
TRAPPC2P0DI81 SDCBP-201ENST00000260130 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
TRAPPC2P0DI81 TCP10-210ENST00000617120 2182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
TRAPPC2P0DI81 RASA4B-207ENST00000541662 2794 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
TRAPPC2P0DI81 VSIG10L-201ENST00000335624 3397 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
TRAPPC2P0DI81 AC004817.3-201ENST00000602957 2129 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
TRAPPC2P0DI81 APBA2-205ENST00000558330 3349 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
TRAPPC2P0DI81 GPR161-204ENST00000367838 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
TRAPPC2P0DI81 RASA1-201ENST00000274376 3752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
TRAPPC2P0DI81 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
TRAPPC2P0DI81 NRP1-203ENST00000374821 1988 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
TRAPPC2P0DI81 IMPDH1-202ENST00000348127 2479 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
TRAPPC2P0DI81 NEK7-202ENST00000367385 4149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
TRAPPC2P0DI81 MROH1-201ENST00000326134 5183 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
TRAPPC2P0DI81 CCNY-202ENST00000339497 4630 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
TRAPPC2P0DI81 CEP78-203ENST00000376598 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
TRAPPC2P0DI81 ZNF334-202ENST00000457685 3487 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
TRAPPC2P0DI81 ZBED1-201ENST00000381218 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
TRAPPC2P0DI81 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
TRAPPC2P0DI81 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
TRAPPC2P0DI81 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
TRAPPC2P0DI81 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
TRAPPC2P0DI81 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
TRAPPC2P0DI81 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
TRAPPC2P0DI81 HLA-J-202ENST00000469281 1241 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
TRAPPC2P0DI81 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
TRAPPC2P0DI81 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
TRAPPC2P0DI81 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.8 ms