Protein–RNA interactions for Protein: P07196

NEFL, Neurofilament light polypeptide, humanhuman

Predictions only

Length 543 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEFLP07196 SLC37A1-201ENST00000352133 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NEFLP07196 ACTL8-201ENST00000375406 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NEFLP07196 HHATL-205ENST00000441594 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NEFLP07196 KLHDC8B-201ENST00000332780 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NEFLP07196 TLDC2-201ENST00000217320 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NEFLP07196 PLTP-205ENST00000477313 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NEFLP07196 SLC27A5-201ENST00000263093 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NEFLP07196 FUT7-201ENST00000314412 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NEFLP07196 IL12RB2-206ENST00000544434 3782 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NEFLP07196 CRK-201ENST00000300574 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NEFLP07196 RTEL1-205ENST00000370018 4955 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NEFLP07196 SALL4-203ENST00000395997 1918 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NEFLP07196 PLEKHA4-202ENST00000355496 2614 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NEFLP07196 KCND3-202ENST00000315987 2716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NEFLP07196 OR2I1P-210ENST00000642037 4691 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
NEFLP07196 PEA15-202ENST00000368076 2694 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
NEFLP07196 EIF2S2-201ENST00000374980 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NEFLP07196 ALDOA-201ENST00000338110 2384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NEFLP07196 MIEF1-202ENST00000402881 2269 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NEFLP07196 IQCE-210ENST00000438376 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
NEFLP07196 AL596087.1-201ENST00000400979 1969 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
NEFLP07196 CD68-201ENST00000250092 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NEFLP07196 PYCR1-201ENST00000329875 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NEFLP07196 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
NEFLP07196 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NEFLP07196 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NEFLP07196 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NEFLP07196 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NEFLP07196 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NEFLP07196 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
NEFLP07196 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
NEFLP07196 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
NEFLP07196 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
NEFLP07196 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
NEFLP07196 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
NEFLP07196 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC22.31■■□□□ 1.16
NEFLP07196 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
NEFLP07196 OR2I1P-209ENST00000641730 5365 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
NEFLP07196 NPHP4-211ENST00000622020 3004 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
NEFLP07196 SLC30A5-209ENST00000621204 3999 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
NEFLP07196 FSTL3-206ENST00000592947 2144 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NEFLP07196 P3H1-202ENST00000296388 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NEFLP07196 RPS19-206ENST00000598742 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NEFLP07196 EPB41L3-206ENST00000544123 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
NEFLP07196 ABTB1-202ENST00000453791 1961 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NEFLP07196 IFNAR1-201ENST00000270139 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NEFLP07196 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
NEFLP07196 INPP5D-201ENST00000359570 5274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NEFLP07196 IRAK1-204ENST00000393687 2049 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NEFLP07196 HLA-DQB2-231ENST00000435145 2026 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
NEFLP07196 PDXK-202ENST00000327574 2583 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
NEFLP07196 CLEC16A-203ENST00000409790 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
NEFLP07196 CCDC50-201ENST00000392455 8429 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NEFLP07196 MBD1-224ENST00000591416 4905 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
NEFLP07196 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
NEFLP07196 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NEFLP07196 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
NEFLP07196 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NEFLP07196 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
NEFLP07196 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NEFLP07196 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
NEFLP07196 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NEFLP07196 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
NEFLP07196 RNASEK-203ENST00000549393 783 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
NEFLP07196 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
NEFLP07196 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
NEFLP07196 NTRK2-201ENST00000277120 8633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NEFLP07196 FOXP1-210ENST00000484350 1996 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
NEFLP07196 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NEFLP07196 ZFR2-201ENST00000262961 4756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
NEFLP07196 SLC5A7-202ENST00000409059 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NEFLP07196 DBN1-202ENST00000309007 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NEFLP07196 PRMT5-203ENST00000397440 1907 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NEFLP07196 ULK4-203ENST00000420927 1904 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NEFLP07196 POTEE-204ENST00000613282 1926 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
NEFLP07196 POTEI-202ENST00000615053 1926 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
NEFLP07196 SUCLA2-201ENST00000378654 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NEFLP07196 RPTOR-201ENST00000306801 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NEFLP07196 CDK18-201ENST00000360066 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NEFLP07196 AC012485.3-201ENST00000637634 2424 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
NEFLP07196 IL6ST-209ENST00000502326 3007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
NEFLP07196 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NEFLP07196 HSFX1-201ENST00000370416 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NEFLP07196 SUCO-210ENST00000616058 5495 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NEFLP07196 AMT-233ENST00000636522 1620 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
NEFLP07196 MYLK3-201ENST00000394809 6911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NEFLP07196 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NEFLP07196 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
NEFLP07196 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
NEFLP07196 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
NEFLP07196 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
NEFLP07196 CUL7-203ENST00000535468 5504 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
NEFLP07196 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NEFLP07196 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
NEFLP07196 PPEF2-207ENST00000621010 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NEFLP07196 HYAL3-205ENST00000450982 1402 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NEFLP07196 MPP1-205ENST00000413259 2195 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
NEFLP07196 GRAMD2B-201ENST00000285689 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NEFLP07196 ZNF280D-207ENST00000559237 4902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NEFLP07196 CCP110-201ENST00000381396 5446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.7 ms