Protein–RNA interactions for Protein: P02647

APOA1, Apolipoprotein A-I, humanhuman

Predictions only

Length 267 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOA1P02647 FAM219A-204ENST00000379081 3543 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
APOA1P02647 KLHDC7A-201ENST00000400664 5145 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
APOA1P02647 PPARD-202ENST00000337400 2041 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
APOA1P02647 GRAMD4-202ENST00000406902 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
APOA1P02647 AUTS2-218ENST00000615871 4511 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
APOA1P02647 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
APOA1P02647 HNRNPUL1-220ENST00000602130 2932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
APOA1P02647 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
APOA1P02647 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
APOA1P02647 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
APOA1P02647 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
APOA1P02647 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
APOA1P02647 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC15.06■□□□□ 0
APOA1P02647 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
APOA1P02647 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC15.06■□□□□ 0
APOA1P02647 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
APOA1P02647 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
APOA1P02647 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
APOA1P02647 CRLS1-203ENST00000452938 3859 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
APOA1P02647 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
APOA1P02647 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
APOA1P02647 SNX5-202ENST00000377768 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
APOA1P02647 PODN-202ENST00000371500 3287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
APOA1P02647 PPFIA3-203ENST00000602351 4341 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
APOA1P02647 VPS36-207ENST00000611132 4607 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
APOA1P02647 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
APOA1P02647 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
APOA1P02647 MAP4K1-210ENST00000591517 2700 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
APOA1P02647 CAAP1-201ENST00000333916 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
APOA1P02647 MARC1-201ENST00000366910 7439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
APOA1P02647 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
APOA1P02647 WNT10B-203ENST00000407467 1802 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
APOA1P02647 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
APOA1P02647 BTN3A1-204ENST00000425234 1882 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
APOA1P02647 MAGEA2-207ENST00000620710 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
APOA1P02647 CLCN2-201ENST00000265593 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
APOA1P02647 BLK-205ENST00000529894 2017 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
APOA1P02647 ACTN2-206ENST00000542672 4906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
APOA1P02647 TMEM139-205ENST00000410004 2114 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
APOA1P02647 AC087164.1-202ENST00000583062 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
APOA1P02647 B3GAT1-201ENST00000312527 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
APOA1P02647 SLC25A33-201ENST00000302692 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
APOA1P02647 RERE-204ENST00000400908 5790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
APOA1P02647 PKIA-202ENST00000396418 4163 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
APOA1P02647 EXO5-203ENST00000372703 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
APOA1P02647 MVK-207ENST00000539575 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
APOA1P02647 CICP13-201ENST00000422015 2789 ntBASIC15.05■□□□□ 0
APOA1P02647 ZBTB7C-213ENST00000588982 4949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
APOA1P02647 CLCN2-202ENST00000344937 3187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
APOA1P02647 DMPK-202ENST00000343373 3227 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
APOA1P02647 MPPED2-202ENST00000448418 5591 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
APOA1P02647 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
APOA1P02647 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
APOA1P02647 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC15.05■□□□□ -0
APOA1P02647 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC15.05■□□□□ -0
APOA1P02647 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
APOA1P02647 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
APOA1P02647 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
APOA1P02647 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
APOA1P02647 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
APOA1P02647 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
APOA1P02647 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
APOA1P02647 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
APOA1P02647 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC15.05■□□□□ -0
APOA1P02647 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC15.05■□□□□ -0
APOA1P02647 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
APOA1P02647 TICRR-202ENST00000560985 6656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
APOA1P02647 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
APOA1P02647 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
APOA1P02647 C19orf48-201ENST00000345523 1503 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
APOA1P02647 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
APOA1P02647 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
APOA1P02647 C1RL-210ENST00000544702 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
APOA1P02647 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
APOA1P02647 MIER1-205ENST00000371014 1728 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
APOA1P02647 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
APOA1P02647 ANTXRL-205ENST00000620264 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
APOA1P02647 KNDC1-201ENST00000304613 6793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
APOA1P02647 MYADML2-201ENST00000409745 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
APOA1P02647 SMUG1-209ENST00000505128 2607 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
APOA1P02647 SIX6-201ENST00000327720 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
APOA1P02647 PODN-201ENST00000312553 3010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
APOA1P02647 PPFIBP2-201ENST00000299492 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
APOA1P02647 LINC00174-204ENST00000421767 4702 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
APOA1P02647 TMEM181-201ENST00000367090 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
APOA1P02647 KCNT1-206ENST00000486577 3760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
APOA1P02647 SPEG-205ENST00000396698 3379 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
APOA1P02647 UROC1-202ENST00000383579 2735 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
APOA1P02647 TRAF6-201ENST00000348124 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
APOA1P02647 NIPA1-201ENST00000337435 6567 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
APOA1P02647 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
APOA1P02647 SALL4-203ENST00000395997 1918 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
APOA1P02647 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
APOA1P02647 C20orf203-202ENST00000608990 5076 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
APOA1P02647 TCP1-203ENST00000420894 1671 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
APOA1P02647 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
APOA1P02647 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
APOA1P02647 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
APOA1P02647 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
APOA1P02647 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.5 ms