Protein–RNA interactions for Protein: O15360

FANCA, Fanconi anemia group A protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,455 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FANCAO15360 KRT8P39-201ENST00000396270 1433 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
FANCAO15360 AC020915.1-201ENST00000413518 1469 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
FANCAO15360 TRIM7-204ENST00000393319 2320 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
FANCAO15360 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
FANCAO15360 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
FANCAO15360 GBGT1-202ENST00000372038 847 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
FANCAO15360 SHBG-202ENST00000380450 1271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
FANCAO15360 STX1A-203ENST00000395155 783 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
FANCAO15360 KRT43P-201ENST00000434019 910 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
FANCAO15360 LINC01939-201ENST00000445279 694 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
FANCAO15360 CD74-212ENST00000524315 584 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
FANCAO15360 IL32-215ENST00000529550 772 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
FANCAO15360 AC123786.1-201ENST00000581626 661 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
FANCAO15360 KLK15-203ENST00000596931 692 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
FANCAO15360 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC24.93■■□□□ 1.58
FANCAO15360 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
FANCAO15360 CD300LG-204ENST00000539718 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
FANCAO15360 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
FANCAO15360 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
FANCAO15360 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
FANCAO15360 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
FANCAO15360 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
FANCAO15360 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC24.92■■□□□ 1.58
FANCAO15360 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
FANCAO15360 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
FANCAO15360 AL162431.1-201ENST00000434447 543 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
FANCAO15360 VCX3B-204ENST00000453306 868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
FANCAO15360 AP000345.1-201ENST00000454863 569 ntTSL 4 BASIC24.92■■□□□ 1.58
FANCAO15360 RORA-AS1-205ENST00000559824 761 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
FANCAO15360 AC027601.2-201ENST00000571085 805 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
FANCAO15360 AC002985.2-201ENST00000601106 957 ntTSL 4 BASIC24.92■■□□□ 1.58
FANCAO15360 Metazoa_SRP.80-201ENST00000619894 320 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
FANCAO15360 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
FANCAO15360 TUBB1P2-201ENST00000422712 1306 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
FANCAO15360 TUBB1P1-201ENST00000503144 1300 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
FANCAO15360 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC24.92■■□□□ 1.58
FANCAO15360 AC020907.1-201ENST00000616460 1350 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
FANCAO15360 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
FANCAO15360 DMRTC2-204ENST00000596827 1675 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
FANCAO15360 DTX4-204ENST00000532982 1708 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
FANCAO15360 RBM4-204ENST00000408993 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
FANCAO15360 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
FANCAO15360 GAL3ST1-203ENST00000402321 1908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
FANCAO15360 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
FANCAO15360 SFRP2-201ENST00000274063 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
FANCAO15360 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
FANCAO15360 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
FANCAO15360 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
FANCAO15360 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
FANCAO15360 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
FANCAO15360 CYB561D1-202ENST00000369868 1085 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
FANCAO15360 AC099336.1-201ENST00000417053 1171 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
FANCAO15360 Z82214.2-201ENST00000420269 531 ntTSL 4 BASIC24.91■■□□□ 1.58
FANCAO15360 AC109479.1-201ENST00000519603 624 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
FANCAO15360 TROAP-207ENST00000548311 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
FANCAO15360 MIR5189-201ENST00000577370 114 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
FANCAO15360 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
FANCAO15360 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
FANCAO15360 SGO1-201ENST00000263753 2338 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
FANCAO15360 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
FANCAO15360 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
FANCAO15360 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
FANCAO15360 CHAD-201ENST00000258969 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
FANCAO15360 CDK2-204ENST00000553376 1725 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
FANCAO15360 PRKACG-201ENST00000377276 1585 ntAPPRIS P1 BASIC24.9■■□□□ 1.58
FANCAO15360 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
FANCAO15360 C1QC-202ENST00000374639 1183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
FANCAO15360 MS4A13-201ENST00000378185 808 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
FANCAO15360 PRSS42-202ENST00000447340 1280 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
FANCAO15360 CTBP2P5-201ENST00000454986 1264 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
FANCAO15360 AC008808.1-201ENST00000508923 432 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
FANCAO15360 AC136475.5-202ENST00000524824 587 ntTSL 4 BASIC24.9■■□□□ 1.58
FANCAO15360 RARRES2P5-201ENST00000564013 466 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
FANCAO15360 YIF1B-214ENST00000591784 940 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
FANCAO15360 AC010336.6-201ENST00000595107 528 ntTSL 4 BASIC24.9■■□□□ 1.58
FANCAO15360 BTNL10-201ENST00000595971 695 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
FANCAO15360 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
FANCAO15360 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
FANCAO15360 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
FANCAO15360 AC092143.3-201ENST00000565150 1900 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
FANCAO15360 PLEKHA8P1-201ENST00000256692 1839 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
FANCAO15360 NFIC-203ENST00000443272 1716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
FANCAO15360 C1QTNF1-208ENST00000580474 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
FANCAO15360 CTSB-219ENST00000530640 1389 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
FANCAO15360 AC093525.8-201ENST00000624099 1342 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
FANCAO15360 SNURF-201ENST00000338327 331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
FANCAO15360 AC099548.2-209ENST00000480264 625 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
FANCAO15360 AC007406.4-201ENST00000539568 765 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
FANCAO15360 AC087612.1-201ENST00000560238 658 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
FANCAO15360 ZSCAN30-208ENST00000592278 731 ntTSL 4 BASIC24.89■■□□□ 1.58
FANCAO15360 SNAP25-AS1-208ENST00000605592 556 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
FANCAO15360 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
FANCAO15360 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
FANCAO15360 PACS2-205ENST00000547217 2809 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
FANCAO15360 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
FANCAO15360 LINC01660-203ENST00000618517 1859 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
FANCAO15360 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
FANCAO15360 TUBG2-201ENST00000251412 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
FANCAO15360 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
FANCAO15360 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.1 ms