Protein–RNA interactions for Protein: C9JE40

PATL2, Protein PAT1 homolog 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 543 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PATL2C9JE40 AMACR-204ENST00000382085 1195 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PATL2C9JE40 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PATL2C9JE40 PLA2G16-203ENST00000415826 1099 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
PATL2C9JE40 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PATL2C9JE40 AL391256.1-201ENST00000443260 1855 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
PATL2C9JE40 AKR1A1-204ENST00000471651 1018 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PATL2C9JE40 NECAP2-208ENST00000504551 768 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
PATL2C9JE40 PC-204ENST00000524491 1714 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
PATL2C9JE40 AP002490.2-201ENST00000524791 560 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
PATL2C9JE40 KRT73-AS1-202ENST00000551089 563 ntTSL 4 BASIC20.06■□□□□ 0.8
PATL2C9JE40 AC005829.1-201ENST00000570002 483 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
PATL2C9JE40 AC040963.1-202ENST00000589729 644 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
PATL2C9JE40 PLA2G16-206ENST00000639271 957 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
PATL2C9JE40 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
PATL2C9JE40 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
PATL2C9JE40 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PATL2C9JE40 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
PATL2C9JE40 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PATL2C9JE40 PPA2-201ENST00000341695 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PATL2C9JE40 PRR22-202ENST00000419421 1392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
PATL2C9JE40 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PATL2C9JE40 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PATL2C9JE40 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PATL2C9JE40 ARHGEF40-201ENST00000298694 5919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
PATL2C9JE40 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PATL2C9JE40 GYG1-201ENST00000296048 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PATL2C9JE40 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
PATL2C9JE40 RPS6KB1-203ENST00000406116 1982 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PATL2C9JE40 CORO6-202ENST00000388767 2397 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
PATL2C9JE40 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PATL2C9JE40 NRN1L-201ENST00000339176 710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PATL2C9JE40 TRA2B-202ENST00000342294 288 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PATL2C9JE40 EXOSC8-202ENST00000389704 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PATL2C9JE40 JMJD7-203ENST00000408047 1192 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
PATL2C9JE40 COA5-202ENST00000409997 557 ntTSL 4 BASIC20.05■□□□□ 0.8
PATL2C9JE40 AL354836.1-201ENST00000414042 681 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
PATL2C9JE40 AP000695.1-201ENST00000429588 893 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
PATL2C9JE40 MKNK2P1-201ENST00000437526 628 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
PATL2C9JE40 AL669831.5-202ENST00000457084 566 ntTSL 4 BASIC20.05■□□□□ 0.8
PATL2C9JE40 EHMT1-216ENST00000493484 1182 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
PATL2C9JE40 MTRF1LP2-201ENST00000506027 1122 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
PATL2C9JE40 ACY1-212ENST00000635797 1294 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
PATL2C9JE40 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
PATL2C9JE40 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
PATL2C9JE40 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PATL2C9JE40 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
PATL2C9JE40 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PATL2C9JE40 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PATL2C9JE40 CETN1-201ENST00000327228 1758 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
PATL2C9JE40 PSMC3IP-204ENST00000587209 1381 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PATL2C9JE40 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
PATL2C9JE40 STK35-201ENST00000381482 6685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
PATL2C9JE40 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
PATL2C9JE40 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PATL2C9JE40 RDH13-202ENST00000396247 1987 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
PATL2C9JE40 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
PATL2C9JE40 PNRC1-202ENST00000354922 1345 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
PATL2C9JE40 ALDH3A1-212ENST00000494157 1572 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
PATL2C9JE40 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
PATL2C9JE40 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
PATL2C9JE40 GPS1-228ENST00000624957 1825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
PATL2C9JE40 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
PATL2C9JE40 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
PATL2C9JE40 COPS3-212ENST00000539941 1699 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
PATL2C9JE40 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
PATL2C9JE40 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
PATL2C9JE40 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
PATL2C9JE40 CLTA-201ENST00000242285 1152 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
PATL2C9JE40 C19orf70-201ENST00000309324 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
PATL2C9JE40 CD99L2-202ENST00000355149 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
PATL2C9JE40 HTR5BP-201ENST00000430851 1154 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
PATL2C9JE40 LINC01705-201ENST00000438158 562 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
PATL2C9JE40 SLFNL1-205ENST00000439569 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
PATL2C9JE40 ZNF773-202ENST00000593916 548 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
PATL2C9JE40 AC055717.3-201ENST00000622967 595 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
PATL2C9JE40 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
PATL2C9JE40 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
PATL2C9JE40 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
PATL2C9JE40 ZNF324-203ENST00000536459 5653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
PATL2C9JE40 NFATC2-206ENST00000609943 5690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
PATL2C9JE40 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
PATL2C9JE40 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
PATL2C9JE40 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
PATL2C9JE40 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
PATL2C9JE40 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PATL2C9JE40 ZNF57-201ENST00000306908 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PATL2C9JE40 ZNF57-205ENST00000614108 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
PATL2C9JE40 SFN-201ENST00000339276 1320 ntAPPRIS P1 BASIC20.03■□□□□ 0.8
PATL2C9JE40 NR1H3-204ENST00000407404 1330 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
PATL2C9JE40 TBX4-201ENST00000240335 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PATL2C9JE40 ASAH1-231ENST00000636577 2129 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
PATL2C9JE40 CBWD1-201ENST00000314367 1771 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PATL2C9JE40 SNX33P1-201ENST00000592116 1762 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
PATL2C9JE40 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PATL2C9JE40 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PATL2C9JE40 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PATL2C9JE40 LITAF-202ENST00000381810 1527 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
PATL2C9JE40 HOXB6-203ENST00000484302 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
PATL2C9JE40 ACSL4-201ENST00000340800 5333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
PATL2C9JE40 NDUFB2-AS1-201ENST00000465466 1648 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.1 ms