Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2E6

DTX4, E3 ubiquitin-protein ligase DTX4, humanhuman

Predictions only

Length 619 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DTX4Q9Y2E6 AC135050.2-203ENST00000529564 725 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
DTX4Q9Y2E6 CD63-210ENST00000550776 870 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
DTX4Q9Y2E6 L2HGDH-205ENST00000555423 841 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
DTX4Q9Y2E6 AC023355.1-201ENST00000560323 752 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
DTX4Q9Y2E6 AL513190.1-201ENST00000621254 727 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
DTX4Q9Y2E6 AC004877.2-201ENST00000623941 599 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
DTX4Q9Y2E6 PLA2G16-206ENST00000639271 957 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
DTX4Q9Y2E6 AC092865.6-201ENST00000642101 219 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
DTX4Q9Y2E6 HLA-A-202ENST00000376806 1854 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
DTX4Q9Y2E6 CDKN1A-201ENST00000244741 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
DTX4Q9Y2E6 ANKRD23-203ENST00000418232 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
DTX4Q9Y2E6 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
DTX4Q9Y2E6 CKMT2-202ENST00000424301 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
DTX4Q9Y2E6 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
DTX4Q9Y2E6 ABTB1-201ENST00000232744 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
DTX4Q9Y2E6 RAD1-208ENST00000628399 1678 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
DTX4Q9Y2E6 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
DTX4Q9Y2E6 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
DTX4Q9Y2E6 CCDC120-203ENST00000536628 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
DTX4Q9Y2E6 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
DTX4Q9Y2E6 ADRA1A-202ENST00000354550 1765 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
DTX4Q9Y2E6 ADGRG3-202ENST00000450388 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
DTX4Q9Y2E6 TMC4-209ENST00000617472 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
DTX4Q9Y2E6 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
DTX4Q9Y2E6 UBE2G1-204ENST00000572484 1514 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
DTX4Q9Y2E6 AC073957.2-201ENST00000549241 1562 ntTSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
DTX4Q9Y2E6 THTPA-203ENST00000554789 1595 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
DTX4Q9Y2E6 SPRYD7-202ENST00000378195 3086 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
DTX4Q9Y2E6 MRNIP-201ENST00000292586 1238 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
DTX4Q9Y2E6 PIGU-202ENST00000374820 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
DTX4Q9Y2E6 AP000355.1-201ENST00000432032 480 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
DTX4Q9Y2E6 LINC00237-202ENST00000455890 1220 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
DTX4Q9Y2E6 AP000892.1-201ENST00000504906 488 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
DTX4Q9Y2E6 NMU-202ENST00000505262 693 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
DTX4Q9Y2E6 EFCAB1-209ENST00000523092 648 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
DTX4Q9Y2E6 AC002398.2-201ENST00000587767 660 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
DTX4Q9Y2E6 AC074135.2-201ENST00000600896 510 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
DTX4Q9Y2E6 AC097376.2-204ENST00000609359 627 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
DTX4Q9Y2E6 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
DTX4Q9Y2E6 C1QL3-202ENST00000619991 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
DTX4Q9Y2E6 CAND2-206ENST00000626378 333 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
DTX4Q9Y2E6 ACY1-212ENST00000635797 1294 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
DTX4Q9Y2E6 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
DTX4Q9Y2E6 C2orf81-206ENST00000640868 2407 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
DTX4Q9Y2E6 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
DTX4Q9Y2E6 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
DTX4Q9Y2E6 GLOD4-202ENST00000301329 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
DTX4Q9Y2E6 ACOT12-201ENST00000307624 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
DTX4Q9Y2E6 BCAR1-209ENST00000546196 1340 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
DTX4Q9Y2E6 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
DTX4Q9Y2E6 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
DTX4Q9Y2E6 DYRK1B-205ENST00000597639 1806 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
DTX4Q9Y2E6 BCAT2-209ENST00000599246 1449 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
DTX4Q9Y2E6 AC025580.3-201ENST00000617932 1424 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
DTX4Q9Y2E6 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
DTX4Q9Y2E6 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
DTX4Q9Y2E6 SSPN-201ENST00000242729 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
DTX4Q9Y2E6 TVP23C-201ENST00000225576 1527 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
DTX4Q9Y2E6 AC012569.1-201ENST00000591191 1524 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
DTX4Q9Y2E6 AC079328.2-201ENST00000561241 3354 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
DTX4Q9Y2E6 NFATC4-211ENST00000554344 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
DTX4Q9Y2E6 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
DTX4Q9Y2E6 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.09
DTX4Q9Y2E6 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
DTX4Q9Y2E6 AC226118.1-201ENST00000515213 2146 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
DTX4Q9Y2E6 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
DTX4Q9Y2E6 NDUFA3-201ENST00000303553 379 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
DTX4Q9Y2E6 THAP3-202ENST00000307896 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
DTX4Q9Y2E6 SELENOH-201ENST00000388857 833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
DTX4Q9Y2E6 HMGA1P7-201ENST00000406908 502 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
DTX4Q9Y2E6 AC023274.1-201ENST00000418278 595 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
DTX4Q9Y2E6 AL049612.1-201ENST00000427017 694 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
DTX4Q9Y2E6 RNF212-203ENST00000433731 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
DTX4Q9Y2E6 TMEM205-202ENST00000447337 916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
DTX4Q9Y2E6 PGAM5P1-201ENST00000518923 814 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
DTX4Q9Y2E6 KRT19P2-202ENST00000557173 1012 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
DTX4Q9Y2E6 AC087641.1-201ENST00000557561 1021 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
DTX4Q9Y2E6 MIR4515-201ENST00000584082 81 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
DTX4Q9Y2E6 AC040963.1-202ENST00000589729 644 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
DTX4Q9Y2E6 WT1-AS_2.1-201ENST00000613208 137 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
DTX4Q9Y2E6 FOXS1-201ENST00000375978 1319 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
DTX4Q9Y2E6 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
DTX4Q9Y2E6 TRPC6-202ENST00000348423 2448 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
DTX4Q9Y2E6 CLDN6-201ENST00000328796 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
DTX4Q9Y2E6 SERF2-203ENST00000381359 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
DTX4Q9Y2E6 CLDN14-204ENST00000399137 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
DTX4Q9Y2E6 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
DTX4Q9Y2E6 PIGT-207ENST00000543458 2037 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
DTX4Q9Y2E6 ZNF133-205ENST00000401790 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
DTX4Q9Y2E6 ZNF133-206ENST00000402618 2622 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
DTX4Q9Y2E6 PODNL1-204ENST00000538517 2744 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
DTX4Q9Y2E6 SEC23A-203ENST00000545328 2734 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
DTX4Q9Y2E6 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
DTX4Q9Y2E6 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
DTX4Q9Y2E6 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
DTX4Q9Y2E6 SENP1-204ENST00000549518 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
DTX4Q9Y2E6 TOM1-210ENST00000449058 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
DTX4Q9Y2E6 CHAD-201ENST00000258969 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
DTX4Q9Y2E6 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
DTX4Q9Y2E6 EWSAT1-206ENST00000558922 1725 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.9 ms