Protein–RNA interactions for Protein: Q9UMR7

CLEC4A, C-type lectin domain family 4 member A, humanhuman

Predictions only

Length 237 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLEC4AQ9UMR7 SLC1A6-208ENST00000598504 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CLEC4AQ9UMR7 RNF168-201ENST00000318037 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CLEC4AQ9UMR7 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CLEC4AQ9UMR7 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
CLEC4AQ9UMR7 AC126755.1-201ENST00000525846 6405 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
CLEC4AQ9UMR7 EIF4G1-202ENST00000346169 5516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CLEC4AQ9UMR7 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CLEC4AQ9UMR7 LINC02199-201ENST00000506655 2702 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
CLEC4AQ9UMR7 AQP10-203ENST00000484864 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CLEC4AQ9UMR7 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CLEC4AQ9UMR7 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CLEC4AQ9UMR7 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CLEC4AQ9UMR7 AL020989.1-201ENST00000422979 469 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
CLEC4AQ9UMR7 STK19B-204ENST00000512515 211 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
CLEC4AQ9UMR7 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
CLEC4AQ9UMR7 MSRA-206ENST00000521209 814 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CLEC4AQ9UMR7 OR7E14P-202ENST00000530490 1290 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
CLEC4AQ9UMR7 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CLEC4AQ9UMR7 GSTZ1-207ENST00000553586 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CLEC4AQ9UMR7 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CLEC4AQ9UMR7 LINC01197-204ENST00000611265 956 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CLEC4AQ9UMR7 SCN5A-214ENST00000612060 714 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CLEC4AQ9UMR7 ANO2-212ENST00000612575 1087 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CLEC4AQ9UMR7 MIR7706-201ENST00000613747 67 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
CLEC4AQ9UMR7 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CLEC4AQ9UMR7 PIGQ-201ENST00000026218 2846 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CLEC4AQ9UMR7 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CLEC4AQ9UMR7 STK17A-201ENST00000319357 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CLEC4AQ9UMR7 KCNT1-214ENST00000631073 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CLEC4AQ9UMR7 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CLEC4AQ9UMR7 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CLEC4AQ9UMR7 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CLEC4AQ9UMR7 CTSO-201ENST00000433477 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CLEC4AQ9UMR7 KIAA0368-201ENST00000259335 7391 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CLEC4AQ9UMR7 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CLEC4AQ9UMR7 RASAL3-201ENST00000343625 3293 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CLEC4AQ9UMR7 MIF4GD-204ENST00000577542 1531 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CLEC4AQ9UMR7 MAPK8IP2-202ENST00000329492 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CLEC4AQ9UMR7 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CLEC4AQ9UMR7 NPRL3-201ENST00000399953 2784 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CLEC4AQ9UMR7 MAP2K7-202ENST00000397981 3430 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CLEC4AQ9UMR7 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CLEC4AQ9UMR7 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CLEC4AQ9UMR7 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CLEC4AQ9UMR7 BCAR1-206ENST00000535626 2894 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CLEC4AQ9UMR7 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CLEC4AQ9UMR7 MICALL2-201ENST00000297508 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CLEC4AQ9UMR7 GMPPB-201ENST00000308375 3217 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CLEC4AQ9UMR7 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CLEC4AQ9UMR7 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CLEC4AQ9UMR7 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CLEC4AQ9UMR7 FAM99B-201ENST00000382166 1067 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CLEC4AQ9UMR7 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CLEC4AQ9UMR7 CENPM-203ENST00000402338 1002 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CLEC4AQ9UMR7 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CLEC4AQ9UMR7 AL590627.1-203ENST00000421194 1026 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
CLEC4AQ9UMR7 AGGF1P2-201ENST00000426656 2106 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
CLEC4AQ9UMR7 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
CLEC4AQ9UMR7 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CLEC4AQ9UMR7 NDUFB2-209ENST00000472695 503 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CLEC4AQ9UMR7 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CLEC4AQ9UMR7 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CLEC4AQ9UMR7 AC093909.1-201ENST00000504731 1122 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
CLEC4AQ9UMR7 FAU-209ENST00000531743 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CLEC4AQ9UMR7 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CLEC4AQ9UMR7 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CLEC4AQ9UMR7 AC120114.3-201ENST00000611923 658 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
CLEC4AQ9UMR7 AC243547.2-201ENST00000616257 234 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CLEC4AQ9UMR7 TSPY4-205ENST00000640033 663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CLEC4AQ9UMR7 AL022326.1-202ENST00000641533 845 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
CLEC4AQ9UMR7 FGFR4-201ENST00000292408 3122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CLEC4AQ9UMR7 SCUBE2-207ENST00000520467 3148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CLEC4AQ9UMR7 MTA2-204ENST00000527204 2265 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CLEC4AQ9UMR7 FBN1-205ENST00000560355 4109 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CLEC4AQ9UMR7 ZNF425-201ENST00000378061 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CLEC4AQ9UMR7 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CLEC4AQ9UMR7 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CLEC4AQ9UMR7 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CLEC4AQ9UMR7 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CLEC4AQ9UMR7 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CLEC4AQ9UMR7 TC2N-201ENST00000340892 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CLEC4AQ9UMR7 ZNF133-204ENST00000396026 2717 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CLEC4AQ9UMR7 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CLEC4AQ9UMR7 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CLEC4AQ9UMR7 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CLEC4AQ9UMR7 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CLEC4AQ9UMR7 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CLEC4AQ9UMR7 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CLEC4AQ9UMR7 PNKD-202ENST00000258362 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CLEC4AQ9UMR7 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CLEC4AQ9UMR7 CCNY-202ENST00000339497 4630 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CLEC4AQ9UMR7 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CLEC4AQ9UMR7 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CLEC4AQ9UMR7 ARHGEF16-202ENST00000378373 2211 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CLEC4AQ9UMR7 DFNA5-207ENST00000419307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CLEC4AQ9UMR7 GLS2-216ENST00000610413 2296 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CLEC4AQ9UMR7 ZNF687-201ENST00000324048 5378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CLEC4AQ9UMR7 SLC52A1-202ENST00000424747 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CLEC4AQ9UMR7 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CLEC4AQ9UMR7 DLG4-201ENST00000302955 3184 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 102 ms