Protein–RNA interactions for Protein: Q9UL40

ZNF346, Zinc finger protein 346, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 294 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF346Q9UL40 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ZNF346Q9UL40 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ZNF346Q9UL40 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ZNF346Q9UL40 MTDHP4-201ENST00000600287 670 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
ZNF346Q9UL40 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ZNF346Q9UL40 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ZNF346Q9UL40 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ZNF346Q9UL40 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ZNF346Q9UL40 PIGP-207ENST00000464265 3437 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ZNF346Q9UL40 NPY4R-202ENST00000612632 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ZNF346Q9UL40 NPY4R2-202ENST00000613306 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ZNF346Q9UL40 CICP6-201ENST00000457191 2729 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
ZNF346Q9UL40 TEX19-201ENST00000333437 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ZNF346Q9UL40 GALNT6-201ENST00000356317 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ZNF346Q9UL40 FTSJ1-202ENST00000348411 1892 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ZNF346Q9UL40 GPR158-AS1-201ENST00000449643 2433 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ZNF346Q9UL40 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ZNF346Q9UL40 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ZNF346Q9UL40 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ZNF346Q9UL40 IRF1-202ENST00000405885 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ZNF346Q9UL40 RUNX2-204ENST00000371438 5698 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ZNF346Q9UL40 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ZNF346Q9UL40 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ZNF346Q9UL40 BTBD11-205ENST00000490090 4614 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ZNF346Q9UL40 SCN3B-202ENST00000392770 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ZNF346Q9UL40 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ZNF346Q9UL40 CDS1-201ENST00000295887 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ZNF346Q9UL40 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ZNF346Q9UL40 DBI-201ENST00000311521 714 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ZNF346Q9UL40 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ZNF346Q9UL40 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ZNF346Q9UL40 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ZNF346Q9UL40 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
ZNF346Q9UL40 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ZNF346Q9UL40 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ZNF346Q9UL40 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ZNF346Q9UL40 H2AFJ-203ENST00000544848 644 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ZNF346Q9UL40 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ZNF346Q9UL40 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
ZNF346Q9UL40 COL23A1-202ENST00000407622 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ZNF346Q9UL40 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ZNF346Q9UL40 COPS3-212ENST00000539941 1699 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ZNF346Q9UL40 CBFB-201ENST00000290858 3136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ZNF346Q9UL40 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ZNF346Q9UL40 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ZNF346Q9UL40 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ZNF346Q9UL40 SLC29A1-202ENST00000371713 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ZNF346Q9UL40 NTRK2-206ENST00000376213 5560 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ZNF346Q9UL40 NAP1L4-222ENST00000620138 2479 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ZNF346Q9UL40 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ZNF346Q9UL40 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ZNF346Q9UL40 AC068831.1-204ENST00000501381 1621 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ZNF346Q9UL40 ALOX12P2-203ENST00000570921 1945 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
ZNF346Q9UL40 ASAP3-212ENST00000618240 2226 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ZNF346Q9UL40 SGO1-201ENST00000263753 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ZNF346Q9UL40 AL139300.1-201ENST00000472726 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ZNF346Q9UL40 SLC29A2-205ENST00000544554 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ZNF346Q9UL40 RFWD2-204ENST00000367669 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ZNF346Q9UL40 TRPC3-202ENST00000379645 3548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ZNF346Q9UL40 KDM6A-211ENST00000536777 5633 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ZNF346Q9UL40 RASAL3-201ENST00000343625 3293 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ZNF346Q9UL40 NFASC-205ENST00000403080 2462 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ZNF346Q9UL40 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ZNF346Q9UL40 PCDHGA11-202ENST00000518882 2263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ZNF346Q9UL40 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ZNF346Q9UL40 TAB1-202ENST00000331454 1660 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ZNF346Q9UL40 SSBP3-205ENST00000417664 1666 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ZNF346Q9UL40 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ZNF346Q9UL40 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ZNF346Q9UL40 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
ZNF346Q9UL40 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ZNF346Q9UL40 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ZNF346Q9UL40 OPN1LW-201ENST00000369951 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ZNF346Q9UL40 ITM2B-201ENST00000378549 805 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ZNF346Q9UL40 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ZNF346Q9UL40 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ZNF346Q9UL40 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ZNF346Q9UL40 VPS13A-AS1-201ENST00000415172 519 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ZNF346Q9UL40 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ZNF346Q9UL40 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
ZNF346Q9UL40 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ZNF346Q9UL40 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ZNF346Q9UL40 MSRA-206ENST00000521209 814 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ZNF346Q9UL40 AHSA1-208ENST00000555517 832 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ZNF346Q9UL40 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ZNF346Q9UL40 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ZNF346Q9UL40 RNF151-202ENST00000569210 853 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ZNF346Q9UL40 ARMC7-204ENST00000582136 1204 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ZNF346Q9UL40 AC004706.3-202ENST00000621574 984 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
ZNF346Q9UL40 NFATC4-208ENST00000553708 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ZNF346Q9UL40 SCAP-201ENST00000265565 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ZNF346Q9UL40 MOV10L1-201ENST00000262794 3960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ZNF346Q9UL40 CORO2B-201ENST00000261861 3569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ZNF346Q9UL40 DNM2-202ENST00000359692 3588 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ZNF346Q9UL40 CORO2B-204ENST00000566799 3566 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ZNF346Q9UL40 UAP1L1-202ENST00000409858 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ZNF346Q9UL40 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ZNF346Q9UL40 TMTC2-201ENST00000321196 5681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ZNF346Q9UL40 DGKE-204ENST00000572810 1843 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ZNF346Q9UL40 PIGT-221ENST00000638594 1835 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
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