Protein–RNA interactions for Protein: Q9UL19

RARRES3, Retinoic acid receptor responder protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 164 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RARRES3Q9UL19 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RARRES3Q9UL19 STARD3NL-204ENST00000434197 1341 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
RARRES3Q9UL19 TIMM50-220ENST00000607714 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RARRES3Q9UL19 GPR137-212ENST00000539851 1843 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
RARRES3Q9UL19 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RARRES3Q9UL19 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RARRES3Q9UL19 PYCR2-201ENST00000343818 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RARRES3Q9UL19 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
RARRES3Q9UL19 RRM2B-201ENST00000251810 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RARRES3Q9UL19 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RARRES3Q9UL19 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RARRES3Q9UL19 ANXA8-203ENST00000583874 1860 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RARRES3Q9UL19 TSSK3-201ENST00000373534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RARRES3Q9UL19 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RARRES3Q9UL19 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RARRES3Q9UL19 IL12RB1-201ENST00000322153 1902 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RARRES3Q9UL19 POLR2J4-203ENST00000326391 1422 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RARRES3Q9UL19 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RARRES3Q9UL19 DNAH14-206ENST00000400952 1984 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RARRES3Q9UL19 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RARRES3Q9UL19 CSNK1G2-AS1-201ENST00000314315 1252 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RARRES3Q9UL19 SLC2A8-201ENST00000373352 914 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RARRES3Q9UL19 SPDYE7P-202ENST00000420373 878 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
RARRES3Q9UL19 FAM8A3P-201ENST00000427218 844 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
RARRES3Q9UL19 GPS2P2-201ENST00000430745 888 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
RARRES3Q9UL19 AL513327.2-201ENST00000432703 490 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RARRES3Q9UL19 WDR53-204ENST00000433160 887 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RARRES3Q9UL19 SS18L2-202ENST00000447630 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RARRES3Q9UL19 KRT18P34-201ENST00000488218 1270 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
RARRES3Q9UL19 AC021744.1-201ENST00000518354 453 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RARRES3Q9UL19 SLC25A39P2-201ENST00000537614 270 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
RARRES3Q9UL19 AC244153.1-203ENST00000622796 419 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RARRES3Q9UL19 AC084121.4-201ENST00000641598 221 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
RARRES3Q9UL19 AF228730.8-201ENST00000642140 221 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
RARRES3Q9UL19 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RARRES3Q9UL19 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RARRES3Q9UL19 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RARRES3Q9UL19 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RARRES3Q9UL19 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RARRES3Q9UL19 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RARRES3Q9UL19 PUDP-203ENST00000424830 1334 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RARRES3Q9UL19 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RARRES3Q9UL19 YPEL3-203ENST00000562641 1941 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RARRES3Q9UL19 PDZD8-201ENST00000334464 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RARRES3Q9UL19 TRIM7-204ENST00000393319 2320 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RARRES3Q9UL19 BCL2L12-203ENST00000441864 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RARRES3Q9UL19 MARVELD3-204ENST00000565261 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RARRES3Q9UL19 GPX3-210ENST00000622181 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RARRES3Q9UL19 ETV3L-201ENST00000454449 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RARRES3Q9UL19 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RARRES3Q9UL19 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RARRES3Q9UL19 ZNF324-203ENST00000536459 5653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RARRES3Q9UL19 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RARRES3Q9UL19 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RARRES3Q9UL19 CNTNAP3-201ENST00000297668 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RARRES3Q9UL19 PLCB1-203ENST00000378641 7323 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RARRES3Q9UL19 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RARRES3Q9UL19 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RARRES3Q9UL19 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RARRES3Q9UL19 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RARRES3Q9UL19 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RARRES3Q9UL19 BVES-202ENST00000336775 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RARRES3Q9UL19 SCNN1A-205ENST00000396966 2336 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RARRES3Q9UL19 GBGT1-201ENST00000372036 871 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RARRES3Q9UL19 CEP19-201ENST00000399942 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RARRES3Q9UL19 PLA2G16-203ENST00000415826 1099 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RARRES3Q9UL19 TMEM191A-202ENST00000419950 663 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RARRES3Q9UL19 YAE1D1-202ENST00000432096 968 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RARRES3Q9UL19 ITGA9-AS1-209ENST00000450990 562 ntTSL 4 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RARRES3Q9UL19 IQSEC2-204ENST00000485377 835 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RARRES3Q9UL19 ASXL1-206ENST00000542461 1068 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RARRES3Q9UL19 WASHC3-213ENST00000545679 865 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RARRES3Q9UL19 AC026150.2-201ENST00000564693 1156 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
RARRES3Q9UL19 AP000842.3-202ENST00000569238 1080 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
RARRES3Q9UL19 MIR3197-201ENST00000582241 73 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
RARRES3Q9UL19 GMFG-207ENST00000598034 1028 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RARRES3Q9UL19 LINC02084-201ENST00000606069 1096 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
RARRES3Q9UL19 PLA2G16-206ENST00000639271 957 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RARRES3Q9UL19 AC020934.3-201ENST00000639810 348 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RARRES3Q9UL19 CLDN14-204ENST00000399137 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RARRES3Q9UL19 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
RARRES3Q9UL19 TUBB3P1-201ENST00000405796 1332 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
RARRES3Q9UL19 SNHG18-201ENST00000508179 1799 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RARRES3Q9UL19 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RARRES3Q9UL19 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RARRES3Q9UL19 MON2-203ENST00000546600 6130 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RARRES3Q9UL19 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RARRES3Q9UL19 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RARRES3Q9UL19 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RARRES3Q9UL19 ZFPL1-201ENST00000294258 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RARRES3Q9UL19 ALMS1P1-202ENST00000450720 1601 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RARRES3Q9UL19 ATP6AP2-225ENST00000637482 1648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RARRES3Q9UL19 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RARRES3Q9UL19 SMUG1-209ENST00000505128 2607 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RARRES3Q9UL19 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RARRES3Q9UL19 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RARRES3Q9UL19 SH2B1-206ENST00000545570 1488 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RARRES3Q9UL19 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RARRES3Q9UL19 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RARRES3Q9UL19 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.5 ms