Protein–RNA interactions for Protein: Q9UDT6

CLIP2, CAP-Gly domain-containing linker protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,046 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLIP2Q9UDT6 MED16-214ENST00000617672 554 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CLIP2Q9UDT6 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CLIP2Q9UDT6 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CLIP2Q9UDT6 CLDN7-201ENST00000360325 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CLIP2Q9UDT6 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CLIP2Q9UDT6 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CLIP2Q9UDT6 PNRC1-202ENST00000354922 1345 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CLIP2Q9UDT6 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CLIP2Q9UDT6 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CLIP2Q9UDT6 TDRKH-202ENST00000368823 2751 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CLIP2Q9UDT6 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CLIP2Q9UDT6 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CLIP2Q9UDT6 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CLIP2Q9UDT6 LSP1-217ENST00000612798 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CLIP2Q9UDT6 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CLIP2Q9UDT6 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CLIP2Q9UDT6 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CLIP2Q9UDT6 AC116353.5-201ENST00000638148 1699 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
CLIP2Q9UDT6 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CLIP2Q9UDT6 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CLIP2Q9UDT6 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CLIP2Q9UDT6 RUSC1-209ENST00000471876 1749 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CLIP2Q9UDT6 TSNARE1-205ENST00000520166 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CLIP2Q9UDT6 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CLIP2Q9UDT6 ENC1-207ENST00000618628 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CLIP2Q9UDT6 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CLIP2Q9UDT6 HLA-F-218ENST00000376861 1544 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CLIP2Q9UDT6 MOSPD3-201ENST00000223054 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CLIP2Q9UDT6 PFN4-201ENST00000313213 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CLIP2Q9UDT6 AC013270.1-201ENST00000425578 440 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CLIP2Q9UDT6 AC006042.2-201ENST00000428660 568 ntTSL 4 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CLIP2Q9UDT6 MKNK2P1-201ENST00000437526 628 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
CLIP2Q9UDT6 DNAJB3-202ENST00000449667 1266 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
CLIP2Q9UDT6 HOPX-214ENST00000556614 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CLIP2Q9UDT6 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CLIP2Q9UDT6 AP002449.1-201ENST00000588211 474 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CLIP2Q9UDT6 AC010776.2-201ENST00000588946 1081 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CLIP2Q9UDT6 REXO1L3P-201ENST00000622202 1288 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
CLIP2Q9UDT6 AC079781.4-201ENST00000641908 219 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
CLIP2Q9UDT6 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CLIP2Q9UDT6 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CLIP2Q9UDT6 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CLIP2Q9UDT6 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CLIP2Q9UDT6 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CLIP2Q9UDT6 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CLIP2Q9UDT6 SLC19A2-202ENST00000367804 2976 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CLIP2Q9UDT6 VGLL4-211ENST00000430365 1377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CLIP2Q9UDT6 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CLIP2Q9UDT6 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CLIP2Q9UDT6 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CLIP2Q9UDT6 LRRC71-201ENST00000337428 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CLIP2Q9UDT6 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CLIP2Q9UDT6 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CLIP2Q9UDT6 AL139384.1-201ENST00000612143 3047 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
CLIP2Q9UDT6 DPM2-201ENST00000314392 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CLIP2Q9UDT6 CCDC189-204ENST00000541260 1531 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CLIP2Q9UDT6 C6orf132-201ENST00000341865 6210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CLIP2Q9UDT6 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CLIP2Q9UDT6 ASTL-201ENST00000342380 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CLIP2Q9UDT6 AMACR-204ENST00000382085 1195 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CLIP2Q9UDT6 AFG3L1P-209ENST00000429663 458 ntTSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CLIP2Q9UDT6 FAM58CP-201ENST00000435741 640 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
CLIP2Q9UDT6 CEND1P1-201ENST00000451006 455 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
CLIP2Q9UDT6 CFL1-202ENST00000524553 860 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CLIP2Q9UDT6 DUSP6-204ENST00000547291 1074 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CLIP2Q9UDT6 AL031432.2-201ENST00000566714 459 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
CLIP2Q9UDT6 AL928711.1-201ENST00000570165 459 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
CLIP2Q9UDT6 AL596442.2-201ENST00000610240 980 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
CLIP2Q9UDT6 OPN5-206ENST00000638973 1090 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CLIP2Q9UDT6 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CLIP2Q9UDT6 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CLIP2Q9UDT6 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CLIP2Q9UDT6 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CLIP2Q9UDT6 CD244-202ENST00000368033 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CLIP2Q9UDT6 STPG3-AS1-201ENST00000612170 1701 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CLIP2Q9UDT6 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CLIP2Q9UDT6 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CLIP2Q9UDT6 PRRT2-205ENST00000567659 1470 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CLIP2Q9UDT6 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CLIP2Q9UDT6 WIZ-201ENST00000263381 5695 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CLIP2Q9UDT6 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CLIP2Q9UDT6 AL109955.1-201ENST00000417346 1540 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CLIP2Q9UDT6 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CLIP2Q9UDT6 ELL2P1-201ENST00000413990 1906 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
CLIP2Q9UDT6 MCF2L-208ENST00000397030 6580 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CLIP2Q9UDT6 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CLIP2Q9UDT6 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CLIP2Q9UDT6 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CLIP2Q9UDT6 AC092919.2-201ENST00000623631 1645 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
CLIP2Q9UDT6 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CLIP2Q9UDT6 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CLIP2Q9UDT6 PRLH-201ENST00000165524 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CLIP2Q9UDT6 STX10-201ENST00000242770 1099 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CLIP2Q9UDT6 SBSPON-201ENST00000297354 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CLIP2Q9UDT6 ATP23-201ENST00000300145 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CLIP2Q9UDT6 AL162231.1-204ENST00000423809 477 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CLIP2Q9UDT6 AL122058.1-202ENST00000426580 252 ntTSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CLIP2Q9UDT6 AL135791.1-201ENST00000429214 826 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CLIP2Q9UDT6 AC005281.1-201ENST00000433040 911 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CLIP2Q9UDT6 AKR1A1-204ENST00000471651 1018 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 76.7 ms