Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBQ0

VPS29, Vacuolar protein sorting-associated protein 29, humanhuman

Predictions only

Length 182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS29Q9UBQ0 DNAH14-205ENST00000366850 1103 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
VPS29Q9UBQ0 MIER1-205ENST00000371014 1728 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
VPS29Q9UBQ0 LYPLA2-204ENST00000374505 907 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
VPS29Q9UBQ0 TIMM17B-202ENST00000396779 1099 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
VPS29Q9UBQ0 TBC1D1-203ENST00000402522 1567 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
VPS29Q9UBQ0 BAALC-AS2-201ENST00000436771 496 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
VPS29Q9UBQ0 MOBP-208ENST00000441980 830 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC16.15■□□□□ 0.18
VPS29Q9UBQ0 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
VPS29Q9UBQ0 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
VPS29Q9UBQ0 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
VPS29Q9UBQ0 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
VPS29Q9UBQ0 BEND4-201ENST00000502486 8765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
VPS29Q9UBQ0 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
VPS29Q9UBQ0 AC073648.2-201ENST00000510116 352 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
VPS29Q9UBQ0 AC103957.2-201ENST00000521218 510 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
VPS29Q9UBQ0 AP001107.6-201ENST00000526655 516 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
VPS29Q9UBQ0 OR7E14P-202ENST00000530490 1290 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
VPS29Q9UBQ0 AL589182.1-202ENST00000548416 533 ntTSL 4 BASIC16.15■□□□□ 0.18
VPS29Q9UBQ0 AL121820.2-201ENST00000556301 279 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
VPS29Q9UBQ0 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
VPS29Q9UBQ0 CYGB-205ENST00000590175 830 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
VPS29Q9UBQ0 REXO1L3P-201ENST00000622202 1288 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
VPS29Q9UBQ0 AC092902.2-205ENST00000622381 394 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
VPS29Q9UBQ0 ATP6AP2-220ENST00000636970 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
VPS29Q9UBQ0 TCF3-212ENST00000588136 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
VPS29Q9UBQ0 MFSD1-202ENST00000392813 2244 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
VPS29Q9UBQ0 AC026412.1-202ENST00000512335 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
VPS29Q9UBQ0 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
VPS29Q9UBQ0 YPEL3-203ENST00000562641 1941 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
VPS29Q9UBQ0 EPHX1-206ENST00000614058 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
VPS29Q9UBQ0 GLMP-201ENST00000362007 1604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
VPS29Q9UBQ0 GHR-201ENST00000230882 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
VPS29Q9UBQ0 PARP9-204ENST00000471785 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
VPS29Q9UBQ0 SIGLEC7-201ENST00000305628 1469 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
VPS29Q9UBQ0 FHL1-207ENST00000394155 2706 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
VPS29Q9UBQ0 CRTC3-202ENST00000420329 5209 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
VPS29Q9UBQ0 SNX9-201ENST00000392185 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
VPS29Q9UBQ0 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
VPS29Q9UBQ0 SLC45A1-202ENST00000471889 2784 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
VPS29Q9UBQ0 EVC2-202ENST00000344408 4390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
VPS29Q9UBQ0 SLC43A3-203ENST00000395124 2617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
VPS29Q9UBQ0 WDR90-209ENST00000547944 1672 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.18
VPS29Q9UBQ0 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
VPS29Q9UBQ0 SLC22A12-205ENST00000473690 2522 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
VPS29Q9UBQ0 LINC00612-201ENST00000538094 2213 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
VPS29Q9UBQ0 CDC42BPG-201ENST00000342711 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
VPS29Q9UBQ0 ACOT12-201ENST00000307624 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
VPS29Q9UBQ0 BCAT2-209ENST00000599246 1449 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
VPS29Q9UBQ0 TLE3-212ENST00000558201 2766 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
VPS29Q9UBQ0 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
VPS29Q9UBQ0 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
VPS29Q9UBQ0 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
VPS29Q9UBQ0 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
VPS29Q9UBQ0 RPS2P1-201ENST00000434010 821 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
VPS29Q9UBQ0 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC16.14■□□□□ 0.17
VPS29Q9UBQ0 AC087386.1-201ENST00000553658 572 ntTSL 4 BASIC16.14■□□□□ 0.17
VPS29Q9UBQ0 MPDU1-223ENST00000582151 728 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
VPS29Q9UBQ0 AC018529.2-201ENST00000612024 828 ntTSL 4 BASIC16.14■□□□□ 0.17
VPS29Q9UBQ0 GGTLC5P-201ENST00000617623 998 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
VPS29Q9UBQ0 LAT2-204ENST00000398475 2453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
VPS29Q9UBQ0 CPEB2-AS1-201ENST00000500394 1630 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
VPS29Q9UBQ0 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
VPS29Q9UBQ0 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
VPS29Q9UBQ0 TMEM229B-201ENST00000357461 4068 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
VPS29Q9UBQ0 AIFM3-202ENST00000399167 2387 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
VPS29Q9UBQ0 AIFM3-207ENST00000440238 2368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
VPS29Q9UBQ0 LINC02370-201ENST00000428272 2009 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
VPS29Q9UBQ0 BICD1-205ENST00000550207 1328 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
VPS29Q9UBQ0 NAT9-210ENST00000580301 1860 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
VPS29Q9UBQ0 GPAT2-201ENST00000359548 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
VPS29Q9UBQ0 SYNDIG1L-202ENST00000554823 2420 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
VPS29Q9UBQ0 GABARAPL1-205ENST00000539170 1700 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
VPS29Q9UBQ0 PRDM5-202ENST00000394435 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
VPS29Q9UBQ0 IRF8-203ENST00000563180 1394 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
VPS29Q9UBQ0 PPEF2-207ENST00000621010 1797 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
VPS29Q9UBQ0 DMKN-209ENST00000429837 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
VPS29Q9UBQ0 PANX2-201ENST00000159647 2964 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
VPS29Q9UBQ0 HAGH-202ENST00000397356 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
VPS29Q9UBQ0 DDX42-208ENST00000578681 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
VPS29Q9UBQ0 MELTF-201ENST00000296350 3963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
VPS29Q9UBQ0 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
VPS29Q9UBQ0 PPIB-201ENST00000300026 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
VPS29Q9UBQ0 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
VPS29Q9UBQ0 POMC-203ENST00000395826 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
VPS29Q9UBQ0 KRT18P27-201ENST00000427733 1299 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
VPS29Q9UBQ0 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
VPS29Q9UBQ0 TXNRD2-212ENST00000485358 850 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
VPS29Q9UBQ0 RPS15P9-201ENST00000494093 319 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
VPS29Q9UBQ0 RNPS1P1-201ENST00000507437 918 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
VPS29Q9UBQ0 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
VPS29Q9UBQ0 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
VPS29Q9UBQ0 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
VPS29Q9UBQ0 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
VPS29Q9UBQ0 GPN3-202ENST00000537466 1491 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
VPS29Q9UBQ0 MBNL1-201ENST00000282486 6422 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
VPS29Q9UBQ0 MAGI3-203ENST00000369615 6508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
VPS29Q9UBQ0 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
VPS29Q9UBQ0 DAPK2-202ENST00000457488 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
VPS29Q9UBQ0 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
VPS29Q9UBQ0 ZFYVE19-203ENST00000355341 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.3 ms