Protein–RNA interactions for Protein: Q9NX52

RHBDL2, Rhomboid-related protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 303 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHBDL2Q9NX52 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RHBDL2Q9NX52 PDXP-202ENST00000403251 1571 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RHBDL2Q9NX52 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RHBDL2Q9NX52 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RHBDL2Q9NX52 CELF4-202ENST00000361795 1853 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RHBDL2Q9NX52 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RHBDL2Q9NX52 HSF5-201ENST00000323777 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RHBDL2Q9NX52 HEPACAM-201ENST00000298251 3602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RHBDL2Q9NX52 KRT77-201ENST00000341809 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RHBDL2Q9NX52 GGA1-206ENST00000406772 3205 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RHBDL2Q9NX52 C5orf24-204ENST00000504727 2923 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RHBDL2Q9NX52 CHRNB4-201ENST00000261751 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RHBDL2Q9NX52 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RHBDL2Q9NX52 TCP10-202ENST00000397829 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RHBDL2Q9NX52 BANK1-207ENST00000508653 2115 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RHBDL2Q9NX52 FAM46C-201ENST00000369448 5751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RHBDL2Q9NX52 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RHBDL2Q9NX52 ZNF516-201ENST00000443185 8118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RHBDL2Q9NX52 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RHBDL2Q9NX52 GSK3B-201ENST00000264235 7711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RHBDL2Q9NX52 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RHBDL2Q9NX52 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RHBDL2Q9NX52 AC009690.1-201ENST00000379915 4374 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RHBDL2Q9NX52 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RHBDL2Q9NX52 TIFA-201ENST00000361717 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RHBDL2Q9NX52 CDH23-201ENST00000224721 11139 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RHBDL2Q9NX52 CDH23-214ENST00000622827 11122 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RHBDL2Q9NX52 AC100803.3-201ENST00000606664 2961 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RHBDL2Q9NX52 SAPCD2-201ENST00000409687 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RHBDL2Q9NX52 PPP1R12A-AS1-201ENST00000552885 3234 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RHBDL2Q9NX52 DUS2-202ENST00000432752 1864 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RHBDL2Q9NX52 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RHBDL2Q9NX52 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RHBDL2Q9NX52 PCDHA7-201ENST00000356878 2922 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RHBDL2Q9NX52 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RHBDL2Q9NX52 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RHBDL2Q9NX52 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RHBDL2Q9NX52 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RHBDL2Q9NX52 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
RHBDL2Q9NX52 DPYSL4-201ENST00000338492 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RHBDL2Q9NX52 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RHBDL2Q9NX52 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RHBDL2Q9NX52 MYH6-202ENST00000405093 5941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RHBDL2Q9NX52 OSBPL3-201ENST00000313367 6760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RHBDL2Q9NX52 GUCA1A-203ENST00000394237 2233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RHBDL2Q9NX52 MSI1-201ENST00000257552 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RHBDL2Q9NX52 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RHBDL2Q9NX52 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RHBDL2Q9NX52 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RHBDL2Q9NX52 PIP5K1A-202ENST00000368888 2134 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RHBDL2Q9NX52 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RHBDL2Q9NX52 LINC00841-201ENST00000451929 2126 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RHBDL2Q9NX52 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RHBDL2Q9NX52 USP31-203ENST00000567975 2142 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RHBDL2Q9NX52 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RHBDL2Q9NX52 OR10AC1-201ENST00000439431 2898 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RHBDL2Q9NX52 AC097376.2-205ENST00000610159 5334 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
RHBDL2Q9NX52 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RHBDL2Q9NX52 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RHBDL2Q9NX52 WDR6-222ENST00000615452 1949 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RHBDL2Q9NX52 ESRP2-202ENST00000473183 3793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RHBDL2Q9NX52 ABCG1-203ENST00000361802 3034 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RHBDL2Q9NX52 TOR4A-201ENST00000357503 4148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RHBDL2Q9NX52 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RHBDL2Q9NX52 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RHBDL2Q9NX52 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RHBDL2Q9NX52 TP73-204ENST00000378280 2062 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RHBDL2Q9NX52 SH2D6-202ENST00000389938 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RHBDL2Q9NX52 STX18-AS1-207ENST00000610009 2406 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RHBDL2Q9NX52 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RHBDL2Q9NX52 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RHBDL2Q9NX52 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RHBDL2Q9NX52 CUL7-203ENST00000535468 5504 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RHBDL2Q9NX52 HGSNAT-207ENST00000521576 2332 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RHBDL2Q9NX52 AC112229.3-201ENST00000603767 3202 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RHBDL2Q9NX52 AC013271.1-201ENST00000640669 3202 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RHBDL2Q9NX52 KCP-203ENST00000610776 5108 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RHBDL2Q9NX52 ELFN2-207ENST00000613079 8360 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RHBDL2Q9NX52 AC006063.2-201ENST00000640161 1696 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RHBDL2Q9NX52 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RHBDL2Q9NX52 COL6A2-201ENST00000300527 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RHBDL2Q9NX52 IRAK1-204ENST00000393687 2049 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RHBDL2Q9NX52 HSD17B4-222ENST00000515320 2494 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RHBDL2Q9NX52 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RHBDL2Q9NX52 UBC-205ENST00000536769 3745 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RHBDL2Q9NX52 FSIP1-201ENST00000350221 2805 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RHBDL2Q9NX52 PIGS-203ENST00000395346 2815 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RHBDL2Q9NX52 HOXD3-202ENST00000410016 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RHBDL2Q9NX52 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
RHBDL2Q9NX52 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RHBDL2Q9NX52 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RHBDL2Q9NX52 SERPINE2-202ENST00000409304 2161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RHBDL2Q9NX52 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RHBDL2Q9NX52 BNIP2-201ENST00000267859 6325 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RHBDL2Q9NX52 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RHBDL2Q9NX52 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RHBDL2Q9NX52 RUNDC3B-203ENST00000394654 2064 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RHBDL2Q9NX52 ATXN7L1-207ENST00000477775 2426 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RHBDL2Q9NX52 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RHBDL2Q9NX52 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.4 ms