Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVI7

ATAD3A, ATPase family AAA domain-containing protein 3A, humanhuman

Predictions only

Length 634 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATAD3AQ9NVI7 C16orf89-201ENST00000315997 1872 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ATAD3AQ9NVI7 PCBP4-202ENST00000355852 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ATAD3AQ9NVI7 ACSM2A-213ENST00000575690 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ATAD3AQ9NVI7 BMP7-201ENST00000395863 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ATAD3AQ9NVI7 NSFL1C-202ENST00000353088 2611 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ATAD3AQ9NVI7 BNC1-201ENST00000345382 4610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ATAD3AQ9NVI7 DACT3-203ENST00000410105 3085 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ATAD3AQ9NVI7 AC063926.3-201ENST00000624734 5658 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
ATAD3AQ9NVI7 GPER1-204ENST00000401670 1542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ATAD3AQ9NVI7 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ATAD3AQ9NVI7 ALPI-201ENST00000295463 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ATAD3AQ9NVI7 BRF1-206ENST00000446501 2858 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ATAD3AQ9NVI7 ITPK1-210ENST00000556603 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ATAD3AQ9NVI7 KRT15-201ENST00000254043 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ATAD3AQ9NVI7 DRC3-201ENST00000313838 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ATAD3AQ9NVI7 GHRHR-205ENST00000409904 1613 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ATAD3AQ9NVI7 AC148477.5-201ENST00000625164 1645 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
ATAD3AQ9NVI7 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ATAD3AQ9NVI7 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ATAD3AQ9NVI7 PFKP-202ENST00000381075 2769 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ATAD3AQ9NVI7 TRIM7-204ENST00000393319 2320 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ATAD3AQ9NVI7 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ATAD3AQ9NVI7 QRFPR-202ENST00000394427 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ATAD3AQ9NVI7 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ATAD3AQ9NVI7 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ATAD3AQ9NVI7 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ATAD3AQ9NVI7 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ATAD3AQ9NVI7 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ATAD3AQ9NVI7 ELMO3-203ENST00000477898 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ATAD3AQ9NVI7 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ATAD3AQ9NVI7 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ATAD3AQ9NVI7 WNT7B-203ENST00000410058 714 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ATAD3AQ9NVI7 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ATAD3AQ9NVI7 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
ATAD3AQ9NVI7 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ATAD3AQ9NVI7 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ATAD3AQ9NVI7 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
ATAD3AQ9NVI7 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ATAD3AQ9NVI7 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ATAD3AQ9NVI7 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ATAD3AQ9NVI7 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ATAD3AQ9NVI7 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ATAD3AQ9NVI7 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ATAD3AQ9NVI7 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ATAD3AQ9NVI7 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
ATAD3AQ9NVI7 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ATAD3AQ9NVI7 AC078925.2-201ENST00000624013 1973 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
ATAD3AQ9NVI7 AC097637.2-201ENST00000624096 1997 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
ATAD3AQ9NVI7 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ATAD3AQ9NVI7 DDX42-208ENST00000578681 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ATAD3AQ9NVI7 PBX3-204ENST00000373489 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ATAD3AQ9NVI7 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ATAD3AQ9NVI7 HDAC11-214ENST00000446613 2875 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ATAD3AQ9NVI7 PPP1R3B-202ENST00000519699 2334 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ATAD3AQ9NVI7 ELP5-202ENST00000356683 2197 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ATAD3AQ9NVI7 AHRR-203ENST00000505113 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ATAD3AQ9NVI7 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ATAD3AQ9NVI7 JMJD4-206ENST00000615711 2591 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ATAD3AQ9NVI7 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ATAD3AQ9NVI7 KIAA0319L-201ENST00000325722 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ATAD3AQ9NVI7 ESM1-201ENST00000381403 1326 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ATAD3AQ9NVI7 DIO3OS-208ENST00000556120 2473 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ATAD3AQ9NVI7 COL2A1-202ENST00000380518 5071 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ATAD3AQ9NVI7 GDA-201ENST00000238018 2074 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ATAD3AQ9NVI7 ZNF232-201ENST00000250076 2179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ATAD3AQ9NVI7 ZMIZ1-205ENST00000611351 2196 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ATAD3AQ9NVI7 ARL6IP1-201ENST00000304414 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ATAD3AQ9NVI7 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ATAD3AQ9NVI7 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ATAD3AQ9NVI7 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ATAD3AQ9NVI7 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
ATAD3AQ9NVI7 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ATAD3AQ9NVI7 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ATAD3AQ9NVI7 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ATAD3AQ9NVI7 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ATAD3AQ9NVI7 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
ATAD3AQ9NVI7 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ATAD3AQ9NVI7 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
ATAD3AQ9NVI7 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ATAD3AQ9NVI7 AC073592.4-201ENST00000623827 446 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
ATAD3AQ9NVI7 FEZF1-AS1-202ENST00000428449 2653 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ATAD3AQ9NVI7 NFE2-202ENST00000435572 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ATAD3AQ9NVI7 TTC24-201ENST00000368236 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ATAD3AQ9NVI7 LHFPL2-207ENST00000515007 4680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ATAD3AQ9NVI7 IRX6-201ENST00000290552 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ATAD3AQ9NVI7 TRPC4AP-202ENST00000451813 3138 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ATAD3AQ9NVI7 AL021920.2-201ENST00000624828 1351 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
ATAD3AQ9NVI7 ZNF764-202ENST00000395091 2970 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ATAD3AQ9NVI7 SRPK1-204ENST00000373825 4592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ATAD3AQ9NVI7 ZSCAN2-214ENST00000546148 2242 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ATAD3AQ9NVI7 ADAMTS4-201ENST00000367995 1961 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ATAD3AQ9NVI7 SYNRG-222ENST00000614941 3406 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ATAD3AQ9NVI7 CLIP4-201ENST00000320081 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ATAD3AQ9NVI7 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ATAD3AQ9NVI7 EPB41-205ENST00000373797 2402 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ATAD3AQ9NVI7 TMEM184A-201ENST00000297477 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ATAD3AQ9NVI7 BEND4-203ENST00000611697 1348 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ATAD3AQ9NVI7 STK32C-204ENST00000368622 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ATAD3AQ9NVI7 DPY19L2P4-202ENST00000497063 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ATAD3AQ9NVI7 AC023824.1-201ENST00000562945 2975 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.2 ms