Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSE7

ABCC13, Putative ATP-binding cassette sub-family C member 13, humanhuman

Predictions only

Length 274 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCC13Q9NSE7 SPDYE2B-201ENST00000436228 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ABCC13Q9NSE7 CEND1P1-201ENST00000451006 455 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
ABCC13Q9NSE7 SPDYE5-201ENST00000455862 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ABCC13Q9NSE7 NT5C3B-215ENST00000521789 993 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ABCC13Q9NSE7 UBXN1-210ENST00000529640 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ABCC13Q9NSE7 GSTO1-207ENST00000539281 1052 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ABCC13Q9NSE7 MIR4469-201ENST00000583919 79 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
ABCC13Q9NSE7 AC010618.3-201ENST00000596643 775 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ABCC13Q9NSE7 AC021097.1-201ENST00000607902 574 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
ABCC13Q9NSE7 AC006538.3-201ENST00000612495 578 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
ABCC13Q9NSE7 LINC00623-201ENST00000613486 486 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ABCC13Q9NSE7 AFF2-204ENST00000370458 1488 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ABCC13Q9NSE7 LINC02167-203ENST00000566900 1489 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ABCC13Q9NSE7 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ABCC13Q9NSE7 PAAF1-205ENST00000535604 1695 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ABCC13Q9NSE7 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ABCC13Q9NSE7 CDKN1A-201ENST00000244741 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ABCC13Q9NSE7 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ABCC13Q9NSE7 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ABCC13Q9NSE7 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ABCC13Q9NSE7 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ABCC13Q9NSE7 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ABCC13Q9NSE7 AL671710.1-201ENST00000610245 2349 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
ABCC13Q9NSE7 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ABCC13Q9NSE7 FLYWCH1-203ENST00000416288 4963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ABCC13Q9NSE7 MAGEF1-201ENST00000317897 1636 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ABCC13Q9NSE7 TVP23C-201ENST00000225576 1527 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ABCC13Q9NSE7 GMPPA-202ENST00000341142 1524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ABCC13Q9NSE7 RPS5-202ENST00000596046 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ABCC13Q9NSE7 BSCL2-210ENST00000421906 1440 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ABCC13Q9NSE7 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
ABCC13Q9NSE7 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ABCC13Q9NSE7 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ABCC13Q9NSE7 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ABCC13Q9NSE7 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC17.46■□□□□ 0.39
ABCC13Q9NSE7 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ABCC13Q9NSE7 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ABCC13Q9NSE7 PHGDH-202ENST00000369409 1882 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ABCC13Q9NSE7 SNX33P1-201ENST00000592116 1762 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
ABCC13Q9NSE7 FAM53C-202ENST00000434981 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ABCC13Q9NSE7 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
ABCC13Q9NSE7 VWA1-203ENST00000476993 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ABCC13Q9NSE7 ICAM4-203ENST00000393717 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
ABCC13Q9NSE7 KLK5-203ENST00000593428 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ABCC13Q9NSE7 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ABCC13Q9NSE7 MRGPRD-201ENST00000309106 966 ntAPPRIS P1 BASIC17.46■□□□□ 0.39
ABCC13Q9NSE7 RPS17-201ENST00000330244 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ABCC13Q9NSE7 BAX-203ENST00000354470 433 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ABCC13Q9NSE7 PDLIM7-201ENST00000355572 977 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ABCC13Q9NSE7 MRPL9-202ENST00000368830 1296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ABCC13Q9NSE7 AC211486.1-202ENST00000416371 468 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
ABCC13Q9NSE7 APCDD1L-AS1-201ENST00000420279 555 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
ABCC13Q9NSE7 AFG3L1P-209ENST00000429663 458 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
ABCC13Q9NSE7 AL160408.2-201ENST00000436039 693 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
ABCC13Q9NSE7 AKIRIN1-203ENST00000446189 1243 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
ABCC13Q9NSE7 AC211476.1-201ENST00000503899 468 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
ABCC13Q9NSE7 HILS1-201ENST00000504307 1219 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ABCC13Q9NSE7 FAM177A1-207ENST00000554052 540 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
ABCC13Q9NSE7 PMF1-BGLAP-204ENST00000567140 655 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
ABCC13Q9NSE7 AC009630.3-201ENST00000581909 729 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
ABCC13Q9NSE7 FXYD1-208ENST00000589209 428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
ABCC13Q9NSE7 AC099522.2-201ENST00000607001 744 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
ABCC13Q9NSE7 FXYD1-211ENST00000612146 690 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
ABCC13Q9NSE7 AC139530.3-201ENST00000620344 690 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
ABCC13Q9NSE7 AC055717.3-201ENST00000622967 595 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
ABCC13Q9NSE7 AC104581.1-203ENST00000640240 353 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
ABCC13Q9NSE7 WLS-202ENST00000354777 2037 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ABCC13Q9NSE7 ITPRIPL1-205ENST00000536814 1947 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
ABCC13Q9NSE7 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
ABCC13Q9NSE7 ATP6AP2-225ENST00000637482 1648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
ABCC13Q9NSE7 MCF2L-203ENST00000375604 6445 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
ABCC13Q9NSE7 GOSR1-201ENST00000225724 6039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ABCC13Q9NSE7 SPSB1-202ENST00000357898 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
ABCC13Q9NSE7 NTNG1-203ENST00000370066 1443 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ABCC13Q9NSE7 COQ10A-202ENST00000433805 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ABCC13Q9NSE7 FTSJ1-202ENST00000348411 1892 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
ABCC13Q9NSE7 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.38
ABCC13Q9NSE7 RHD-207ENST00000454452 1303 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
ABCC13Q9NSE7 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
ABCC13Q9NSE7 PSMA8-202ENST00000343848 1675 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ABCC13Q9NSE7 RAB7A-203ENST00000482525 1589 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ABCC13Q9NSE7 IGSF11-209ENST00000491903 1487 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
ABCC13Q9NSE7 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ABCC13Q9NSE7 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ABCC13Q9NSE7 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
ABCC13Q9NSE7 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ABCC13Q9NSE7 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ABCC13Q9NSE7 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ABCC13Q9NSE7 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ABCC13Q9NSE7 GALNT9-202ENST00000397325 1727 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ABCC13Q9NSE7 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ABCC13Q9NSE7 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ABCC13Q9NSE7 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ABCC13Q9NSE7 TRAPPC1-201ENST00000303731 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ABCC13Q9NSE7 ANAPC11-201ENST00000344877 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ABCC13Q9NSE7 GPX7-201ENST00000361314 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ABCC13Q9NSE7 SNHG5-201ENST00000369605 1032 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ABCC13Q9NSE7 AL162231.1-204ENST00000423809 477 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
ABCC13Q9NSE7 CCND3-213ENST00000510503 1257 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
ABCC13Q9NSE7 CTBP1-AS2-204ENST00000514984 533 ntTSL 4 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.6 ms