Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPB9

ACKR4, Atypical chemokine receptor 4, humanhuman

Predictions only

Length 350 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACKR4Q9NPB9 CLDN7-201ENST00000360325 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ACKR4Q9NPB9 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ACKR4Q9NPB9 SBSPON-201ENST00000297354 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ACKR4Q9NPB9 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ACKR4Q9NPB9 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ACKR4Q9NPB9 ELL2P1-201ENST00000413990 1906 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
ACKR4Q9NPB9 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ACKR4Q9NPB9 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ACKR4Q9NPB9 DDHD1-202ENST00000357758 5603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ACKR4Q9NPB9 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ACKR4Q9NPB9 AL391005.1-201ENST00000623953 2435 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
ACKR4Q9NPB9 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ACKR4Q9NPB9 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ACKR4Q9NPB9 JPT1-209ENST00000482348 1614 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ACKR4Q9NPB9 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
ACKR4Q9NPB9 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ACKR4Q9NPB9 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ACKR4Q9NPB9 AL512625.1-201ENST00000305709 2541 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ACKR4Q9NPB9 MAP3K9-206ENST00000555993 4449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ACKR4Q9NPB9 MOSPD3-201ENST00000223054 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ACKR4Q9NPB9 NEK7-201ENST00000367383 586 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ACKR4Q9NPB9 YWHAZ-203ENST00000395951 964 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ACKR4Q9NPB9 DDT-204ENST00000404092 805 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ACKR4Q9NPB9 APCDD1L-AS1-201ENST00000420279 555 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ACKR4Q9NPB9 AFG3L1P-209ENST00000429663 458 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ACKR4Q9NPB9 AKIRIN1-203ENST00000446189 1243 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ACKR4Q9NPB9 TMEM205-202ENST00000447337 916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ACKR4Q9NPB9 RNASET2-206ENST00000476238 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ACKR4Q9NPB9 MRFAP1-203ENST00000507420 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ACKR4Q9NPB9 TMEM33-208ENST00000513702 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ACKR4Q9NPB9 DUSP6-204ENST00000547291 1074 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ACKR4Q9NPB9 RPL28-209ENST00000560055 670 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ACKR4Q9NPB9 AC005412.3-201ENST00000580309 715 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
ACKR4Q9NPB9 MIR4469-201ENST00000583919 79 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
ACKR4Q9NPB9 AC010618.3-201ENST00000596643 775 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ACKR4Q9NPB9 AC002985.2-201ENST00000601106 957 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ACKR4Q9NPB9 AC068137.2-201ENST00000605408 478 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
ACKR4Q9NPB9 BSG-214ENST00000614867 960 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ACKR4Q9NPB9 RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 4931 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ACKR4Q9NPB9 LMNA-202ENST00000361308 1713 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ACKR4Q9NPB9 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ACKR4Q9NPB9 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ACKR4Q9NPB9 CDIPT-209ENST00000569956 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ACKR4Q9NPB9 MDGA1-203ENST00000434837 10736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ACKR4Q9NPB9 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ACKR4Q9NPB9 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
ACKR4Q9NPB9 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ACKR4Q9NPB9 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ACKR4Q9NPB9 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ACKR4Q9NPB9 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ACKR4Q9NPB9 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ACKR4Q9NPB9 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ACKR4Q9NPB9 ZBTB5-201ENST00000307750 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ACKR4Q9NPB9 STPG3-AS1-201ENST00000612170 1701 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ACKR4Q9NPB9 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ACKR4Q9NPB9 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ACKR4Q9NPB9 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ACKR4Q9NPB9 ADRA1A-202ENST00000354550 1765 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ACKR4Q9NPB9 ESR2-201ENST00000267525 1518 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ACKR4Q9NPB9 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ACKR4Q9NPB9 GPRC5C-201ENST00000342648 1273 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ACKR4Q9NPB9 SLC25A1P3-201ENST00000395415 828 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
ACKR4Q9NPB9 FALEC-201ENST00000416894 566 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ACKR4Q9NPB9 AC254562.1-201ENST00000417586 456 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
ACKR4Q9NPB9 URGCP-206ENST00000446958 365 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ACKR4Q9NPB9 AC026191.1-201ENST00000491930 829 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ACKR4Q9NPB9 NMU-203ENST00000507338 658 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ACKR4Q9NPB9 SFTPC-204ENST00000520605 519 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ACKR4Q9NPB9 SFTPC-210ENST00000524255 681 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ACKR4Q9NPB9 AL031432.2-201ENST00000566714 459 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
ACKR4Q9NPB9 AL928711.1-201ENST00000570165 459 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
ACKR4Q9NPB9 MIR4515-201ENST00000584082 81 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
ACKR4Q9NPB9 AP002449.1-201ENST00000588211 474 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ACKR4Q9NPB9 ZNF773-202ENST00000593916 548 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ACKR4Q9NPB9 AC008761.1-201ENST00000595363 217 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ACKR4Q9NPB9 PGPEP1-209ENST00000604499 769 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ACKR4Q9NPB9 TBC1D2-205ENST00000465784 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ACKR4Q9NPB9 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ACKR4Q9NPB9 NOX4-207ENST00000525196 1555 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ACKR4Q9NPB9 C2orf27A-205ENST00000624391 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ACKR4Q9NPB9 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ACKR4Q9NPB9 XKR7-201ENST00000562532 7844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ACKR4Q9NPB9 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ACKR4Q9NPB9 MAP4K3-201ENST00000263881 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ACKR4Q9NPB9 CRAMP1-201ENST00000293925 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ACKR4Q9NPB9 B4GALNT2-201ENST00000300404 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ACKR4Q9NPB9 PRR22-202ENST00000419421 1392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ACKR4Q9NPB9 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ACKR4Q9NPB9 CHEK1-202ENST00000427383 1670 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ACKR4Q9NPB9 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ACKR4Q9NPB9 C5orf24-202ENST00000394976 5065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ACKR4Q9NPB9 TLL1-204ENST00000507499 4818 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ACKR4Q9NPB9 AC087289.2-201ENST00000587267 1419 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ACKR4Q9NPB9 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ACKR4Q9NPB9 NR4A2-203ENST00000409108 1735 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ACKR4Q9NPB9 PCDHGA12-202ENST00000613314 2634 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ACKR4Q9NPB9 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ACKR4Q9NPB9 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ACKR4Q9NPB9 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ACKR4Q9NPB9 DPM2-201ENST00000314392 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34 ms