Protein–RNA interactions for Protein: Q96S82

UBL7, Ubiquitin-like protein 7, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 380 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBL7Q96S82 PRF1-203ENST00000638674 1080 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
UBL7Q96S82 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
UBL7Q96S82 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
UBL7Q96S82 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
UBL7Q96S82 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
UBL7Q96S82 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
UBL7Q96S82 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
UBL7Q96S82 MAGI3-201ENST00000307546 6430 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
UBL7Q96S82 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
UBL7Q96S82 IQCE-204ENST00000404984 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
UBL7Q96S82 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
UBL7Q96S82 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
UBL7Q96S82 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
UBL7Q96S82 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
UBL7Q96S82 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
UBL7Q96S82 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
UBL7Q96S82 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
UBL7Q96S82 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
UBL7Q96S82 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
UBL7Q96S82 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
UBL7Q96S82 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
UBL7Q96S82 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
UBL7Q96S82 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
UBL7Q96S82 DPM2-201ENST00000314392 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
UBL7Q96S82 CD40-207ENST00000620709 1522 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
UBL7Q96S82 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
UBL7Q96S82 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
UBL7Q96S82 ZDHHC4-203ENST00000396707 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
UBL7Q96S82 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
UBL7Q96S82 GMNN-201ENST00000230056 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
UBL7Q96S82 CLPP-201ENST00000245816 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
UBL7Q96S82 VHLL-201ENST00000339922 676 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
UBL7Q96S82 CGB3-201ENST00000357383 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
UBL7Q96S82 CGB2-201ENST00000359342 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
UBL7Q96S82 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
UBL7Q96S82 PTCHD3P3-201ENST00000403073 906 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
UBL7Q96S82 AL355306.1-201ENST00000415580 579 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
UBL7Q96S82 TMEM191A-202ENST00000419950 663 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
UBL7Q96S82 Z97056.1-201ENST00000433230 556 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
UBL7Q96S82 CTBP1-AS2-204ENST00000514984 533 ntTSL 4 BASIC16.05■□□□□ 0.16
UBL7Q96S82 GALNT9-208ENST00000541995 1001 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
UBL7Q96S82 KLK6-204ENST00000594641 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
UBL7Q96S82 AC092070.4-201ENST00000599803 507 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
UBL7Q96S82 AC004832.1-201ENST00000610936 1005 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
UBL7Q96S82 SRP9-204ENST00000619790 377 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
UBL7Q96S82 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
UBL7Q96S82 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
UBL7Q96S82 ADAD1-203ENST00000388725 1918 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
UBL7Q96S82 ADAM10-205ENST00000461408 1932 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
UBL7Q96S82 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
UBL7Q96S82 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
UBL7Q96S82 PRR18-201ENST00000322583 3084 ntAPPRIS P2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
UBL7Q96S82 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
UBL7Q96S82 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
UBL7Q96S82 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
UBL7Q96S82 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
UBL7Q96S82 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
UBL7Q96S82 SNX19-207ENST00000528555 1506 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
UBL7Q96S82 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
UBL7Q96S82 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
UBL7Q96S82 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
UBL7Q96S82 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
UBL7Q96S82 DMKN-209ENST00000429837 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
UBL7Q96S82 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
UBL7Q96S82 CNTRL-208ENST00000373865 1917 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
UBL7Q96S82 CREB3L3-204ENST00000602147 1382 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
UBL7Q96S82 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
UBL7Q96S82 TEX12-201ENST00000280358 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
UBL7Q96S82 TOMM5-201ENST00000321301 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
UBL7Q96S82 NAA10-201ENST00000370009 837 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
UBL7Q96S82 NAA10-203ENST00000370015 1002 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
UBL7Q96S82 SELENOH-201ENST00000388857 833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
UBL7Q96S82 AL671277.1-201ENST00000429656 993 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
UBL7Q96S82 TTC31-205ENST00000442235 958 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
UBL7Q96S82 AL807752.3-201ENST00000456356 748 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
UBL7Q96S82 RN7SL589P-201ENST00000481268 310 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
UBL7Q96S82 LINC01184-209ENST00000514573 609 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
UBL7Q96S82 AC090607.3-202ENST00000558971 383 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
UBL7Q96S82 PSME1-205ENST00000559123 1033 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
UBL7Q96S82 AC009118.2-201ENST00000613275 655 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
UBL7Q96S82 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
UBL7Q96S82 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
UBL7Q96S82 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
UBL7Q96S82 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
UBL7Q96S82 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
UBL7Q96S82 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
UBL7Q96S82 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
UBL7Q96S82 GULP1-209ENST00000410051 1595 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
UBL7Q96S82 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
UBL7Q96S82 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
UBL7Q96S82 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
UBL7Q96S82 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
UBL7Q96S82 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
UBL7Q96S82 BIRC7-201ENST00000217169 1368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
UBL7Q96S82 ICAM4-203ENST00000393717 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
UBL7Q96S82 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
UBL7Q96S82 CGREF1-206ENST00000405600 1346 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
UBL7Q96S82 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
UBL7Q96S82 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
UBL7Q96S82 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.7 ms