Protein–RNA interactions for Protein: Q96QE5

TEFM, Transcription elongation factor, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 360 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TEFMQ96QE5 PHYH-202ENST00000396913 1732 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TEFMQ96QE5 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TEFMQ96QE5 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TEFMQ96QE5 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TEFMQ96QE5 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TEFMQ96QE5 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TEFMQ96QE5 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TEFMQ96QE5 FMO5-208ENST00000578284 1784 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TEFMQ96QE5 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TEFMQ96QE5 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TEFMQ96QE5 AC092053.1-201ENST00000605787 1936 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
TEFMQ96QE5 BTBD11-205ENST00000490090 4614 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TEFMQ96QE5 ZFP64-205ENST00000371518 1841 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TEFMQ96QE5 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TEFMQ96QE5 CKLF-204ENST00000362093 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TEFMQ96QE5 PON3-203ENST00000427422 894 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TEFMQ96QE5 MLF1-210ENST00000484955 1247 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TEFMQ96QE5 AC068594.1-203ENST00000581153 695 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TEFMQ96QE5 TRIM29-221ENST00000627238 510 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TEFMQ96QE5 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TEFMQ96QE5 CNTLN-202ENST00000380647 5576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TEFMQ96QE5 EGFEM1P-202ENST00000431685 1563 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
TEFMQ96QE5 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TEFMQ96QE5 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TEFMQ96QE5 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TEFMQ96QE5 NEO1-202ENST00000339362 7342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TEFMQ96QE5 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
TEFMQ96QE5 GAS7-203ENST00000432992 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TEFMQ96QE5 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TEFMQ96QE5 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TEFMQ96QE5 HDAC10-205ENST00000448072 2133 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TEFMQ96QE5 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TEFMQ96QE5 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TEFMQ96QE5 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TEFMQ96QE5 PTCH1-201ENST00000331920 8057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TEFMQ96QE5 TUSC3-204ENST00000506802 1546 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TEFMQ96QE5 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TEFMQ96QE5 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
TEFMQ96QE5 FAM184B-201ENST00000265018 6622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TEFMQ96QE5 BCL11B-202ENST00000357195 7559 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TEFMQ96QE5 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TEFMQ96QE5 AC087289.2-201ENST00000587267 1419 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TEFMQ96QE5 ARMC12-201ENST00000288065 1169 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TEFMQ96QE5 ATP23-201ENST00000300145 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TEFMQ96QE5 AC005020.2-201ENST00000455905 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TEFMQ96QE5 CXCL1P1-201ENST00000502804 216 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
TEFMQ96QE5 FGFR1OP2-206ENST00000546072 956 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TEFMQ96QE5 OR7E47P-204ENST00000575924 449 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
TEFMQ96QE5 AC024592.3-202ENST00000586349 506 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TEFMQ96QE5 MRPL34-205ENST00000600434 793 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TEFMQ96QE5 JAK3-201ENST00000458235 5432 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TEFMQ96QE5 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TEFMQ96QE5 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TEFMQ96QE5 SELENBP1-204ENST00000426705 1928 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TEFMQ96QE5 GIMAP1-201ENST00000307194 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TEFMQ96QE5 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TEFMQ96QE5 REM2-202ENST00000536884 1331 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TEFMQ96QE5 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TEFMQ96QE5 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TEFMQ96QE5 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TEFMQ96QE5 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TEFMQ96QE5 PELI2-201ENST00000267460 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TEFMQ96QE5 RAB33B-201ENST00000305626 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TEFMQ96QE5 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.22
TEFMQ96QE5 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
TEFMQ96QE5 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TEFMQ96QE5 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TEFMQ96QE5 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TEFMQ96QE5 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TEFMQ96QE5 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TEFMQ96QE5 CBX3P2-201ENST00000579647 1429 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TEFMQ96QE5 RPS17-201ENST00000330244 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TEFMQ96QE5 GPX7-201ENST00000361314 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TEFMQ96QE5 HLA-DMA-201ENST00000374843 1123 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TEFMQ96QE5 SGO2-202ENST00000409203 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TEFMQ96QE5 AL645941.2-201ENST00000429234 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TEFMQ96QE5 DARS-AS1-203ENST00000438432 768 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TEFMQ96QE5 LINC00899-202ENST00000444890 493 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TEFMQ96QE5 AP000344.2-201ENST00000512987 629 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
TEFMQ96QE5 AC119403.1-201ENST00000520090 776 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TEFMQ96QE5 FAM118B-206ENST00000529731 1028 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TEFMQ96QE5 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TEFMQ96QE5 AC009630.3-201ENST00000581909 729 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TEFMQ96QE5 ZEB1-AS1-206ENST00000606250 573 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TEFMQ96QE5 AC244153.1-202ENST00000617855 482 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TEFMQ96QE5 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TEFMQ96QE5 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TEFMQ96QE5 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TEFMQ96QE5 SMUG1-209ENST00000505128 2607 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TEFMQ96QE5 AL590787.1-201ENST00000568856 1315 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
TEFMQ96QE5 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TEFMQ96QE5 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TEFMQ96QE5 CBX6-202ENST00000407418 6122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TEFMQ96QE5 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TEFMQ96QE5 TATDN3-214ENST00000532324 1381 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TEFMQ96QE5 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TEFMQ96QE5 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TEFMQ96QE5 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TEFMQ96QE5 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TEFMQ96QE5 ZIC5-201ENST00000267294 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.7 ms