Protein–RNA interactions for Protein: Q8IXW5

RPAP2, Putative RNA polymerase II subunit B1 CTD phosphatase RPAP2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 612 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPAP2Q8IXW5 ZNF259P1-201ENST00000407656 1365 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
RPAP2Q8IXW5 LCA10-201ENST00000618311 1392 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
RPAP2Q8IXW5 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
RPAP2Q8IXW5 CLDN14-204ENST00000399137 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
RPAP2Q8IXW5 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
RPAP2Q8IXW5 OTOS-202ENST00000391989 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.89■□□□□ 0.93
RPAP2Q8IXW5 WWOX-204ENST00000408984 1227 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
RPAP2Q8IXW5 SGO2-202ENST00000409203 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
RPAP2Q8IXW5 CDK2AP2P3-201ENST00000422476 372 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
RPAP2Q8IXW5 TSPAN32-207ENST00000451520 1236 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
RPAP2Q8IXW5 BX890604.1-208ENST00000490920 726 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
RPAP2Q8IXW5 MOK-203ENST00000517966 1230 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
RPAP2Q8IXW5 SLC25A1P1-201ENST00000528351 927 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
RPAP2Q8IXW5 IL18BP-211ENST00000531053 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
RPAP2Q8IXW5 NR2C2AP-204ENST00000538165 891 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
RPAP2Q8IXW5 GSTO1-207ENST00000539281 1052 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
RPAP2Q8IXW5 CD63-210ENST00000550776 870 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
RPAP2Q8IXW5 RPL28-209ENST00000560055 670 ntTSL 3 BASIC20.89■□□□□ 0.93
RPAP2Q8IXW5 AQP6-205ENST00000618286 829 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
RPAP2Q8IXW5 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.89■□□□□ 0.93
RPAP2Q8IXW5 CES4A-206ENST00000540579 1825 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
RPAP2Q8IXW5 PIGT-221ENST00000638594 1835 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
RPAP2Q8IXW5 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
RPAP2Q8IXW5 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
RPAP2Q8IXW5 GGT4P-201ENST00000623672 1708 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
RPAP2Q8IXW5 CCDC183-201ENST00000338005 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
RPAP2Q8IXW5 PRKCSH-205ENST00000587327 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
RPAP2Q8IXW5 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
RPAP2Q8IXW5 PCBP3-204ENST00000400309 1986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
RPAP2Q8IXW5 AC062028.1-203ENST00000447433 1472 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
RPAP2Q8IXW5 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
RPAP2Q8IXW5 TIGAR-201ENST00000179259 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
RPAP2Q8IXW5 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
RPAP2Q8IXW5 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
RPAP2Q8IXW5 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
RPAP2Q8IXW5 ICOSLG-201ENST00000344330 1009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
RPAP2Q8IXW5 SELENOH-201ENST00000388857 833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
RPAP2Q8IXW5 RNF212-203ENST00000433731 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
RPAP2Q8IXW5 STARD13-205ENST00000439831 945 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
RPAP2Q8IXW5 KRT18P2-201ENST00000447938 1258 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
RPAP2Q8IXW5 AL133375.1-201ENST00000500590 980 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
RPAP2Q8IXW5 PTHLH-207ENST00000539239 890 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
RPAP2Q8IXW5 C12orf76-202ENST00000546627 461 ntTSL 4 BASIC20.88■□□□□ 0.93
RPAP2Q8IXW5 NUTF2-206ENST00000569436 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
RPAP2Q8IXW5 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
RPAP2Q8IXW5 GIPC1-213ENST00000591349 1068 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
RPAP2Q8IXW5 NME4-212ENST00000621774 904 ntTSL 3 BASIC20.88■□□□□ 0.93
RPAP2Q8IXW5 AC007064.4-201ENST00000637740 555 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
RPAP2Q8IXW5 GGT3P-204ENST00000453783 1664 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
RPAP2Q8IXW5 CCDC43-202ENST00000457422 2058 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
RPAP2Q8IXW5 SERINC2-205ENST00000536384 2062 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
RPAP2Q8IXW5 FUT2-201ENST00000391876 1593 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
RPAP2Q8IXW5 ST3GAL5-229ENST00000638986 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
RPAP2Q8IXW5 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
RPAP2Q8IXW5 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
RPAP2Q8IXW5 TMEM39B-201ENST00000336294 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
RPAP2Q8IXW5 C16orf89-203ENST00000474471 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
RPAP2Q8IXW5 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
RPAP2Q8IXW5 MIER1-205ENST00000371014 1728 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
RPAP2Q8IXW5 GALNT9-202ENST00000397325 1727 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
RPAP2Q8IXW5 VGLL4-211ENST00000430365 1377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
RPAP2Q8IXW5 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
RPAP2Q8IXW5 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
RPAP2Q8IXW5 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
RPAP2Q8IXW5 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
RPAP2Q8IXW5 CCDC40-201ENST00000269318 1970 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
RPAP2Q8IXW5 TMEM143-202ENST00000377431 1960 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
RPAP2Q8IXW5 LGALS3BP-218ENST00000591778 1961 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
RPAP2Q8IXW5 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
RPAP2Q8IXW5 AL512625.3-203ENST00000445604 1602 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
RPAP2Q8IXW5 ASB6-203ENST00000450050 4535 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
RPAP2Q8IXW5 PF4-201ENST00000296029 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
RPAP2Q8IXW5 CRADD-201ENST00000332896 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
RPAP2Q8IXW5 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
RPAP2Q8IXW5 TMEM205-202ENST00000447337 916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
RPAP2Q8IXW5 C1QB-203ENST00000509305 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
RPAP2Q8IXW5 AC120114.3-201ENST00000611923 658 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
RPAP2Q8IXW5 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
RPAP2Q8IXW5 MAFB-201ENST00000373313 3393 ntAPPRIS P1 BASIC20.87■□□□□ 0.93
RPAP2Q8IXW5 USHBP1-203ENST00000431146 2136 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
RPAP2Q8IXW5 LY6K-205ENST00000522591 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
RPAP2Q8IXW5 CDC25B-204ENST00000379598 2990 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
RPAP2Q8IXW5 CCDC120-203ENST00000536628 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
RPAP2Q8IXW5 NPM2-209ENST00000521157 1484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
RPAP2Q8IXW5 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
RPAP2Q8IXW5 SLC22A5-203ENST00000435065 1746 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
RPAP2Q8IXW5 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
RPAP2Q8IXW5 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
RPAP2Q8IXW5 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
RPAP2Q8IXW5 SLC3A2-203ENST00000377890 2161 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
RPAP2Q8IXW5 ZNF446-201ENST00000335841 1889 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
RPAP2Q8IXW5 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
RPAP2Q8IXW5 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
RPAP2Q8IXW5 ELAC2-203ENST00000426905 2671 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
RPAP2Q8IXW5 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
RPAP2Q8IXW5 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
RPAP2Q8IXW5 FBXO18-203ENST00000397269 3640 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
RPAP2Q8IXW5 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
RPAP2Q8IXW5 DPY30-201ENST00000295066 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
RPAP2Q8IXW5 DPY30-202ENST00000342166 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.4 ms