Protein–RNA interactions for Protein: Q6NSW7

NANOGP8, Putative homeobox protein NANOGP8, humanhuman

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NANOGP8Q6NSW7 MBD1-222ENST00000590208 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NANOGP8Q6NSW7 AC148477.5-201ENST00000625164 1645 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
NANOGP8Q6NSW7 AFTPH-201ENST00000238855 4113 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NANOGP8Q6NSW7 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
NANOGP8Q6NSW7 SNX19-207ENST00000528555 1506 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NANOGP8Q6NSW7 C11orf24-201ENST00000304271 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NANOGP8Q6NSW7 FOS-208ENST00000555686 1496 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NANOGP8Q6NSW7 IRAK1-204ENST00000393687 2049 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NANOGP8Q6NSW7 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NANOGP8Q6NSW7 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NANOGP8Q6NSW7 AC092718.8-201ENST00000640345 2892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NANOGP8Q6NSW7 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NANOGP8Q6NSW7 CMTM3-202ENST00000424011 2330 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NANOGP8Q6NSW7 FAM83A-202ENST00000518448 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NANOGP8Q6NSW7 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NANOGP8Q6NSW7 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NANOGP8Q6NSW7 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NANOGP8Q6NSW7 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NANOGP8Q6NSW7 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NANOGP8Q6NSW7 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NANOGP8Q6NSW7 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NANOGP8Q6NSW7 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NANOGP8Q6NSW7 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NANOGP8Q6NSW7 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NANOGP8Q6NSW7 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NANOGP8Q6NSW7 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NANOGP8Q6NSW7 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
NANOGP8Q6NSW7 PLAGL1-206ENST00000416623 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NANOGP8Q6NSW7 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NANOGP8Q6NSW7 EPS8L2-231ENST00000614442 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NANOGP8Q6NSW7 SCN3B-202ENST00000392770 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NANOGP8Q6NSW7 SLC34A2-202ENST00000503434 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NANOGP8Q6NSW7 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NANOGP8Q6NSW7 HNRNPRP1-201ENST00000453465 1695 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
NANOGP8Q6NSW7 ABHD10-201ENST00000273359 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NANOGP8Q6NSW7 ZNF180-202ENST00000391956 3049 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NANOGP8Q6NSW7 TIMM44-201ENST00000270538 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NANOGP8Q6NSW7 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NANOGP8Q6NSW7 MEGF6-201ENST00000294599 4501 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NANOGP8Q6NSW7 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
NANOGP8Q6NSW7 KIF18B-204ENST00000593135 2745 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NANOGP8Q6NSW7 KDM5C-202ENST00000375379 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NANOGP8Q6NSW7 LFNG-205ENST00000402506 2268 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NANOGP8Q6NSW7 AQP3-201ENST00000297991 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NANOGP8Q6NSW7 CPNE6-201ENST00000397016 2235 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NANOGP8Q6NSW7 CPNE6-203ENST00000537691 2233 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NANOGP8Q6NSW7 ACHE-202ENST00000302913 2956 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NANOGP8Q6NSW7 AC018716.2-201ENST00000528390 2597 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NANOGP8Q6NSW7 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NANOGP8Q6NSW7 RUNX2-204ENST00000371438 5698 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NANOGP8Q6NSW7 C5orf30-202ENST00000510890 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NANOGP8Q6NSW7 SLC46A2-201ENST00000374228 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NANOGP8Q6NSW7 XXYLT1-205ENST00000437101 2149 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NANOGP8Q6NSW7 UNC119B-201ENST00000344651 4404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NANOGP8Q6NSW7 FBXO4-202ENST00000296812 1731 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NANOGP8Q6NSW7 APH1A-204ENST00000414276 1718 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NANOGP8Q6NSW7 MED17-201ENST00000251871 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NANOGP8Q6NSW7 IGHM-202ENST00000637539 1683 ntAPPRIS P5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NANOGP8Q6NSW7 RAP2C-201ENST00000342983 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NANOGP8Q6NSW7 IQCF5-AS1-201ENST00000440723 2000 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NANOGP8Q6NSW7 MYCBPAP-203ENST00000436259 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NANOGP8Q6NSW7 AL121845.3-201ENST00000490623 3119 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NANOGP8Q6NSW7 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NANOGP8Q6NSW7 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NANOGP8Q6NSW7 AP002414.1-201ENST00000391405 1147 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
NANOGP8Q6NSW7 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NANOGP8Q6NSW7 SIGLEC30P-201ENST00000455569 941 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
NANOGP8Q6NSW7 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NANOGP8Q6NSW7 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NANOGP8Q6NSW7 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NANOGP8Q6NSW7 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
NANOGP8Q6NSW7 GRIA4-203ENST00000393127 5621 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NANOGP8Q6NSW7 AL139130.1-201ENST00000451362 5586 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NANOGP8Q6NSW7 AC009292.1-201ENST00000502156 1986 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NANOGP8Q6NSW7 NSMCE3-201ENST00000332303 4838 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NANOGP8Q6NSW7 CAP1-205ENST00000372802 2964 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NANOGP8Q6NSW7 PLTP-205ENST00000477313 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NANOGP8Q6NSW7 HPCAL1-207ENST00000620771 1941 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NANOGP8Q6NSW7 DIABLO-208ENST00000464942 2569 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NANOGP8Q6NSW7 ADORA1-203ENST00000367235 2219 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NANOGP8Q6NSW7 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NANOGP8Q6NSW7 GPER1-204ENST00000401670 1542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NANOGP8Q6NSW7 REPIN1-202ENST00000425389 2876 ntAPPRIS P3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NANOGP8Q6NSW7 SLC9A2-201ENST00000233969 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NANOGP8Q6NSW7 PAQR6-204ENST00000356983 2143 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NANOGP8Q6NSW7 FSTL3-206ENST00000592947 2144 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NANOGP8Q6NSW7 FAM104A-201ENST00000403627 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NANOGP8Q6NSW7 ZXDC-202ENST00000389709 3405 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NANOGP8Q6NSW7 DBET-201ENST00000630918 3363 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
NANOGP8Q6NSW7 ACOT12-201ENST00000307624 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NANOGP8Q6NSW7 SLC27A5-201ENST00000263093 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
NANOGP8Q6NSW7 DCLK2-201ENST00000296550 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
NANOGP8Q6NSW7 LYNX1-206ENST00000621401 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
NANOGP8Q6NSW7 IER2-203ENST00000588173 2934 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
NANOGP8Q6NSW7 CDC25C-207ENST00000513970 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
NANOGP8Q6NSW7 SHISA5-208ENST00000442747 2250 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
NANOGP8Q6NSW7 MAST3-201ENST00000262811 5896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
NANOGP8Q6NSW7 GPS1-202ENST00000320548 1949 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
NANOGP8Q6NSW7 MGRN1-201ENST00000262370 3968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
NANOGP8Q6NSW7 TIGAR-201ENST00000179259 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.5 ms