Protein–RNA interactions for Protein: Q5SXM2

SNAPC4, snRNA-activating protein complex subunit 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,469 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNAPC4Q5SXM2 AC092506.1-202ENST00000401022 528 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
SNAPC4Q5SXM2 DMKN-204ENST00000408915 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
SNAPC4Q5SXM2 CDKN2AIP-205ENST00000510928 860 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
SNAPC4Q5SXM2 AGER-214ENST00000538695 487 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
SNAPC4Q5SXM2 BX927359.1-201ENST00000556073 543 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
SNAPC4Q5SXM2 AC024619.2-201ENST00000581964 517 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
SNAPC4Q5SXM2 AC011489.1-202ENST00000586556 618 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
SNAPC4Q5SXM2 AGER-215ENST00000620802 737 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
SNAPC4Q5SXM2 AC093525.9-201ENST00000624961 1746 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
SNAPC4Q5SXM2 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
SNAPC4Q5SXM2 CFAP45-201ENST00000368099 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
SNAPC4Q5SXM2 CIAPIN1-207ENST00000565961 1814 ntTSL 3 BASIC27.02■■□□□ 1.92
SNAPC4Q5SXM2 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
SNAPC4Q5SXM2 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
SNAPC4Q5SXM2 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
SNAPC4Q5SXM2 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
SNAPC4Q5SXM2 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
SNAPC4Q5SXM2 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
SNAPC4Q5SXM2 PIGT-257ENST00000640210 1715 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
SNAPC4Q5SXM2 OR10H1-201ENST00000334920 1124 ntAPPRIS P1 BASIC27.01■■□□□ 1.91
SNAPC4Q5SXM2 LBX2-201ENST00000341396 886 ntTSL 3 BASIC27.01■■□□□ 1.91
SNAPC4Q5SXM2 TEN1-201ENST00000397640 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
SNAPC4Q5SXM2 AC007611.1-201ENST00000568150 826 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
SNAPC4Q5SXM2 AC025048.3-201ENST00000590609 569 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
SNAPC4Q5SXM2 KXD1-204ENST00000595073 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
SNAPC4Q5SXM2 AC243960.2-201ENST00000600996 747 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
SNAPC4Q5SXM2 AC005702.4-201ENST00000618393 416 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
SNAPC4Q5SXM2 AC244517.4-201ENST00000624549 580 ntTSL 4 BASIC27.01■■□□□ 1.91
SNAPC4Q5SXM2 ENOSF1-209ENST00000580982 1397 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
SNAPC4Q5SXM2 CHMP5-201ENST00000223500 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
SNAPC4Q5SXM2 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
SNAPC4Q5SXM2 GSKIP-201ENST00000438650 2140 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
SNAPC4Q5SXM2 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
SNAPC4Q5SXM2 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
SNAPC4Q5SXM2 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
SNAPC4Q5SXM2 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
SNAPC4Q5SXM2 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
SNAPC4Q5SXM2 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
SNAPC4Q5SXM2 SNURF-201ENST00000338327 331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
SNAPC4Q5SXM2 CSHL1-203ENST00000346606 659 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
SNAPC4Q5SXM2 SPAG11B-203ENST00000359758 612 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
SNAPC4Q5SXM2 MEAF6-202ENST00000373073 603 ntTSL 3 BASIC27■■□□□ 1.91
SNAPC4Q5SXM2 MOGAT3-202ENST00000379423 933 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
SNAPC4Q5SXM2 IGHV3-16-201ENST00000390604 425 ntAPPRIS P1 BASIC27■■□□□ 1.91
SNAPC4Q5SXM2 ROPN1-202ENST00000405845 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
SNAPC4Q5SXM2 SSBP1-214ENST00000498107 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
SNAPC4Q5SXM2 AC124287.1-201ENST00000582249 838 ntTSL 3 BASIC27■■□□□ 1.91
SNAPC4Q5SXM2 AC003070.2-201ENST00000589730 386 ntTSL 3 BASIC27■■□□□ 1.91
SNAPC4Q5SXM2 KLK15-203ENST00000596931 692 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
SNAPC4Q5SXM2 DHPS-201ENST00000210060 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
SNAPC4Q5SXM2 SLC25A19-202ENST00000375261 1486 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
SNAPC4Q5SXM2 SLC22A12-201ENST00000336464 1854 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
SNAPC4Q5SXM2 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
SNAPC4Q5SXM2 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
SNAPC4Q5SXM2 PSMC5-209ENST00000580864 1552 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
SNAPC4Q5SXM2 FAH-201ENST00000261755 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
SNAPC4Q5SXM2 UPK3A-201ENST00000216211 1051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
SNAPC4Q5SXM2 NDUFS8-201ENST00000313468 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
SNAPC4Q5SXM2 IFNL2-201ENST00000331982 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
SNAPC4Q5SXM2 RPL13A-201ENST00000391857 1181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
SNAPC4Q5SXM2 ROPN1B-210ENST00000514116 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
SNAPC4Q5SXM2 SPDYE16-201ENST00000515340 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
SNAPC4Q5SXM2 CNOT8-210ENST00000519404 945 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
SNAPC4Q5SXM2 CNOT8-218ENST00000521583 1151 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
SNAPC4Q5SXM2 LINC02279-201ENST00000553435 737 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
SNAPC4Q5SXM2 DERL2-202ENST00000570848 657 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
SNAPC4Q5SXM2 PIGL-212ENST00000581006 554 ntTSL 4 BASIC27■■□□□ 1.91
SNAPC4Q5SXM2 YIF1B-214ENST00000591784 940 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
SNAPC4Q5SXM2 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
SNAPC4Q5SXM2 CCKAR-201ENST00000295589 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
SNAPC4Q5SXM2 PC-204ENST00000524491 1714 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
SNAPC4Q5SXM2 TBP-206ENST00000540980 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
SNAPC4Q5SXM2 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
SNAPC4Q5SXM2 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
SNAPC4Q5SXM2 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
SNAPC4Q5SXM2 CD300LG-206ENST00000588884 1459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
SNAPC4Q5SXM2 CD1D-201ENST00000368171 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
SNAPC4Q5SXM2 NPBWR2-201ENST00000369768 1352 ntAPPRIS P1 BASIC26.99■■□□□ 1.91
SNAPC4Q5SXM2 DRG1-201ENST00000331457 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
SNAPC4Q5SXM2 MFNG-201ENST00000356998 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
SNAPC4Q5SXM2 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
SNAPC4Q5SXM2 MRPL55-215ENST00000366742 630 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
SNAPC4Q5SXM2 CBX7-202ENST00000401405 784 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
SNAPC4Q5SXM2 AC007731.4-201ENST00000420225 652 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
SNAPC4Q5SXM2 AL391069.2-202ENST00000447795 622 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
SNAPC4Q5SXM2 SNHG9-201ENST00000531523 275 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
SNAPC4Q5SXM2 RARRES2P5-201ENST00000564013 466 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
SNAPC4Q5SXM2 AL671710.1-201ENST00000610245 2349 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
SNAPC4Q5SXM2 MBD1-207ENST00000398488 1512 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
SNAPC4Q5SXM2 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
SNAPC4Q5SXM2 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
SNAPC4Q5SXM2 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
SNAPC4Q5SXM2 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
SNAPC4Q5SXM2 PPP1R1B-205ENST00000579000 1466 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
SNAPC4Q5SXM2 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
SNAPC4Q5SXM2 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
SNAPC4Q5SXM2 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
SNAPC4Q5SXM2 CRTC2-202ENST00000368630 1635 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
SNAPC4Q5SXM2 PRMT2-208ENST00000451211 1878 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
SNAPC4Q5SXM2 CALM3-212ENST00000599839 1355 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.3 ms