Protein–RNA interactions for Protein: Q5JU00

TCTE1, T-complex-associated testis-expressed protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 501 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCTE1Q5JU00 BIRC7-201ENST00000217169 1368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TCTE1Q5JU00 FGFBP1-201ENST00000382333 1359 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TCTE1Q5JU00 PRR22-202ENST00000419421 1392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TCTE1Q5JU00 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TCTE1Q5JU00 PNRC1-202ENST00000354922 1345 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TCTE1Q5JU00 NR1H3-204ENST00000407404 1330 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TCTE1Q5JU00 PRMT1-202ENST00000454376 1327 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TCTE1Q5JU00 ARFGAP1-220ENST00000547204 1327 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TCTE1Q5JU00 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TCTE1Q5JU00 SLC22A20-204ENST00000530038 1673 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
TCTE1Q5JU00 TNNT1-201ENST00000291901 967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TCTE1Q5JU00 TMEM44-201ENST00000330115 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TCTE1Q5JU00 MRPL55-208ENST00000366734 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TCTE1Q5JU00 MRPL55-217ENST00000366746 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TCTE1Q5JU00 AFG3L1P-209ENST00000429663 458 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TCTE1Q5JU00 STARD13-205ENST00000439831 945 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TCTE1Q5JU00 CEND1P1-201ENST00000451006 455 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
TCTE1Q5JU00 TM4SF19-204ENST00000454715 1061 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TCTE1Q5JU00 PARD6G-203ENST00000470488 596 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TCTE1Q5JU00 SNCA-209ENST00000506244 570 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TCTE1Q5JU00 MRFAP1-203ENST00000507420 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TCTE1Q5JU00 FAM172A-207ENST00000509739 1031 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TCTE1Q5JU00 MARVELD3-206ENST00000567566 850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TCTE1Q5JU00 PYCR1-207ENST00000577756 1144 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TCTE1Q5JU00 MIR4469-201ENST00000583919 79 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
TCTE1Q5JU00 MRPL34-205ENST00000600434 793 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TCTE1Q5JU00 TVP23A-210ENST00000612195 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TCTE1Q5JU00 LINC00623-201ENST00000613486 486 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TCTE1Q5JU00 BSG-202ENST00000346916 1605 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TCTE1Q5JU00 BSG-203ENST00000353555 1616 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TCTE1Q5JU00 NDUFB2-AS1-201ENST00000465466 1648 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TCTE1Q5JU00 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
TCTE1Q5JU00 PPP1R3E-201ENST00000452015 4773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TCTE1Q5JU00 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TCTE1Q5JU00 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TCTE1Q5JU00 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
TCTE1Q5JU00 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TCTE1Q5JU00 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TCTE1Q5JU00 IGSF11-209ENST00000491903 1487 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TCTE1Q5JU00 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TCTE1Q5JU00 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TCTE1Q5JU00 EVPLL-201ENST00000399134 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TCTE1Q5JU00 SPSB1-202ENST00000357898 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TCTE1Q5JU00 NKAIN4-202ENST00000370313 1421 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TCTE1Q5JU00 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TCTE1Q5JU00 AL132857.2-201ENST00000634305 1737 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TCTE1Q5JU00 TRIM7-204ENST00000393319 2320 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TCTE1Q5JU00 BVES-202ENST00000336775 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TCTE1Q5JU00 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TCTE1Q5JU00 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TCTE1Q5JU00 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TCTE1Q5JU00 IL12RB1-201ENST00000322153 1902 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TCTE1Q5JU00 COMMD5-202ENST00000402718 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TCTE1Q5JU00 AC119396.1-201ENST00000576789 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TCTE1Q5JU00 RNF151-201ENST00000321392 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TCTE1Q5JU00 CD82-202ENST00000342935 967 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TCTE1Q5JU00 FAM19A5-204ENST00000406880 833 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TCTE1Q5JU00 AC006042.2-201ENST00000428660 568 ntTSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TCTE1Q5JU00 AKR1A1-204ENST00000471651 1018 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TCTE1Q5JU00 AC026191.1-201ENST00000491930 829 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TCTE1Q5JU00 AC027117.2-201ENST00000522768 510 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TCTE1Q5JU00 MVB12A-211ENST00000529939 1091 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TCTE1Q5JU00 CCND1-203ENST00000536559 553 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TCTE1Q5JU00 LYRM1-209ENST00000568663 857 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TCTE1Q5JU00 RNF151-203ENST00000569714 796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TCTE1Q5JU00 MIR3909-201ENST00000579518 119 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
TCTE1Q5JU00 ZNF773-202ENST00000593916 548 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TCTE1Q5JU00 AC008761.1-201ENST00000595363 217 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TCTE1Q5JU00 AL161645.1-201ENST00000622716 1255 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
TCTE1Q5JU00 AC055717.3-201ENST00000622967 595 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
TCTE1Q5JU00 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
TCTE1Q5JU00 EHD2-202ENST00000538399 1766 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
TCTE1Q5JU00 NF1-211ENST00000487476 2265 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
TCTE1Q5JU00 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
TCTE1Q5JU00 DNAH14-206ENST00000400952 1984 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
TCTE1Q5JU00 ASXL1-212ENST00000620121 5374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
TCTE1Q5JU00 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
TCTE1Q5JU00 DAPK1-202ENST00000408954 5892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
TCTE1Q5JU00 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
TCTE1Q5JU00 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
TCTE1Q5JU00 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TCTE1Q5JU00 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TCTE1Q5JU00 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TCTE1Q5JU00 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TCTE1Q5JU00 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TCTE1Q5JU00 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TCTE1Q5JU00 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TCTE1Q5JU00 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TCTE1Q5JU00 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TCTE1Q5JU00 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TCTE1Q5JU00 GMPPA-202ENST00000341142 1524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TCTE1Q5JU00 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TCTE1Q5JU00 NRN1L-201ENST00000339176 710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TCTE1Q5JU00 GPX7-201ENST00000361314 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TCTE1Q5JU00 PMS2P4-201ENST00000412466 1052 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
TCTE1Q5JU00 AL354836.1-201ENST00000414042 681 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TCTE1Q5JU00 APCDD1L-AS1-201ENST00000420279 555 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TCTE1Q5JU00 CDK2AP2P3-201ENST00000422476 372 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
TCTE1Q5JU00 AL162231.1-204ENST00000423809 477 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TCTE1Q5JU00 AP006288.1-201ENST00000446065 395 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.3 ms