Protein–RNA interactions for Protein: Q15906

VPS72, Vacuolar protein sorting-associated protein 72 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 364 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS72Q15906 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
VPS72Q15906 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
VPS72Q15906 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
VPS72Q15906 CD300LG-206ENST00000588884 1459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
VPS72Q15906 CIAPIN1-207ENST00000565961 1814 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
VPS72Q15906 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
VPS72Q15906 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
VPS72Q15906 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
VPS72Q15906 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
VPS72Q15906 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
VPS72Q15906 DUSP18-206ENST00000407308 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
VPS72Q15906 MEAF6-202ENST00000373073 603 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
VPS72Q15906 GZMB-202ENST00000382540 816 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
VPS72Q15906 TAGLN-202ENST00000392951 928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
VPS72Q15906 AL162726.2-201ENST00000438986 1017 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
VPS72Q15906 KBTBD4-203ENST00000525720 980 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
VPS72Q15906 AP000812.2-201ENST00000538934 718 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
VPS72Q15906 AC138028.3-201ENST00000561699 213 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
VPS72Q15906 COMMD4-217ENST00000567195 677 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
VPS72Q15906 TUBB6-203ENST00000586653 788 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
VPS72Q15906 AC025048.3-201ENST00000590609 569 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
VPS72Q15906 AC005702.4-201ENST00000618393 416 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
VPS72Q15906 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
VPS72Q15906 FBXO4-201ENST00000281623 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
VPS72Q15906 DHPS-201ENST00000210060 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
VPS72Q15906 PFDN4-201ENST00000371419 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
VPS72Q15906 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
VPS72Q15906 ETV3L-201ENST00000454449 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.07
VPS72Q15906 WLS-202ENST00000354777 2037 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
VPS72Q15906 LSP1-202ENST00000381775 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
VPS72Q15906 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
VPS72Q15906 CCKAR-201ENST00000295589 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
VPS72Q15906 TBP-206ENST00000540980 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
VPS72Q15906 TUBG2-201ENST00000251412 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
VPS72Q15906 AL592464.1-201ENST00000429389 429 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
VPS72Q15906 AC106786.2-201ENST00000506859 561 ntTSL 4 BASIC21.7■■□□□ 1.06
VPS72Q15906 CDKN2AIP-205ENST00000510928 860 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
VPS72Q15906 AC087612.1-201ENST00000560238 658 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
VPS72Q15906 HAUS2-207ENST00000568846 709 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
VPS72Q15906 KLK15-203ENST00000596931 692 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
VPS72Q15906 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
VPS72Q15906 KRT8P22-201ENST00000562317 1415 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
VPS72Q15906 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
VPS72Q15906 MBD1-207ENST00000398488 1512 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
VPS72Q15906 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
VPS72Q15906 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
VPS72Q15906 MED19-201ENST00000337672 1637 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
VPS72Q15906 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
VPS72Q15906 DMAC2-201ENST00000221943 1692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
VPS72Q15906 PIGT-257ENST00000640210 1715 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
VPS72Q15906 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
VPS72Q15906 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
VPS72Q15906 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
VPS72Q15906 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
VPS72Q15906 ETFB-201ENST00000309244 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
VPS72Q15906 DPM2-202ENST00000373110 738 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
VPS72Q15906 RAB34-210ENST00000436730 863 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
VPS72Q15906 KRT8P13-201ENST00000463294 1010 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
VPS72Q15906 DBNDD1-206ENST00000568838 993 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
VPS72Q15906 RPS15-212ENST00000593052 629 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
VPS72Q15906 AC016727.1-203ENST00000603199 540 ntTSL 4 BASIC21.69■■□□□ 1.06
VPS72Q15906 OR2T27-203ENST00000641652 1285 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
VPS72Q15906 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
VPS72Q15906 AC006538.1-201ENST00000567905 1585 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
VPS72Q15906 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
VPS72Q15906 DRG1-201ENST00000331457 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
VPS72Q15906 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
VPS72Q15906 GGT6-203ENST00000573591 1730 ntTSL 4 BASIC21.69■■□□□ 1.06
VPS72Q15906 AC093525.9-201ENST00000624961 1746 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
VPS72Q15906 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
VPS72Q15906 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
VPS72Q15906 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
VPS72Q15906 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
VPS72Q15906 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
VPS72Q15906 AGER-203ENST00000375065 665 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
VPS72Q15906 PGAP2-209ENST00000464261 830 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
VPS72Q15906 RN7SL399P-201ENST00000471648 279 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
VPS72Q15906 RMDN1-212ENST00000519966 1164 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
VPS72Q15906 AC090099.4-201ENST00000527671 1027 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
VPS72Q15906 AP000943.3-201ENST00000536540 954 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
VPS72Q15906 AL391069.4-201ENST00000609583 481 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
VPS72Q15906 RIC8A-217ENST00000626818 159 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
VPS72Q15906 SAMD4A-208ENST00000555192 1337 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
VPS72Q15906 CRYM-201ENST00000219599 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
VPS72Q15906 RMND1-205ENST00000622845 1484 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
VPS72Q15906 GMPR2-217ENST00000559104 1719 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
VPS72Q15906 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
VPS72Q15906 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
VPS72Q15906 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
VPS72Q15906 CD1D-201ENST00000368171 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
VPS72Q15906 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
VPS72Q15906 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
VPS72Q15906 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
VPS72Q15906 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
VPS72Q15906 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
VPS72Q15906 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
VPS72Q15906 ETV7-201ENST00000339796 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
VPS72Q15906 FAM172A-204ENST00000505869 1387 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
VPS72Q15906 FCGR1B-203ENST00000369384 1044 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
VPS72Q15906 VAMP1-203ENST00000400911 1068 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
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