Protein–RNA interactions for Protein: Q15560

TCEA2, Transcription elongation factor A protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 299 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCEA2Q15560 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TCEA2Q15560 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TCEA2Q15560 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TCEA2Q15560 IGSF11-209ENST00000491903 1487 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TCEA2Q15560 OGFOD2-224ENST00000545612 1465 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TCEA2Q15560 PRRT2-205ENST00000567659 1470 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TCEA2Q15560 GDA-201ENST00000238018 2074 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TCEA2Q15560 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
TCEA2Q15560 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TCEA2Q15560 CDIPT-209ENST00000569956 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TCEA2Q15560 SDCBP-201ENST00000260130 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TCEA2Q15560 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
TCEA2Q15560 DENND3-201ENST00000262585 5438 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TCEA2Q15560 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TCEA2Q15560 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TCEA2Q15560 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
TCEA2Q15560 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TCEA2Q15560 TSC2-204ENST00000401874 5421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TCEA2Q15560 F11R-206ENST00000621309 4770 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TCEA2Q15560 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TCEA2Q15560 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TCEA2Q15560 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TCEA2Q15560 AC092068.3-201ENST00000587894 2016 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
TCEA2Q15560 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TCEA2Q15560 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TCEA2Q15560 HMGA1P7-201ENST00000406908 502 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
TCEA2Q15560 LINC02558-202ENST00000436395 298 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TCEA2Q15560 LINC02055-207ENST00000524346 706 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TCEA2Q15560 AHSA1-202ENST00000535854 1173 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TCEA2Q15560 RNASEK-207ENST00000552842 595 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TCEA2Q15560 PYCR1-207ENST00000577756 1144 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TCEA2Q15560 TBX18-206ENST00000606784 1230 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TCEA2Q15560 AL513210.1-201ENST00000629608 234 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
TCEA2Q15560 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TCEA2Q15560 PPP4R3A-205ENST00000554684 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TCEA2Q15560 AC012569.1-201ENST00000591191 1524 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
TCEA2Q15560 CRYM-AS1-201ENST00000338573 1661 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TCEA2Q15560 SPOP-201ENST00000347630 2965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TCEA2Q15560 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TCEA2Q15560 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
TCEA2Q15560 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
TCEA2Q15560 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
TCEA2Q15560 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
TCEA2Q15560 CD1D-201ENST00000368171 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
TCEA2Q15560 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
TCEA2Q15560 PEA15-202ENST00000368076 2694 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
TCEA2Q15560 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
TCEA2Q15560 CLTA-201ENST00000242285 1152 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TCEA2Q15560 IFNL1-201ENST00000333625 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TCEA2Q15560 AL355306.1-201ENST00000415580 579 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
TCEA2Q15560 AL671277.1-201ENST00000429656 993 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
TCEA2Q15560 AP000344.2-201ENST00000512987 629 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
TCEA2Q15560 AC124067.2-201ENST00000521989 510 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TCEA2Q15560 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TCEA2Q15560 AC004835.2-201ENST00000603762 682 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
TCEA2Q15560 COLCA2-204ENST00000610738 975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TCEA2Q15560 COLCA2-206ENST00000638573 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TCEA2Q15560 COMMD5-202ENST00000402718 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TCEA2Q15560 ARL4C-202ENST00000390645 4013 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TCEA2Q15560 DHX30-205ENST00000445061 4065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TCEA2Q15560 YAP1-211ENST00000629586 1365 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TCEA2Q15560 FAM53C-202ENST00000434981 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TCEA2Q15560 SLC22A20-204ENST00000530038 1673 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
TCEA2Q15560 ASB10-202ENST00000377867 1738 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TCEA2Q15560 ZFP64-205ENST00000371518 1841 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TCEA2Q15560 CALD1-204ENST00000417172 1915 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TCEA2Q15560 KCNMA1-261ENST00000639486 8850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TCEA2Q15560 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TCEA2Q15560 CDC42BPG-201ENST00000342711 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TCEA2Q15560 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TCEA2Q15560 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TCEA2Q15560 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TCEA2Q15560 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TCEA2Q15560 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TCEA2Q15560 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TCEA2Q15560 TRIM7-204ENST00000393319 2320 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TCEA2Q15560 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TCEA2Q15560 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TCEA2Q15560 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TCEA2Q15560 PCDHA1-203ENST00000504120 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TCEA2Q15560 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TCEA2Q15560 AC116353.5-201ENST00000638148 1699 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
TCEA2Q15560 NR2C1-219ENST00000622476 1561 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TCEA2Q15560 MFSD2B-202ENST00000406420 1528 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TCEA2Q15560 TPT1-AS1-215ENST00000522673 1519 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TCEA2Q15560 ICAM4-203ENST00000393717 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TCEA2Q15560 RAB31-207ENST00000578921 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TCEA2Q15560 SFN-201ENST00000339276 1320 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TCEA2Q15560 SERHL2-203ENST00000340239 1315 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TCEA2Q15560 LTC4S-201ENST00000292596 666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TCEA2Q15560 NKX2-6-201ENST00000325017 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TCEA2Q15560 AC002056.1-201ENST00000395613 760 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
TCEA2Q15560 ACTG1P14-201ENST00000446382 1122 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
TCEA2Q15560 SPDYE11-202ENST00000450699 704 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
TCEA2Q15560 NDUFB2-202ENST00000460088 420 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TCEA2Q15560 CYMP-203ENST00000474680 1263 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
TCEA2Q15560 LEPROTL1-203ENST00000518001 589 ntTSL 4 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TCEA2Q15560 RFPL4AP1-201ENST00000530883 850 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
TCEA2Q15560 PTHLH-207ENST00000539239 890 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TCEA2Q15560 DUX4L17-201ENST00000557360 1267 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.2 ms