Protein–RNA interactions for Protein: Q15256

PTPRR, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase R, humanhuman

Predictions only

Length 657 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRRQ15256 PSMA8-202ENST00000343848 1675 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PTPRRQ15256 FALEC-201ENST00000416894 566 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
PTPRRQ15256 HNRNPA1P28-201ENST00000424481 961 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
PTPRRQ15256 COX10-202ENST00000429152 875 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
PTPRRQ15256 RNF212-203ENST00000433731 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PTPRRQ15256 FIS1-203ENST00000442303 631 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
PTPRRQ15256 AC013565.3-202ENST00000570120 460 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
PTPRRQ15256 AC005412.3-201ENST00000580309 715 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
PTPRRQ15256 TWSG1-202ENST00000581641 1119 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
PTPRRQ15256 FOSB-211ENST00000592436 1057 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
PTPRRQ15256 MED16-214ENST00000617672 554 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
PTPRRQ15256 AC023511.2-201ENST00000618803 211 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
PTPRRQ15256 ACY1-212ENST00000635797 1294 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
PTPRRQ15256 QRFPR-202ENST00000394427 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PTPRRQ15256 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PTPRRQ15256 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PTPRRQ15256 MAN1C1-201ENST00000263979 2627 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
PTPRRQ15256 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PTPRRQ15256 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PTPRRQ15256 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PTPRRQ15256 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PTPRRQ15256 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PTPRRQ15256 PRMT2-208ENST00000451211 1878 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PTPRRQ15256 TMEM143-202ENST00000377431 1960 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PTPRRQ15256 BANP-217ENST00000479780 1551 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PTPRRQ15256 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
PTPRRQ15256 AC119396.1-201ENST00000576789 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
PTPRRQ15256 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PTPRRQ15256 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PTPRRQ15256 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PTPRRQ15256 CNTNAP3B-201ENST00000276974 3240 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
PTPRRQ15256 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PTPRRQ15256 MUL1-201ENST00000264198 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PTPRRQ15256 EPB41-205ENST00000373797 2402 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PTPRRQ15256 ASTL-201ENST00000342380 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PTPRRQ15256 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PTPRRQ15256 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PTPRRQ15256 ADARB2-201ENST00000381305 703 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
PTPRRQ15256 CAPG-203ENST00000409670 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
PTPRRQ15256 BX842568.4-201ENST00000421222 227 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
PTPRRQ15256 AC074386.1-202ENST00000463561 864 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
PTPRRQ15256 AC112482.1-201ENST00000492080 688 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
PTPRRQ15256 SMN2-210ENST00000511812 867 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
PTPRRQ15256 AC055717.3-201ENST00000622967 595 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
PTPRRQ15256 AC007064.4-201ENST00000637740 555 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
PTPRRQ15256 SMN2-216ENST00000638794 846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
PTPRRQ15256 ANKRD23-203ENST00000418232 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PTPRRQ15256 NPM2-209ENST00000521157 1484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
PTPRRQ15256 NDUFV1-223ENST00000532303 1493 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
PTPRRQ15256 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PTPRRQ15256 ALDH3A1-212ENST00000494157 1572 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
PTPRRQ15256 THTPA-203ENST00000554789 1595 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
PTPRRQ15256 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PTPRRQ15256 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PTPRRQ15256 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
PTPRRQ15256 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
PTPRRQ15256 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
PTPRRQ15256 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PTPRRQ15256 TEAD4-202ENST00000359864 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PTPRRQ15256 TULP2-201ENST00000221399 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PTPRRQ15256 CBWD1-201ENST00000314367 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PTPRRQ15256 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
PTPRRQ15256 GPS1-228ENST00000624957 1825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
PTPRRQ15256 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PTPRRQ15256 CR392000.2-201ENST00000640235 1994 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
PTPRRQ15256 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PTPRRQ15256 SPATC1-201ENST00000377470 2007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PTPRRQ15256 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PTPRRQ15256 ACOT12-201ENST00000307624 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PTPRRQ15256 TBX4-201ENST00000240335 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PTPRRQ15256 GALNT18-201ENST00000227756 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PTPRRQ15256 YBEY-201ENST00000329319 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PTPRRQ15256 PAXX-201ENST00000371620 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PTPRRQ15256 YBEY-206ENST00000397701 744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
PTPRRQ15256 PRR29-203ENST00000425164 1266 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
PTPRRQ15256 AC004832.2-201ENST00000426397 482 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
PTPRRQ15256 RPP21-221ENST00000428040 594 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
PTPRRQ15256 RPP21-224ENST00000442966 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PTPRRQ15256 TSPAN32-207ENST00000451520 1236 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
PTPRRQ15256 AKR1A1-204ENST00000471651 1018 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PTPRRQ15256 AP000763.4-201ENST00000544674 752 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
PTPRRQ15256 AC002347.1-201ENST00000569543 541 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
PTPRRQ15256 AP002472.1-201ENST00000577490 586 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
PTPRRQ15256 CD7-202ENST00000578509 925 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
PTPRRQ15256 AC091167.2-201ENST00000579581 588 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
PTPRRQ15256 OR5AH1P-202ENST00000597822 431 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
PTPRRQ15256 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
PTPRRQ15256 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC16.84■□□□□ 0.29
PTPRRQ15256 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC16.84■□□□□ 0.29
PTPRRQ15256 SGSH-201ENST00000326317 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PTPRRQ15256 SMIM10-201ENST00000330288 1536 ntAPPRIS P1 BASIC16.84■□□□□ 0.29
PTPRRQ15256 CD9-203ENST00000382518 1556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
PTPRRQ15256 SPERT-201ENST00000310521 1613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PTPRRQ15256 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PTPRRQ15256 WDR90-209ENST00000547944 1672 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
PTPRRQ15256 CHAD-201ENST00000258969 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PTPRRQ15256 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PTPRRQ15256 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
PTPRRQ15256 ZNF786-201ENST00000316286 3144 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
PTPRRQ15256 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.1 ms