Protein–RNA interactions for Protein: Q15035

TRAM2, Translocating chain-associated membrane protein 2, humanhuman

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Length 370 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAM2Q15035 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRAM2Q15035 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRAM2Q15035 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRAM2Q15035 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRAM2Q15035 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRAM2Q15035 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
TRAM2Q15035 MIR22HG-204ENST00000571595 767 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRAM2Q15035 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRAM2Q15035 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRAM2Q15035 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
TRAM2Q15035 AC013467.2-201ENST00000605472 835 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
TRAM2Q15035 AL353135.1-201ENST00000606729 504 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
TRAM2Q15035 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRAM2Q15035 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRAM2Q15035 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
TRAM2Q15035 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
TRAM2Q15035 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
TRAM2Q15035 AL139011.1-202ENST00000642063 584 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
TRAM2Q15035 SAMD4A-204ENST00000554335 3003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRAM2Q15035 KHNYN-202ENST00000553935 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRAM2Q15035 MAPK8IP1-202ENST00000395629 3180 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRAM2Q15035 BSG-202ENST00000346916 1605 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRAM2Q15035 MYB-203ENST00000341911 3672 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRAM2Q15035 TMEM127-202ENST00000432959 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRAM2Q15035 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRAM2Q15035 CELF3-201ENST00000290583 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRAM2Q15035 TRIM39-205ENST00000396551 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRAM2Q15035 LINC01502-201ENST00000445997 2471 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRAM2Q15035 STK35-201ENST00000381482 6685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRAM2Q15035 STK17A-201ENST00000319357 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRAM2Q15035 LINC00887-203ENST00000429578 1717 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRAM2Q15035 VEPH1-218ENST00000494677 1714 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRAM2Q15035 UNC5D-203ENST00000416672 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRAM2Q15035 GCK-202ENST00000345378 2421 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRAM2Q15035 PLEKHB1-202ENST00000354190 2380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRAM2Q15035 PLPPR4-203ENST00000457765 4846 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRAM2Q15035 GABRB3-215ENST00000622697 5876 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRAM2Q15035 JADE2-202ENST00000361895 3212 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRAM2Q15035 GLMP-201ENST00000362007 1604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRAM2Q15035 AC006277.1-201ENST00000624348 1610 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
TRAM2Q15035 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRAM2Q15035 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRAM2Q15035 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRAM2Q15035 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRAM2Q15035 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRAM2Q15035 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRAM2Q15035 PRYP5-201ENST00000451909 266 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
TRAM2Q15035 AC034243.1-201ENST00000520838 587 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRAM2Q15035 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRAM2Q15035 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRAM2Q15035 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRAM2Q15035 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRAM2Q15035 CADPS2-204ENST00000412584 4308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRAM2Q15035 SEPT8-204ENST00000378699 2289 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRAM2Q15035 KCTD11-201ENST00000333751 2783 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRAM2Q15035 MBL1P-201ENST00000480805 1424 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRAM2Q15035 ADAM8-205ENST00000485491 2441 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRAM2Q15035 C12orf29-201ENST00000356891 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRAM2Q15035 BMI1-201ENST00000376663 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRAM2Q15035 UNC119B-201ENST00000344651 4404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRAM2Q15035 RGPD8-201ENST00000302558 5576 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRAM2Q15035 IRF1-202ENST00000405885 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRAM2Q15035 EDC3-202ENST00000426797 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRAM2Q15035 ALDH3A1-212ENST00000494157 1572 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRAM2Q15035 SEPT8-208ENST00000378721 1723 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRAM2Q15035 CALCR-207ENST00000426151 1741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRAM2Q15035 GALNT6-201ENST00000356317 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRAM2Q15035 JPH4-202ENST00000397118 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRAM2Q15035 DNM2-202ENST00000359692 3588 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRAM2Q15035 ME2P1-201ENST00000426028 1970 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
TRAM2Q15035 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRAM2Q15035 CBWD5-204ENST00000377392 2863 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRAM2Q15035 PRKAG1-217ENST00000552212 1497 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRAM2Q15035 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRAM2Q15035 MTFR2-203ENST00000420702 1793 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRAM2Q15035 TRIM72-201ENST00000322122 8500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRAM2Q15035 ANTXRL-205ENST00000620264 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRAM2Q15035 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRAM2Q15035 B4GALNT4-201ENST00000329962 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRAM2Q15035 DCAF5-201ENST00000341516 5953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRAM2Q15035 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRAM2Q15035 MIOS-202ENST00000405785 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRAM2Q15035 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRAM2Q15035 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRAM2Q15035 AC103957.2-201ENST00000521218 510 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRAM2Q15035 GABARAPL1-205ENST00000539170 1700 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRAM2Q15035 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRAM2Q15035 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRAM2Q15035 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
TRAM2Q15035 GALE-216ENST00000617979 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRAM2Q15035 MITF-204ENST00000352241 4814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRAM2Q15035 UBQLN1-201ENST00000257468 2299 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRAM2Q15035 ELK1-203ENST00000376983 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRAM2Q15035 BTN1A1-202ENST00000613186 2266 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRAM2Q15035 SERINC2-202ENST00000373710 2146 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRAM2Q15035 MRFAP1-205ENST00000617365 2112 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRAM2Q15035 CCDC40-201ENST00000269318 1970 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRAM2Q15035 KDM4B-203ENST00000536461 5027 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRAM2Q15035 CDC42EP4-201ENST00000335793 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRAM2Q15035 MCF2L2-208ENST00000473233 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
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