Protein–RNA interactions for Protein: Q14993

COL19A1, Collagen alpha-1(XIX) chain, humanhuman

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Length 1,142 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL19A1Q14993 TM4SF19-201ENST00000273695 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
COL19A1Q14993 PHLDA2-201ENST00000314222 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
COL19A1Q14993 S100A16-201ENST00000368703 946 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
COL19A1Q14993 TMEM225B-203ENST00000453227 1041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
COL19A1Q14993 KBTBD4-203ENST00000525720 980 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
COL19A1Q14993 AC009133.2-201ENST00000566537 547 ntTSL 4 BASIC17.22■□□□□ 0.35
COL19A1Q14993 FAM171B-202ENST00000612606 940 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
COL19A1Q14993 MIR8072-201ENST00000614241 80 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
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COL19A1Q14993 Metazoa_SRP.80-201ENST00000619894 320 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
COL19A1Q14993 GPR182-203ENST00000622922 591 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
COL19A1Q14993 AC020907.1-201ENST00000616460 1350 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
COL19A1Q14993 GALE-216ENST00000617979 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
COL19A1Q14993 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
COL19A1Q14993 GFOD2-203ENST00000602377 1991 ntTSL 4 BASIC17.22■□□□□ 0.35
COL19A1Q14993 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
COL19A1Q14993 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
COL19A1Q14993 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
COL19A1Q14993 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
COL19A1Q14993 RAB29-201ENST00000235932 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
COL19A1Q14993 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
COL19A1Q14993 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
COL19A1Q14993 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
COL19A1Q14993 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
COL19A1Q14993 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
COL19A1Q14993 ELP4-219ENST00000639878 1583 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
COL19A1Q14993 NCAPH2-202ENST00000395698 1388 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
COL19A1Q14993 FAHD2B-202ENST00000414820 1388 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
COL19A1Q14993 PDE6D-201ENST00000287600 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
COL19A1Q14993 SS18L1-202ENST00000370848 1238 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
COL19A1Q14993 MEAF6-202ENST00000373073 603 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
COL19A1Q14993 STX1A-203ENST00000395155 783 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
COL19A1Q14993 HAUS4P1-201ENST00000406739 1145 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
COL19A1Q14993 ABHD11-AS1-201ENST00000427153 662 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
COL19A1Q14993 SYNPR-202ENST00000450542 1004 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
COL19A1Q14993 AP000345.1-201ENST00000454863 569 ntTSL 4 BASIC17.21■□□□□ 0.35
COL19A1Q14993 AC010491.1-203ENST00000564167 638 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
COL19A1Q14993 MRNIP-225ENST00000610475 810 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
COL19A1Q14993 AL033527.5-201ENST00000641382 801 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
COL19A1Q14993 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
COL19A1Q14993 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
COL19A1Q14993 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
COL19A1Q14993 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
COL19A1Q14993 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
COL19A1Q14993 IMPDH1P4-201ENST00000445028 1534 ntBASIC17.21■□□□□ 0.34
COL19A1Q14993 EIF3K-203ENST00000545173 1327 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.34
COL19A1Q14993 ATP6AP2-233ENST00000638153 1303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
COL19A1Q14993 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.34
COL19A1Q14993 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
COL19A1Q14993 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
COL19A1Q14993 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
COL19A1Q14993 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
COL19A1Q14993 MTFR2-203ENST00000420702 1793 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
COL19A1Q14993 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
COL19A1Q14993 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
COL19A1Q14993 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
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COL19A1Q14993 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
COL19A1Q14993 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
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COL19A1Q14993 C2orf76-202ENST00000409466 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
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COL19A1Q14993 CNOT8-218ENST00000521583 1151 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
COL19A1Q14993 COQ7-202ENST00000544894 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
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COL19A1Q14993 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
COL19A1Q14993 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
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COL19A1Q14993 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
COL19A1Q14993 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
COL19A1Q14993 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
COL19A1Q14993 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
COL19A1Q14993 MARCH2-208ENST00000602117 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
COL19A1Q14993 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
COL19A1Q14993 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
COL19A1Q14993 PAQR6-214ENST00000613336 1599 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
COL19A1Q14993 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
COL19A1Q14993 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
COL19A1Q14993 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
COL19A1Q14993 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
COL19A1Q14993 LINC01185-202ENST00000452343 1705 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
COL19A1Q14993 ZNF140-210ENST00000544426 2340 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
COL19A1Q14993 ING4-202ENST00000396807 1393 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
COL19A1Q14993 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
COL19A1Q14993 SPAAR-202ENST00000443779 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
COL19A1Q14993 BUD31-201ENST00000222969 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
COL19A1Q14993 HIST1H4J-201ENST00000355057 373 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
COL19A1Q14993 MS4A13-201ENST00000378185 808 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
COL19A1Q14993 PSORS1C3-201ENST00000412143 593 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
COL19A1Q14993 BCYRN1-201ENST00000418539 200 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
COL19A1Q14993 KRT43P-201ENST00000434019 910 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
COL19A1Q14993 MOGAT3-203ENST00000440203 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
COL19A1Q14993 AL391069.2-202ENST00000447795 622 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
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