Protein–RNA interactions for Protein: Q13838

DDX39B, Spliceosome RNA helicase DDX39B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 428 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX39BQ13838 AP002414.1-201ENST00000391405 1147 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
DDX39BQ13838 NFKBIB-202ENST00000392079 991 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
DDX39BQ13838 POM121L12-201ENST00000408890 1283 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
DDX39BQ13838 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
DDX39BQ13838 ELK2BP-201ENST00000415014 1224 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
DDX39BQ13838 SLFNL1-205ENST00000439569 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
DDX39BQ13838 LINC01615-202ENST00000449466 603 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
DDX39BQ13838 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
DDX39BQ13838 TXNRD2-212ENST00000485358 850 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
DDX39BQ13838 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
DDX39BQ13838 AC073648.2-201ENST00000510116 352 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
DDX39BQ13838 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
DDX39BQ13838 H2AFJ-203ENST00000544848 644 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
DDX39BQ13838 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
DDX39BQ13838 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
DDX39BQ13838 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
DDX39BQ13838 AC092902.2-205ENST00000622381 394 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
DDX39BQ13838 AC064853.6-201ENST00000642029 303 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
DDX39BQ13838 DYNLL2-201ENST00000579991 6805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
DDX39BQ13838 QRFPR-202ENST00000394427 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
DDX39BQ13838 TSNARE1-205ENST00000520166 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
DDX39BQ13838 STPG3-AS1-201ENST00000612170 1701 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
DDX39BQ13838 DOLPP1-202ENST00000372546 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
DDX39BQ13838 CEP76-202ENST00000423709 2197 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
DDX39BQ13838 PRR18-201ENST00000322583 3084 ntAPPRIS P2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
DDX39BQ13838 CTD-3080P12.3-203ENST00000514376 1757 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
DDX39BQ13838 LY6K-205ENST00000522591 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
DDX39BQ13838 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
DDX39BQ13838 FGFBP1-201ENST00000382333 1359 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
DDX39BQ13838 AL021920.2-201ENST00000624828 1351 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
DDX39BQ13838 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
DDX39BQ13838 LRRC47-201ENST00000378251 4310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
DDX39BQ13838 MAGI1-202ENST00000402939 4389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
DDX39BQ13838 FOS-208ENST00000555686 1496 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
DDX39BQ13838 NFIX-209ENST00000587760 1487 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
DDX39BQ13838 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
DDX39BQ13838 RDH13-202ENST00000396247 1987 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
DDX39BQ13838 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
DDX39BQ13838 GMPPA-204ENST00000373908 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
DDX39BQ13838 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
DDX39BQ13838 MAP4-202ENST00000360240 5142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
DDX39BQ13838 SLC22A11-203ENST00000377585 2124 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
DDX39BQ13838 PEA15-202ENST00000368076 2694 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
DDX39BQ13838 ADAMTS18-201ENST00000282849 5913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
DDX39BQ13838 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
DDX39BQ13838 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
DDX39BQ13838 JPT1-209ENST00000482348 1614 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
DDX39BQ13838 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
DDX39BQ13838 TNIP1-220ENST00000610535 2726 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
DDX39BQ13838 BVES-202ENST00000336775 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
DDX39BQ13838 TCP1-203ENST00000420894 1671 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
DDX39BQ13838 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
DDX39BQ13838 SLC39A8-201ENST00000356736 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
DDX39BQ13838 PKM-216ENST00000565184 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
DDX39BQ13838 TXNDC11-202ENST00000356957 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
DDX39BQ13838 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
DDX39BQ13838 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
DDX39BQ13838 RPS2P1-201ENST00000434010 821 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
DDX39BQ13838 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
DDX39BQ13838 TMEM106C-214ENST00000550161 976 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
DDX39BQ13838 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC16.34■□□□□ 0.21
DDX39BQ13838 DHRS4-205ENST00000558263 1089 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
DDX39BQ13838 DHRS4L2-207ENST00000558753 556 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
DDX39BQ13838 GRTP1-205ENST00000620217 1073 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
DDX39BQ13838 AC004706.3-202ENST00000621574 984 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
DDX39BQ13838 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
DDX39BQ13838 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
DDX39BQ13838 TTC24-202ENST00000368237 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
DDX39BQ13838 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
DDX39BQ13838 OSGEP-201ENST00000206542 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
DDX39BQ13838 PITPNC1-203ENST00000580974 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
DDX39BQ13838 NFAM1-201ENST00000329021 5602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
DDX39BQ13838 PRRT4-201ENST00000446477 3544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
DDX39BQ13838 KLK3-201ENST00000326003 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
DDX39BQ13838 DYNC1I1-212ENST00000630942 2249 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
DDX39BQ13838 KCNQ2-236ENST00000637193 2983 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
DDX39BQ13838 ATG9B-212ENST00000639579 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
DDX39BQ13838 ELMO3-203ENST00000477898 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
DDX39BQ13838 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
DDX39BQ13838 AL118508.1-201ENST00000613502 2345 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
DDX39BQ13838 CORO6-202ENST00000388767 2397 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
DDX39BQ13838 TTC8-216ENST00000614125 2377 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
DDX39BQ13838 TUBGCP2-204ENST00000417178 4029 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
DDX39BQ13838 JADE2-202ENST00000361895 3212 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
DDX39BQ13838 SLC8B1-210ENST00000550047 2493 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
DDX39BQ13838 EIF4A3-201ENST00000269349 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
DDX39BQ13838 MUTYH-201ENST00000354383 1744 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
DDX39BQ13838 AL132857.2-201ENST00000634305 1737 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
DDX39BQ13838 DDX19B-207ENST00000563206 1765 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
DDX39BQ13838 TEX19-201ENST00000333437 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
DDX39BQ13838 ADAMTS4-201ENST00000367995 1961 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
DDX39BQ13838 AL645728.1-201ENST00000366221 2101 ntBASIC16.33■□□□□ 0.21
DDX39BQ13838 C9orf172-201ENST00000436881 4387 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
DDX39BQ13838 ST3GAL2-201ENST00000342907 4450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
DDX39BQ13838 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
DDX39BQ13838 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
DDX39BQ13838 LINC01972-201ENST00000422271 553 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
DDX39BQ13838 AC134772.1-202ENST00000435578 549 ntTSL 4 BASIC16.33■□□□□ 0.2
DDX39BQ13838 DHRS12-203ENST00000444610 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
DDX39BQ13838 AC067930.3-201ENST00000524808 701 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
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