Protein–RNA interactions for Protein: Q13563

PKD2, Polycystin-2, humanhuman

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Length 968 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKD2Q13563 CCDC28A-202ENST00000611852 1505 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PKD2Q13563 WWTR1-204ENST00000467467 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PKD2Q13563 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PKD2Q13563 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PKD2Q13563 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PKD2Q13563 VCX3B-202ENST00000381032 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PKD2Q13563 LCN10-203ENST00000474369 564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PKD2Q13563 AC092658.1-201ENST00000505836 891 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
PKD2Q13563 LY6E-204ENST00000519546 971 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PKD2Q13563 MIR4453-201ENST00000584019 89 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
PKD2Q13563 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PKD2Q13563 ADAMTSL1-202ENST00000327883 1864 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PKD2Q13563 CD1D-201ENST00000368171 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PKD2Q13563 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PKD2Q13563 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PKD2Q13563 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PKD2Q13563 CLDN14-204ENST00000399137 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PKD2Q13563 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PKD2Q13563 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PKD2Q13563 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PKD2Q13563 ATP6AP2-225ENST00000637482 1648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PKD2Q13563 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
PKD2Q13563 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PKD2Q13563 TULP2-201ENST00000221399 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PKD2Q13563 AC016027.1-202ENST00000607927 1699 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
PKD2Q13563 CHCHD3-201ENST00000262570 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PKD2Q13563 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PKD2Q13563 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PKD2Q13563 TMEM270-201ENST00000320531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PKD2Q13563 NGF-201ENST00000369512 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PKD2Q13563 PGF-202ENST00000405431 666 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
PKD2Q13563 CRIP1-203ENST00000409393 677 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
PKD2Q13563 Z94721.1-201ENST00000444102 385 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
PKD2Q13563 FKBP11-203ENST00000453172 959 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
PKD2Q13563 LINC01184-209ENST00000514573 609 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
PKD2Q13563 AP001107.2-202ENST00000528650 480 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
PKD2Q13563 AL162231.3-201ENST00000556278 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
PKD2Q13563 AC007216.4-201ENST00000574364 562 ntTSL 4 BASIC24.6■■□□□ 1.53
PKD2Q13563 AP001350.2-201ENST00000625104 1094 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
PKD2Q13563 SERF2-203ENST00000381359 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PKD2Q13563 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PKD2Q13563 FBXO4-202ENST00000296812 1731 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PKD2Q13563 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
PKD2Q13563 LINC00895-201ENST00000629028 1637 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
PKD2Q13563 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
PKD2Q13563 EVPLL-201ENST00000399134 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PKD2Q13563 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
PKD2Q13563 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
PKD2Q13563 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PKD2Q13563 AC092068.3-201ENST00000587894 2016 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
PKD2Q13563 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC24.59■■□□□ 1.53
PKD2Q13563 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
PKD2Q13563 PKIG-202ENST00000372886 1180 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
PKD2Q13563 GOSR2-202ENST00000393456 788 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
PKD2Q13563 HHEX-203ENST00000492654 808 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PKD2Q13563 UCHL1-204ENST00000503431 917 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
PKD2Q13563 GPER1-207ENST00000619052 571 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
PKD2Q13563 DNAH14-206ENST00000400952 1984 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PKD2Q13563 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PKD2Q13563 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
PKD2Q13563 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PKD2Q13563 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PKD2Q13563 OTOL1-201ENST00000327928 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
PKD2Q13563 SLC9A3P2-201ENST00000447821 2021 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
PKD2Q13563 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PKD2Q13563 IL12RB1-201ENST00000322153 1902 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PKD2Q13563 ACY3-201ENST00000255082 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PKD2Q13563 CDKN1A-201ENST00000244741 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PKD2Q13563 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PKD2Q13563 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PKD2Q13563 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PKD2Q13563 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
PKD2Q13563 EIF4A3-201ENST00000269349 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PKD2Q13563 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PKD2Q13563 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PKD2Q13563 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PKD2Q13563 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PKD2Q13563 APLNR-203ENST00000611099 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PKD2Q13563 MIR346-201ENST00000362234 95 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
PKD2Q13563 ATP5J-205ENST00000400094 589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
PKD2Q13563 RAB17-204ENST00000409822 1077 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
PKD2Q13563 AC084125.2-203ENST00000532766 821 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
PKD2Q13563 DRAP1-208ENST00000532933 751 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PKD2Q13563 API5-211ENST00000534695 560 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
PKD2Q13563 AC008969.1-205ENST00000553254 876 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
PKD2Q13563 AC140912.1-201ENST00000577171 1054 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
PKD2Q13563 AC090241.2-202ENST00000602333 633 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
PKD2Q13563 AC104581.1-203ENST00000640240 353 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
PKD2Q13563 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PKD2Q13563 KDM4F-201ENST00000545950 1917 ntAPPRIS P1 BASIC24.58■■□□□ 1.53
PKD2Q13563 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PKD2Q13563 IRF1-202ENST00000405885 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
PKD2Q13563 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PKD2Q13563 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PKD2Q13563 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC24.58■■□□□ 1.53
PKD2Q13563 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
PKD2Q13563 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
PKD2Q13563 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
PKD2Q13563 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
PKD2Q13563 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
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