Protein–RNA interactions for Protein: Q13367

AP3B2, AP-3 complex subunit beta-2, humanhuman

Predictions only

Length 1,082 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP3B2Q13367 AC006538.1-201ENST00000567905 1585 ntBASIC19.02■□□□□ 0.63
AP3B2Q13367 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
AP3B2Q13367 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
AP3B2Q13367 STK32C-204ENST00000368622 2010 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
AP3B2Q13367 ATP5S-201ENST00000245448 1671 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
AP3B2Q13367 ZDHHC4-206ENST00000405731 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
AP3B2Q13367 SGK3-206ENST00000520976 2483 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
AP3B2Q13367 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
AP3B2Q13367 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
AP3B2Q13367 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
AP3B2Q13367 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
AP3B2Q13367 CCT6A-202ENST00000335503 2529 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
AP3B2Q13367 FLVCR1-AS1-201ENST00000356684 2525 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
AP3B2Q13367 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
AP3B2Q13367 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
AP3B2Q13367 AC254562.1-201ENST00000417586 456 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
AP3B2Q13367 LINC00899-202ENST00000444890 493 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
AP3B2Q13367 TWIST2-201ENST00000448943 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
AP3B2Q13367 SEC24B-AS1-203ENST00000505895 800 ntTSL 4 BASIC19.01■□□□□ 0.63
AP3B2Q13367 CFL1-202ENST00000524553 860 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
AP3B2Q13367 CCND1-203ENST00000536559 553 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
AP3B2Q13367 AP002449.1-201ENST00000588211 474 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
AP3B2Q13367 AC026120.1-201ENST00000611536 926 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
AP3B2Q13367 AC087645.4-201ENST00000638890 792 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
AP3B2Q13367 AC079781.4-201ENST00000641908 219 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
AP3B2Q13367 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
AP3B2Q13367 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
AP3B2Q13367 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
AP3B2Q13367 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
AP3B2Q13367 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
AP3B2Q13367 TINF2-208ENST00000558566 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
AP3B2Q13367 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
AP3B2Q13367 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
AP3B2Q13367 HPCAL1-208ENST00000622018 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
AP3B2Q13367 WWTR1-204ENST00000467467 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
AP3B2Q13367 TMEM138-201ENST00000278826 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
AP3B2Q13367 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
AP3B2Q13367 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
AP3B2Q13367 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
AP3B2Q13367 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
AP3B2Q13367 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
AP3B2Q13367 RPS27A-201ENST00000272317 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
AP3B2Q13367 STOM-202ENST00000347359 870 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
AP3B2Q13367 C9orf116-202ENST00000371789 1278 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
AP3B2Q13367 MRPS18A-202ENST00000372133 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
AP3B2Q13367 ALKBH6-202ENST00000378875 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
AP3B2Q13367 TFAMP1-201ENST00000412727 736 ntBASIC19■□□□□ 0.63
AP3B2Q13367 DARS-AS1-203ENST00000438432 768 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
AP3B2Q13367 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
AP3B2Q13367 AL390729.1-201ENST00000456651 587 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
AP3B2Q13367 GATB-205ENST00000508611 605 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
AP3B2Q13367 AP000344.2-201ENST00000512987 629 ntBASIC19■□□□□ 0.63
AP3B2Q13367 AC243965.1-201ENST00000557595 781 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
AP3B2Q13367 AL135744.1-201ENST00000565098 629 ntBASIC19■□□□□ 0.63
AP3B2Q13367 INO80E-210ENST00000567705 880 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
AP3B2Q13367 TMEM88-202ENST00000574668 510 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
AP3B2Q13367 C19orf33-202ENST00000588605 520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
AP3B2Q13367 IGFLR1-205ENST00000588992 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
AP3B2Q13367 PRELID3A-208ENST00000590956 777 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
AP3B2Q13367 RPS15-207ENST00000591032 550 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
AP3B2Q13367 RPS15-212ENST00000593052 629 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
AP3B2Q13367 AL513210.1-201ENST00000629608 234 ntBASIC19■□□□□ 0.63
AP3B2Q13367 HNRNPH1-250ENST00000630639 123 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
AP3B2Q13367 AC105339.1-204ENST00000636249 355 ntBASIC19■□□□□ 0.63
AP3B2Q13367 MARVELD3-204ENST00000565261 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
AP3B2Q13367 AC053503.2-201ENST00000420563 1598 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
AP3B2Q13367 CCDC90B-202ENST00000455220 1550 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
AP3B2Q13367 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
AP3B2Q13367 LFNG-207ENST00000614382 1969 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
AP3B2Q13367 AC010478.1-202ENST00000559112 2367 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
AP3B2Q13367 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
AP3B2Q13367 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
AP3B2Q13367 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
AP3B2Q13367 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
AP3B2Q13367 CYB5R3-204ENST00000407332 1849 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
AP3B2Q13367 LRRC42-201ENST00000319223 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
AP3B2Q13367 AL512652.2-201ENST00000625156 1716 ntBASIC19■□□□□ 0.63
AP3B2Q13367 F10-202ENST00000375559 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
AP3B2Q13367 SLC25A35-205ENST00000580340 1541 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
AP3B2Q13367 AP001189.5-201ENST00000637683 1413 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
AP3B2Q13367 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
AP3B2Q13367 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
AP3B2Q13367 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
AP3B2Q13367 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
AP3B2Q13367 ADAMTS4-201ENST00000367995 1961 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
AP3B2Q13367 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
AP3B2Q13367 RBM4-204ENST00000408993 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
AP3B2Q13367 AC016027.1-202ENST00000607927 1699 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
AP3B2Q13367 FAM60A-203ENST00000454658 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
AP3B2Q13367 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
AP3B2Q13367 ACSM2A-213ENST00000575690 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
AP3B2Q13367 CRYBA2-201ENST00000295728 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
AP3B2Q13367 CLIC1-208ENST00000375784 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
AP3B2Q13367 TEX30-206ENST00000376032 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
AP3B2Q13367 HYPK-202ENST00000442995 1051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
AP3B2Q13367 AC026191.1-201ENST00000491930 829 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
AP3B2Q13367 AC068594.1-203ENST00000581153 695 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
AP3B2Q13367 AC004832.1-201ENST00000610936 1005 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
AP3B2Q13367 SBK3-202ENST00000612221 1270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
AP3B2Q13367 RBBP7-204ENST00000404022 1904 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 78.9 ms