Protein–RNA interactions for Protein: Q13309

SKP2, S-phase kinase-associated protein 2, humanhuman

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Length 424 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKP2Q13309 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SKP2Q13309 METTL26-205ENST00000397666 726 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SKP2Q13309 SUMO2P17-202ENST00000508743 738 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SKP2Q13309 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SKP2Q13309 FAM181A-205ENST00000557719 1072 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SKP2Q13309 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SKP2Q13309 TCAP-202ENST00000578283 583 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SKP2Q13309 FBF1-204ENST00000586631 621 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SKP2Q13309 CYP2A7P1-201ENST00000595391 815 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
SKP2Q13309 SIGLEC29P-201ENST00000599873 1114 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
SKP2Q13309 ZFYVE19-203ENST00000355341 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SKP2Q13309 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SKP2Q13309 ADGRB2-202ENST00000373658 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SKP2Q13309 CCDC189-204ENST00000541260 1531 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SKP2Q13309 ZNF561-AS1-204ENST00000587536 1799 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SKP2Q13309 THTPA-203ENST00000554789 1595 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SKP2Q13309 TMEM161A-201ENST00000162044 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SKP2Q13309 CFAP45-201ENST00000368099 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SKP2Q13309 LCORL-203ENST00000382226 5009 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SKP2Q13309 ACOT12-201ENST00000307624 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SKP2Q13309 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SKP2Q13309 CDIP1-207ENST00000564828 1636 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SKP2Q13309 AL118508.1-201ENST00000613502 2345 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
SKP2Q13309 BCAN-202ENST00000361588 2563 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SKP2Q13309 MIOS-202ENST00000405785 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SKP2Q13309 PRR15-201ENST00000319694 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SKP2Q13309 ADGRB2-201ENST00000373655 5400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SKP2Q13309 CELF3-201ENST00000290583 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SKP2Q13309 AL139300.1-201ENST00000472726 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SKP2Q13309 MFF-201ENST00000304593 2004 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SKP2Q13309 STK32C-204ENST00000368622 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SKP2Q13309 COQ6-220ENST00000629426 1538 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SKP2Q13309 LAMTOR5-201ENST00000256644 868 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SKP2Q13309 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SKP2Q13309 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SKP2Q13309 AP1S3-203ENST00000396654 830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
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SKP2Q13309 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
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SKP2Q13309 MRNIP-205ENST00000518235 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SKP2Q13309 AP006621.3-203ENST00000525941 610 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
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SKP2Q13309 AL049869.3-201ENST00000554918 558 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
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SKP2Q13309 C1QL3-202ENST00000619991 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SKP2Q13309 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SKP2Q13309 RGS3-206ENST00000374136 2092 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
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SKP2Q13309 AC073957.2-201ENST00000549241 1562 ntTSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SKP2Q13309 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SKP2Q13309 FAM3D-201ENST00000358781 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
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SKP2Q13309 OSBPL1A-203ENST00000399441 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
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SKP2Q13309 CLCF1-201ENST00000312438 1844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
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SKP2Q13309 LAPTM4B-201ENST00000445593 3173 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SKP2Q13309 FNDC11-202ENST00000370098 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SKP2Q13309 LINC01503-203ENST00000436710 901 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
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SKP2Q13309 LINC01197-204ENST00000611265 956 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SKP2Q13309 ZNF445-205ENST00000617032 1291 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SKP2Q13309 AP001350.2-201ENST00000625104 1094 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
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SKP2Q13309 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SKP2Q13309 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SKP2Q13309 PTPN5-202ENST00000396166 2299 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SKP2Q13309 AL671710.1-201ENST00000610245 2349 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
SKP2Q13309 MYB-209ENST00000442647 3304 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SKP2Q13309 WLS-202ENST00000354777 2037 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SKP2Q13309 DAGLB-204ENST00000436575 2385 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SKP2Q13309 URAHP-203ENST00000517889 1381 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SKP2Q13309 GABARAPL1-205ENST00000539170 1700 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SKP2Q13309 SLC52A1-202ENST00000424747 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
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