Protein–RNA interactions for Protein: Q12946

FOXF1, Forkhead box protein F1, humanhuman

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Length 379 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXF1Q12946 ARHGAP11A-201ENST00000361627 5898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
FOXF1Q12946 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
FOXF1Q12946 TJP1-212ENST00000614355 6977 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
FOXF1Q12946 AC010478.1-202ENST00000559112 2367 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
FOXF1Q12946 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
FOXF1Q12946 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
FOXF1Q12946 PHGDH-202ENST00000369409 1882 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
FOXF1Q12946 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
FOXF1Q12946 FANCA-203ENST00000389302 1641 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
FOXF1Q12946 PFKP-202ENST00000381075 2769 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
FOXF1Q12946 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
FOXF1Q12946 SPOP-201ENST00000347630 2965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
FOXF1Q12946 CDC25B-204ENST00000379598 2990 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
FOXF1Q12946 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
FOXF1Q12946 AC073957.2-201ENST00000549241 1562 ntTSL 4 BASIC15.24■□□□□ 0.03
FOXF1Q12946 FAM131A-207ENST00000450976 1335 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
FOXF1Q12946 HSP90B1-210ENST00000614327 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
FOXF1Q12946 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
FOXF1Q12946 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
FOXF1Q12946 GALNT10-203ENST00000425427 4344 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
FOXF1Q12946 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
FOXF1Q12946 PON2-201ENST00000222572 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
FOXF1Q12946 LCE1B-201ENST00000360090 1139 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
FOXF1Q12946 HCG4-201ENST00000418983 998 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
FOXF1Q12946 AFG3L1P-210ENST00000431757 569 ntTSL 4 BASIC15.24■□□□□ 0.03
FOXF1Q12946 TMEM205-202ENST00000447337 916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
FOXF1Q12946 SMIM27-204ENST00000453396 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
FOXF1Q12946 IL18BP-211ENST00000531053 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
FOXF1Q12946 AC087641.1-201ENST00000557561 1021 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
FOXF1Q12946 MIR4492-201ENST00000581627 80 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
FOXF1Q12946 CYP2A7P1-201ENST00000595391 815 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
FOXF1Q12946 SYT6-205ENST00000609117 4424 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
FOXF1Q12946 PC-214ENST00000628663 1470 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
FOXF1Q12946 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
FOXF1Q12946 PCDHA13-202ENST00000409494 4884 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
FOXF1Q12946 CYP2S1-201ENST00000310054 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
FOXF1Q12946 TRIP10-201ENST00000313244 2153 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
FOXF1Q12946 ELP5-202ENST00000356683 2197 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
FOXF1Q12946 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
FOXF1Q12946 PHKA1-205ENST00000541944 5944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
FOXF1Q12946 HARS-203ENST00000431330 1774 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
FOXF1Q12946 CD9-203ENST00000382518 1556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
FOXF1Q12946 TLE2-201ENST00000262953 2705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
FOXF1Q12946 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
FOXF1Q12946 PTGES3-201ENST00000262033 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
FOXF1Q12946 TBRG4-202ENST00000361278 1917 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
FOXF1Q12946 GBGT1-204ENST00000372043 1935 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
FOXF1Q12946 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
FOXF1Q12946 MAGEA4-206ENST00000393921 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
FOXF1Q12946 DAPK1-202ENST00000408954 5892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
FOXF1Q12946 BCAR1-209ENST00000546196 1340 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
FOXF1Q12946 EDC3-202ENST00000426797 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
FOXF1Q12946 TCP11L2-201ENST00000299045 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
FOXF1Q12946 FNDC11-202ENST00000370098 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
FOXF1Q12946 HIST1H2BL-201ENST00000377401 488 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
FOXF1Q12946 MIR574-201ENST00000385209 96 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
FOXF1Q12946 CDK2AP2P3-201ENST00000422476 372 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
FOXF1Q12946 AL049612.1-201ENST00000427017 694 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
FOXF1Q12946 RNF212-203ENST00000433731 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
FOXF1Q12946 RHOQP3-201ENST00000437982 621 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
FOXF1Q12946 POLD2P1-201ENST00000511220 997 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
FOXF1Q12946 EFCAB1-209ENST00000523092 648 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
FOXF1Q12946 KRT18P58-201ENST00000527480 1120 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
FOXF1Q12946 BATF2-204ENST00000527716 1230 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
FOXF1Q12946 CYB561D1-208ENST00000528785 1271 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
FOXF1Q12946 AC002398.2-201ENST00000587767 660 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
FOXF1Q12946 AC074135.2-201ENST00000600896 510 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
FOXF1Q12946 AL671883.3-201ENST00000603274 991 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
FOXF1Q12946 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
FOXF1Q12946 ADAMTS4-201ENST00000367995 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
FOXF1Q12946 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
FOXF1Q12946 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
FOXF1Q12946 AGGF1P2-201ENST00000426656 2106 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
FOXF1Q12946 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
FOXF1Q12946 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
FOXF1Q12946 DFNA5-207ENST00000419307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
FOXF1Q12946 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
FOXF1Q12946 YPEL3-203ENST00000562641 1941 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
FOXF1Q12946 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
FOXF1Q12946 ZFYVE19-203ENST00000355341 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
FOXF1Q12946 RGS3-210ENST00000462143 2759 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
FOXF1Q12946 RGS3-206ENST00000374136 2092 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
FOXF1Q12946 FBXO4-202ENST00000296812 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
FOXF1Q12946 UBE2G1-204ENST00000572484 1514 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
FOXF1Q12946 AC012569.1-201ENST00000591191 1524 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
FOXF1Q12946 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
FOXF1Q12946 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
FOXF1Q12946 ARHGAP33-201ENST00000007510 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
FOXF1Q12946 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
FOXF1Q12946 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
FOXF1Q12946 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
FOXF1Q12946 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
FOXF1Q12946 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
FOXF1Q12946 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
FOXF1Q12946 CNTNAP3-205ENST00000377659 2649 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
FOXF1Q12946 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
FOXF1Q12946 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
FOXF1Q12946 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
FOXF1Q12946 KLHDC8A-205ENST00000539253 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
FOXF1Q12946 CDIP1-207ENST00000564828 1636 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
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