Protein–RNA interactions for Protein: Q12879

GRIN2A, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 2A, humanhuman

Predictions only

Length 1,464 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIN2AQ12879 LBX2-201ENST00000341396 886 ntTSL 3 BASIC26.64■■□□□ 1.86
GRIN2AQ12879 KLF2P4-201ENST00000451959 1225 ntBASIC26.64■■□□□ 1.86
GRIN2AQ12879 AC147067.1-201ENST00000466692 579 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
GRIN2AQ12879 LLPH-AS1-201ENST00000510317 623 ntTSL 4 BASIC26.64■■□□□ 1.86
GRIN2AQ12879 AP000943.3-201ENST00000536540 954 ntTSL 3 BASIC26.64■■□□□ 1.86
GRIN2AQ12879 AC124287.1-201ENST00000582249 838 ntTSL 3 BASIC26.64■■□□□ 1.86
GRIN2AQ12879 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
GRIN2AQ12879 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
GRIN2AQ12879 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
GRIN2AQ12879 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.85
GRIN2AQ12879 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.85
GRIN2AQ12879 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.85
GRIN2AQ12879 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.85
GRIN2AQ12879 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
GRIN2AQ12879 CD300LG-204ENST00000539718 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
GRIN2AQ12879 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
GRIN2AQ12879 SAMD4A-208ENST00000555192 1337 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
GRIN2AQ12879 CAPZB-204ENST00000375144 1568 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
GRIN2AQ12879 FLT3LG-201ENST00000204637 1046 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
GRIN2AQ12879 SPAG7-201ENST00000206020 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
GRIN2AQ12879 CSF2RBP1-201ENST00000447905 391 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
GRIN2AQ12879 RCAN1-212ENST00000492600 935 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
GRIN2AQ12879 GCHFR-203ENST00000558670 412 ntTSL 3 BASIC26.63■■□□□ 1.85
GRIN2AQ12879 TUBG2-201ENST00000251412 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
GRIN2AQ12879 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
GRIN2AQ12879 FDPS-201ENST00000356657 1478 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
GRIN2AQ12879 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
GRIN2AQ12879 PRKACG-201ENST00000377276 1585 ntAPPRIS P1 BASIC26.63■■□□□ 1.85
GRIN2AQ12879 PSMC5-209ENST00000580864 1552 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
GRIN2AQ12879 PPDPF-201ENST00000370177 627 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
GRIN2AQ12879 MIR1247-201ENST00000408206 136 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
GRIN2AQ12879 AL139289.2-201ENST00000424948 661 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
GRIN2AQ12879 AL162431.1-201ENST00000434447 543 ntTSL 3 BASIC26.62■■□□□ 1.85
GRIN2AQ12879 HIST3H2BA-201ENST00000436555 524 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
GRIN2AQ12879 FO681548.1-201ENST00000455617 1132 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
GRIN2AQ12879 SPDYE16-201ENST00000515340 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
GRIN2AQ12879 AC124947.2-201ENST00000547118 1133 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
GRIN2AQ12879 AC003070.2-201ENST00000589730 386 ntTSL 3 BASIC26.62■■□□□ 1.85
GRIN2AQ12879 PPP1R1B-205ENST00000579000 1466 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
GRIN2AQ12879 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
GRIN2AQ12879 SLC2A4-202ENST00000424875 1852 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
GRIN2AQ12879 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
GRIN2AQ12879 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
GRIN2AQ12879 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
GRIN2AQ12879 DHPS-201ENST00000210060 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
GRIN2AQ12879 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
GRIN2AQ12879 DUSP18-206ENST00000407308 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
GRIN2AQ12879 TUBB8P12-201ENST00000308911 1335 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
GRIN2AQ12879 URAHP-202ENST00000409873 1349 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
GRIN2AQ12879 TUBB7P-202ENST00000428444 1305 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
GRIN2AQ12879 TUBB8P7-204ENST00000567960 1332 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
GRIN2AQ12879 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
GRIN2AQ12879 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
GRIN2AQ12879 IRF1-202ENST00000405885 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
GRIN2AQ12879 NPY-201ENST00000242152 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
GRIN2AQ12879 LAMA4-203ENST00000368638 1061 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
GRIN2AQ12879 AL162726.2-201ENST00000438986 1017 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
GRIN2AQ12879 AC007406.4-201ENST00000539568 765 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
GRIN2AQ12879 BX927359.1-201ENST00000556073 543 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
GRIN2AQ12879 AL158212.4-201ENST00000624062 1286 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
GRIN2AQ12879 ABBA01031660.1-201ENST00000635219 756 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
GRIN2AQ12879 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
GRIN2AQ12879 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
GRIN2AQ12879 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
GRIN2AQ12879 AC092143.3-201ENST00000565150 1900 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
GRIN2AQ12879 NFIC-203ENST00000443272 1716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
GRIN2AQ12879 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
GRIN2AQ12879 ETV7-201ENST00000339796 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
GRIN2AQ12879 SFRP2-201ENST00000274063 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
GRIN2AQ12879 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
GRIN2AQ12879 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
GRIN2AQ12879 PDXDC1-204ENST00000455313 2183 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
GRIN2AQ12879 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
GRIN2AQ12879 C1QC-202ENST00000374639 1183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
GRIN2AQ12879 GOLGA2P4-201ENST00000441462 777 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
GRIN2AQ12879 CRYGN-205ENST00000491928 698 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
GRIN2AQ12879 AC138028.3-201ENST00000561699 213 ntTSL 3 BASIC26.61■■□□□ 1.85
GRIN2AQ12879 ARL16-210ENST00000574938 751 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
GRIN2AQ12879 PIGL-212ENST00000581006 554 ntTSL 4 BASIC26.61■■□□□ 1.85
GRIN2AQ12879 AC103810.3-201ENST00000583567 96 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
GRIN2AQ12879 SFTA2-203ENST00000634371 815 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
GRIN2AQ12879 TBRG4-202ENST00000361278 1917 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
GRIN2AQ12879 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
GRIN2AQ12879 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
GRIN2AQ12879 TRIP10-201ENST00000313244 2153 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
GRIN2AQ12879 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
GRIN2AQ12879 PLEKHA8P1-201ENST00000256692 1839 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
GRIN2AQ12879 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
GRIN2AQ12879 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
GRIN2AQ12879 TUBBP5-201ENST00000290377 1563 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
GRIN2AQ12879 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
GRIN2AQ12879 ASB10-202ENST00000377867 1738 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
GRIN2AQ12879 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
GRIN2AQ12879 KRT8P39-201ENST00000396270 1433 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
GRIN2AQ12879 SETD4-205ENST00000399208 1165 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
GRIN2AQ12879 AP002748.3-205ENST00000525142 567 ntTSL 3 BASIC26.6■■□□□ 1.85
GRIN2AQ12879 AP002748.3-203ENST00000533502 581 ntTSL 3 BASIC26.6■■□□□ 1.85
GRIN2AQ12879 EMC4-209ENST00000559421 497 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
GRIN2AQ12879 GCHFR-206ENST00000561160 572 ntTSL 3 BASIC26.6■■□□□ 1.85
GRIN2AQ12879 TMEM219-203ENST00000561899 1249 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.2 ms