Protein–RNA interactions for Protein: Q0D2K2

KLHL30, Kelch-like protein 30, humanhuman

Predictions only

Length 578 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL30Q0D2K2 CBX6-202ENST00000407418 6122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
KLHL30Q0D2K2 PLEKHB1-202ENST00000354190 2380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
KLHL30Q0D2K2 ZBTB46-201ENST00000245663 5185 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
KLHL30Q0D2K2 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
KLHL30Q0D2K2 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
KLHL30Q0D2K2 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
KLHL30Q0D2K2 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
KLHL30Q0D2K2 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
KLHL30Q0D2K2 AC002091.2-201ENST00000585297 402 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
KLHL30Q0D2K2 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
KLHL30Q0D2K2 AC013467.2-201ENST00000605472 835 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
KLHL30Q0D2K2 TRH-202ENST00000507066 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
KLHL30Q0D2K2 BTBD3-201ENST00000254977 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
KLHL30Q0D2K2 ARHGAP39-202ENST00000377307 4673 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
KLHL30Q0D2K2 SH2D2A-202ENST00000368199 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
KLHL30Q0D2K2 SEPT8-208ENST00000378721 1723 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
KLHL30Q0D2K2 MYO1D-201ENST00000318217 5563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
KLHL30Q0D2K2 ACOT12-201ENST00000307624 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
KLHL30Q0D2K2 AC107871.1-202ENST00000562767 3389 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.5
KLHL30Q0D2K2 ZNF408-201ENST00000311764 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
KLHL30Q0D2K2 LINC01502-201ENST00000445997 2471 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.5
KLHL30Q0D2K2 WASF1-207ENST00000392589 3220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
KLHL30Q0D2K2 UIMC1-201ENST00000377227 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
KLHL30Q0D2K2 BX088651.4-201ENST00000435586 2579 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
KLHL30Q0D2K2 CCDC90B-203ENST00000525503 1919 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
KLHL30Q0D2K2 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
KLHL30Q0D2K2 AGTPBP1-201ENST00000337006 4473 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
KLHL30Q0D2K2 CCDC40-201ENST00000269318 1970 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
KLHL30Q0D2K2 C2orf54-203ENST00000402775 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
KLHL30Q0D2K2 LGALS3BP-218ENST00000591778 1961 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
KLHL30Q0D2K2 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
KLHL30Q0D2K2 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
KLHL30Q0D2K2 LINC01972-201ENST00000422271 553 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
KLHL30Q0D2K2 TUBB3-205ENST00000554336 903 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
KLHL30Q0D2K2 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
KLHL30Q0D2K2 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC18.14■□□□□ 0.49
KLHL30Q0D2K2 TMEM220-203ENST00000578345 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
KLHL30Q0D2K2 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
KLHL30Q0D2K2 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
KLHL30Q0D2K2 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
KLHL30Q0D2K2 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
KLHL30Q0D2K2 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
KLHL30Q0D2K2 CD72-204ENST00000396757 2035 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
KLHL30Q0D2K2 AL513523.2-202ENST00000427283 2040 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
KLHL30Q0D2K2 ZFYVE19-203ENST00000355341 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
KLHL30Q0D2K2 SESN1-204ENST00000436639 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
KLHL30Q0D2K2 FBXO4-201ENST00000281623 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
KLHL30Q0D2K2 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
KLHL30Q0D2K2 NSFL1C-201ENST00000216879 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
KLHL30Q0D2K2 ONECUT1-201ENST00000305901 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
KLHL30Q0D2K2 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
KLHL30Q0D2K2 TRAPPC3-210ENST00000617904 1305 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
KLHL30Q0D2K2 SLK-202ENST00000369755 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
KLHL30Q0D2K2 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
KLHL30Q0D2K2 RNF31-201ENST00000324103 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
KLHL30Q0D2K2 CBWD5-204ENST00000377392 2863 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
KLHL30Q0D2K2 RGL2-247ENST00000497454 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
KLHL30Q0D2K2 ZNF451-203ENST00000370706 5268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
KLHL30Q0D2K2 TSC2-207ENST00000439673 5287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
KLHL30Q0D2K2 PPEF2-207ENST00000621010 1797 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
KLHL30Q0D2K2 TRIP10-201ENST00000313244 2153 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
KLHL30Q0D2K2 CCNC-209ENST00000520371 2186 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
KLHL30Q0D2K2 WASHC2C-204ENST00000374362 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
KLHL30Q0D2K2 BCRP2-201ENST00000398241 1842 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
KLHL30Q0D2K2 CD1E-213ENST00000444681 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
KLHL30Q0D2K2 SLC44A1-203ENST00000374724 3088 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
KLHL30Q0D2K2 ELK1-203ENST00000376983 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
KLHL30Q0D2K2 PYCR1-201ENST00000329875 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
KLHL30Q0D2K2 PCDHA1-201ENST00000378133 2726 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
KLHL30Q0D2K2 SIGLEC7-201ENST00000305628 1469 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
KLHL30Q0D2K2 FMNL3-202ENST00000352151 4006 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
KLHL30Q0D2K2 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
KLHL30Q0D2K2 SOWAHB-201ENST00000334306 3220 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
KLHL30Q0D2K2 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
KLHL30Q0D2K2 RASAL3-201ENST00000343625 3293 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
KLHL30Q0D2K2 ME2P1-201ENST00000426028 1970 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
KLHL30Q0D2K2 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
KLHL30Q0D2K2 FAM208B-201ENST00000328090 8626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
KLHL30Q0D2K2 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
KLHL30Q0D2K2 PML-215ENST00000565898 5393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
KLHL30Q0D2K2 AC136759.1-201ENST00000534201 2163 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
KLHL30Q0D2K2 GABARAPL1-205ENST00000539170 1700 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
KLHL30Q0D2K2 BTN1A1-202ENST00000613186 2266 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
KLHL30Q0D2K2 DUOXA2-201ENST00000323030 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
KLHL30Q0D2K2 RBPJ-204ENST00000348160 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
KLHL30Q0D2K2 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
KLHL30Q0D2K2 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
KLHL30Q0D2K2 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
KLHL30Q0D2K2 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
KLHL30Q0D2K2 AC103957.2-201ENST00000521218 510 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
KLHL30Q0D2K2 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
KLHL30Q0D2K2 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
KLHL30Q0D2K2 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
KLHL30Q0D2K2 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
KLHL30Q0D2K2 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
KLHL30Q0D2K2 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
KLHL30Q0D2K2 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
KLHL30Q0D2K2 DUS3L-202ENST00000320699 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
KLHL30Q0D2K2 AC006460.2-201ENST00000638173 4744 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
KLHL30Q0D2K2 KCMF1-201ENST00000409785 7568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.3 ms