Protein–RNA interactions for Protein: Q08477

CYP4F3, Docosahexaenoic acid omega-hydroxylase CYP4F3, humanhuman

Predictions only

Length 520 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYP4F3Q08477 C8orf76-201ENST00000276704 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CYP4F3Q08477 PNRC1-202ENST00000354922 1345 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CYP4F3Q08477 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CYP4F3Q08477 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CYP4F3Q08477 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CYP4F3Q08477 SYT6-205ENST00000609117 4424 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CYP4F3Q08477 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CYP4F3Q08477 KLC2-203ENST00000394066 2591 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CYP4F3Q08477 DPP9-AS1-201ENST00000381796 3071 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CYP4F3Q08477 NMRK2-201ENST00000168977 1126 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CYP4F3Q08477 YIF1B-203ENST00000339413 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CYP4F3Q08477 GPX7-201ENST00000361314 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CYP4F3Q08477 AP1S3-203ENST00000396654 830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CYP4F3Q08477 SPDYE21P-201ENST00000413323 827 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
CYP4F3Q08477 PIK3CD-AS2-201ENST00000415330 939 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CYP4F3Q08477 AC005034.1-201ENST00000426657 489 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
CYP4F3Q08477 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CYP4F3Q08477 LINC01336-202ENST00000506086 479 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CYP4F3Q08477 CCND3-213ENST00000510503 1257 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CYP4F3Q08477 WDR25-203ENST00000542471 1214 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CYP4F3Q08477 NDUFS7-216ENST00000546283 1060 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CYP4F3Q08477 CD63-210ENST00000550776 870 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CYP4F3Q08477 AC127496.4-201ENST00000571591 549 ntTSL 4 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CYP4F3Q08477 LSM12-202ENST00000585388 942 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CYP4F3Q08477 ZEB1-AS1-206ENST00000606250 573 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CYP4F3Q08477 NMRK2-205ENST00000616156 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CYP4F3Q08477 AC004877.2-201ENST00000623941 599 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
CYP4F3Q08477 TUSC3-204ENST00000506802 1546 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CYP4F3Q08477 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CYP4F3Q08477 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CYP4F3Q08477 AATK-201ENST00000326724 5257 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CYP4F3Q08477 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CYP4F3Q08477 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CYP4F3Q08477 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CYP4F3Q08477 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CYP4F3Q08477 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CYP4F3Q08477 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CYP4F3Q08477 SIGLEC16-201ENST00000599858 1437 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
CYP4F3Q08477 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CYP4F3Q08477 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CYP4F3Q08477 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CYP4F3Q08477 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CYP4F3Q08477 BDKRB2-201ENST00000539359 1600 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CYP4F3Q08477 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CYP4F3Q08477 ZBTB7C-201ENST00000535628 4818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CYP4F3Q08477 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CYP4F3Q08477 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CYP4F3Q08477 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CYP4F3Q08477 AP4S1-202ENST00000313566 839 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CYP4F3Q08477 HMGN4-201ENST00000377575 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CYP4F3Q08477 AMACR-204ENST00000382085 1195 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CYP4F3Q08477 FAM58CP-201ENST00000435741 640 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
CYP4F3Q08477 RAD51D-205ENST00000460118 1064 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CYP4F3Q08477 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CYP4F3Q08477 HCFC1R1-203ENST00000572355 610 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CYP4F3Q08477 AC087645.2-201ENST00000586321 799 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CYP4F3Q08477 AC004835.2-201ENST00000603762 682 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
CYP4F3Q08477 AL035252.4-201ENST00000624174 288 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
CYP4F3Q08477 AL118508.1-201ENST00000613502 2345 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
CYP4F3Q08477 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CYP4F3Q08477 MON2-203ENST00000546600 6130 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
CYP4F3Q08477 AC087289.2-201ENST00000587267 1419 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
CYP4F3Q08477 PUF60-201ENST00000313352 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
CYP4F3Q08477 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
CYP4F3Q08477 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
CYP4F3Q08477 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
CYP4F3Q08477 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
CYP4F3Q08477 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
CYP4F3Q08477 RAB7A-203ENST00000482525 1589 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
CYP4F3Q08477 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CYP4F3Q08477 KANK1-204ENST00000382293 5249 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CYP4F3Q08477 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CYP4F3Q08477 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CYP4F3Q08477 GMPPA-204ENST00000373908 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CYP4F3Q08477 TIMM50-220ENST00000607714 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CYP4F3Q08477 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CYP4F3Q08477 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CYP4F3Q08477 CTRB2-201ENST00000303037 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CYP4F3Q08477 THAP3-202ENST00000307896 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CYP4F3Q08477 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
CYP4F3Q08477 NQO2-203ENST00000380441 1021 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CYP4F3Q08477 HLA-DRB6-201ENST00000411500 1235 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
CYP4F3Q08477 AL109613.1-202ENST00000427243 639 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CYP4F3Q08477 NDUFAF5-203ENST00000463598 991 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CYP4F3Q08477 SEC24B-AS1-201ENST00000499359 957 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CYP4F3Q08477 SEC24B-AS1-204ENST00000510971 554 ntTSL 4 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CYP4F3Q08477 SMN2-210ENST00000511812 867 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CYP4F3Q08477 STK19B-204ENST00000512515 211 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
CYP4F3Q08477 IGHV3-65-201ENST00000523210 341 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
CYP4F3Q08477 AC069262.1-201ENST00000539058 672 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
CYP4F3Q08477 BLOC1S1-201ENST00000547076 837 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CYP4F3Q08477 AC025678.2-201ENST00000562061 970 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
CYP4F3Q08477 PDPK2P-202ENST00000562415 1191 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
CYP4F3Q08477 OAZ1-202ENST00000582888 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CYP4F3Q08477 STK25P1-201ENST00000585406 838 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
CYP4F3Q08477 FXYD1-208ENST00000589209 428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CYP4F3Q08477 AC005498.2-205ENST00000593218 784 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
CYP4F3Q08477 ZEB1-AS1-209ENST00000607455 559 ntTSL 4 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CYP4F3Q08477 FXYD1-211ENST00000612146 690 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CYP4F3Q08477 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.8 ms