Protein–RNA interactions for Protein: Q06547

GABPB1, GA-binding protein subunit beta-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 395 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABPB1Q06547 GIPC2-201ENST00000370759 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
GABPB1Q06547 ARL5B-201ENST00000377275 7196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
GABPB1Q06547 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
GABPB1Q06547 KDM5C-205ENST00000404049 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
GABPB1Q06547 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
GABPB1Q06547 TSPAN12-201ENST00000222747 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
GABPB1Q06547 PTPN5-204ENST00000396170 3871 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
GABPB1Q06547 C6orf120-201ENST00000332290 2667 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
GABPB1Q06547 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
GABPB1Q06547 SIDT1-202ENST00000393830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
GABPB1Q06547 FAM47E-STBD1-204ENST00000515604 3029 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
GABPB1Q06547 LARP4-219ENST00000614335 1949 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
GABPB1Q06547 NXPH1-201ENST00000405863 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
GABPB1Q06547 SCAMP4-202ENST00000409472 2394 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
GABPB1Q06547 FBXL12-206ENST00000588922 1843 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
GABPB1Q06547 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
GABPB1Q06547 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
GABPB1Q06547 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
GABPB1Q06547 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
GABPB1Q06547 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
GABPB1Q06547 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
GABPB1Q06547 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
GABPB1Q06547 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
GABPB1Q06547 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
GABPB1Q06547 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
GABPB1Q06547 WSCD1-201ENST00000317744 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
GABPB1Q06547 CDC42-203ENST00000400259 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
GABPB1Q06547 RUSC1-209ENST00000471876 1749 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
GABPB1Q06547 AC069224.1-201ENST00000566372 1715 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
GABPB1Q06547 PIGT-257ENST00000640210 1715 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
GABPB1Q06547 SUGP2-202ENST00000337018 3640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
GABPB1Q06547 CACTIN-203ENST00000429344 3612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
GABPB1Q06547 BAIAP2-220ENST00000575712 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
GABPB1Q06547 DESI2-202ENST00000302550 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
GABPB1Q06547 POLM-202ENST00000335195 2444 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
GABPB1Q06547 PBX3-201ENST00000342287 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
GABPB1Q06547 PCDHA10-201ENST00000307360 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
GABPB1Q06547 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
GABPB1Q06547 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
GABPB1Q06547 DSN1-203ENST00000373750 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
GABPB1Q06547 GPR37-201ENST00000303921 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
GABPB1Q06547 FBN2-205ENST00000508989 4987 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
GABPB1Q06547 TJP3-202ENST00000541714 3350 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
GABPB1Q06547 AL365209.1-201ENST00000624418 6473 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
GABPB1Q06547 LETMD1-203ENST00000418425 2123 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
GABPB1Q06547 APP-205ENST00000358918 2366 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
GABPB1Q06547 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
GABPB1Q06547 ADCY7-208ENST00000566433 2535 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
GABPB1Q06547 GPS1-228ENST00000624957 1825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
GABPB1Q06547 UBR3-201ENST00000272793 8005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
GABPB1Q06547 PEA15-202ENST00000368076 2694 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
GABPB1Q06547 AFF4-201ENST00000265343 9552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GABPB1Q06547 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GABPB1Q06547 GRB7-203ENST00000394209 1955 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
GABPB1Q06547 DEPTOR-201ENST00000286234 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GABPB1Q06547 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
GABPB1Q06547 DUOXA1-216ENST00000613425 1867 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
GABPB1Q06547 ARHGEF7-204ENST00000375736 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GABPB1Q06547 SUN2-203ENST00000406622 2725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
GABPB1Q06547 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GABPB1Q06547 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
GABPB1Q06547 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GABPB1Q06547 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GABPB1Q06547 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
GABPB1Q06547 HTR3E-202ENST00000415389 2139 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GABPB1Q06547 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
GABPB1Q06547 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
GABPB1Q06547 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC17.19■□□□□ 0.34
GABPB1Q06547 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
GABPB1Q06547 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC17.19■□□□□ 0.34
GABPB1Q06547 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC17.19■□□□□ 0.34
GABPB1Q06547 CCNL1-202ENST00000295926 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GABPB1Q06547 GREM1-202ENST00000560830 2648 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
GABPB1Q06547 AC126755.1-201ENST00000525846 6405 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
GABPB1Q06547 ARHGAP11B-210ENST00000622744 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GABPB1Q06547 AC112484.1-201ENST00000508239 2291 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
GABPB1Q06547 TMPRSS6-201ENST00000346753 3197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GABPB1Q06547 AL671710.1-201ENST00000610245 2349 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
GABPB1Q06547 ALOX15B-205ENST00000573359 1809 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GABPB1Q06547 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
GABPB1Q06547 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
GABPB1Q06547 RLIM-202ENST00000349225 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
GABPB1Q06547 DDOST-206ENST00000602624 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GABPB1Q06547 MYD88-203ENST00000417037 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GABPB1Q06547 PRDM6-201ENST00000407847 9267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GABPB1Q06547 ESRP2-202ENST00000473183 3793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GABPB1Q06547 NUTM2E-201ENST00000429984 3292 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GABPB1Q06547 NAALADL1-203ENST00000356632 2118 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GABPB1Q06547 SPIRE1-201ENST00000309836 1877 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GABPB1Q06547 PCDHA7-201ENST00000356878 2922 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GABPB1Q06547 LUC7L3-202ENST00000393227 2284 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GABPB1Q06547 FADS3-207ENST00000527697 1640 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GABPB1Q06547 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GABPB1Q06547 BCL11A-201ENST00000335712 5942 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GABPB1Q06547 RAF1-201ENST00000251849 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GABPB1Q06547 GSN-215ENST00000545652 2428 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GABPB1Q06547 PTPRS-205ENST00000588012 5993 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GABPB1Q06547 MAP3K11-208ENST00000530153 2830 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GABPB1Q06547 NFE2-202ENST00000435572 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GABPB1Q06547 IPPK-201ENST00000287996 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.9 ms