Protein–RNA interactions for Protein: Q06481

APLP2, Amyloid-like protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 763 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APLP2Q06481 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
APLP2Q06481 NFATC4-231ENST00000557451 5613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
APLP2Q06481 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
APLP2Q06481 COBL-201ENST00000265136 5291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
APLP2Q06481 MRPS12-203ENST00000407800 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
APLP2Q06481 AL354836.1-201ENST00000414042 681 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
APLP2Q06481 STARD13-205ENST00000439831 945 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
APLP2Q06481 YBX1P5-201ENST00000509441 847 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
APLP2Q06481 PTHLH-207ENST00000539239 890 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
APLP2Q06481 AC243965.1-201ENST00000557595 781 ntTSL 3 BASIC26.3■■□□□ 1.8
APLP2Q06481 AC007192.2-201ENST00000600364 463 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
APLP2Q06481 TVP23A-210ENST00000612195 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
APLP2Q06481 LINC00623-201ENST00000613486 486 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
APLP2Q06481 AL691403.2-201ENST00000618460 490 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
APLP2Q06481 IRF1-202ENST00000405885 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
APLP2Q06481 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
APLP2Q06481 RHD-207ENST00000454452 1303 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
APLP2Q06481 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
APLP2Q06481 SPSB1-202ENST00000357898 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
APLP2Q06481 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
APLP2Q06481 ASB1-201ENST00000264607 6994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
APLP2Q06481 ANTXR1-201ENST00000303714 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
APLP2Q06481 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
APLP2Q06481 RAB7A-203ENST00000482525 1589 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
APLP2Q06481 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
APLP2Q06481 AC006277.1-201ENST00000624348 1610 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
APLP2Q06481 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
APLP2Q06481 FAM19A5-204ENST00000406880 833 ntTSL 3 BASIC26.29■■□□□ 1.8
APLP2Q06481 AC087386.1-201ENST00000553658 572 ntTSL 4 BASIC26.29■■□□□ 1.8
APLP2Q06481 AC010618.3-201ENST00000596643 775 ntTSL 3 BASIC26.29■■□□□ 1.8
APLP2Q06481 AL121832.1-201ENST00000615180 677 ntTSL 3 BASIC26.29■■□□□ 1.8
APLP2Q06481 AC092902.6-201ENST00000641783 218 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
APLP2Q06481 SFN-201ENST00000339276 1320 ntAPPRIS P1 BASIC26.29■■□□□ 1.8
APLP2Q06481 RAB1A-203ENST00000409784 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
APLP2Q06481 SMTNL2-201ENST00000338859 1919 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
APLP2Q06481 NKAIN4-202ENST00000370313 1421 ntTSL 3 BASIC26.29■■□□□ 1.8
APLP2Q06481 FBP1-201ENST00000375326 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
APLP2Q06481 EYA2-201ENST00000317304 1540 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
APLP2Q06481 THTPA-203ENST00000554789 1595 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
APLP2Q06481 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
APLP2Q06481 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
APLP2Q06481 PTHLH-202ENST00000395868 1674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
APLP2Q06481 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
APLP2Q06481 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
APLP2Q06481 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
APLP2Q06481 YPEL3-203ENST00000562641 1941 ntTSL 3 BASIC26.28■■□□□ 1.8
APLP2Q06481 ABTB1-201ENST00000232744 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
APLP2Q06481 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
APLP2Q06481 NRN1L-201ENST00000339176 710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
APLP2Q06481 PDLIM7-201ENST00000355572 977 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
APLP2Q06481 RNU1-129P-201ENST00000384064 167 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
APLP2Q06481 AFG3L1P-209ENST00000429663 458 ntTSL 3 BASIC26.28■■□□□ 1.8
APLP2Q06481 AL160408.2-201ENST00000436039 693 ntTSL 3 BASIC26.28■■□□□ 1.8
APLP2Q06481 AC004967.1-201ENST00000453589 447 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
APLP2Q06481 MRFAP1-203ENST00000507420 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.28■■□□□ 1.8
APLP2Q06481 GMDS-AS1-205ENST00000529893 900 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
APLP2Q06481 MVB12A-211ENST00000529939 1091 ntTSL 3 BASIC26.28■■□□□ 1.8
APLP2Q06481 U1.21-201ENST00000580816 167 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
APLP2Q06481 ZNF773-202ENST00000593916 548 ntTSL 3 BASIC26.28■■□□□ 1.8
APLP2Q06481 CITED2-204ENST00000618718 901 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
APLP2Q06481 AC134684.3-201ENST00000641758 218 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
APLP2Q06481 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
APLP2Q06481 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
APLP2Q06481 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
APLP2Q06481 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
APLP2Q06481 SIRT6-214ENST00000601488 1361 ntTSL 3 BASIC26.28■■□□□ 1.8
APLP2Q06481 GMPPA-202ENST00000341142 1524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
APLP2Q06481 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
APLP2Q06481 ENOSF1-202ENST00000340116 1658 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
APLP2Q06481 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
APLP2Q06481 BNIP2-212ENST00000607373 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
APLP2Q06481 TTBK2-208ENST00000622375 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
APLP2Q06481 CR392000.2-201ENST00000640235 1994 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
APLP2Q06481 IGSF8-205ENST00000614243 2191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
APLP2Q06481 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
APLP2Q06481 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
APLP2Q06481 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
APLP2Q06481 BAX-203ENST00000354470 433 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
APLP2Q06481 HIST1H3D-201ENST00000356476 411 ntAPPRIS P1 BASIC26.27■■□□□ 1.8
APLP2Q06481 MRPL55-208ENST00000366734 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
APLP2Q06481 MRPL55-217ENST00000366746 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
APLP2Q06481 TEX30-206ENST00000376032 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
APLP2Q06481 PARK7-203ENST00000377491 977 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.27■■□□□ 1.8
APLP2Q06481 TM4SF19-204ENST00000454715 1061 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
APLP2Q06481 SNCA-209ENST00000506244 570 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
APLP2Q06481 AP000777.2-201ENST00000539897 501 ntTSL 4 BASIC26.27■■□□□ 1.8
APLP2Q06481 LINC01413-201ENST00000564843 772 ntTSL 3 BASIC26.27■■□□□ 1.8
APLP2Q06481 FXYD1-208ENST00000589209 428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
APLP2Q06481 AL009183.1-201ENST00000603760 355 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
APLP2Q06481 AC013467.2-201ENST00000605472 835 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
APLP2Q06481 AL031055.1-201ENST00000606362 631 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
APLP2Q06481 FXYD1-211ENST00000612146 690 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.27■■□□□ 1.8
APLP2Q06481 KLK5-203ENST00000593428 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
APLP2Q06481 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
APLP2Q06481 CD1D-201ENST00000368171 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
APLP2Q06481 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
APLP2Q06481 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC26.27■■□□□ 1.8
APLP2Q06481 SUFU-202ENST00000369902 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
APLP2Q06481 PLCD3-212ENST00000619929 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
APLP2Q06481 LINC00094-205ENST00000603928 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.1 ms