Protein–RNA interactions for Protein: Q02487

DSC2, Desmocollin-2, humanhuman

Predictions only

Length 901 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DSC2Q02487 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
DSC2Q02487 FANCA-203ENST00000389302 1641 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
DSC2Q02487 CDIP1-207ENST00000564828 1636 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
DSC2Q02487 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
DSC2Q02487 PKLR-201ENST00000342741 2083 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
DSC2Q02487 AC119396.1-201ENST00000576789 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
DSC2Q02487 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
DSC2Q02487 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
DSC2Q02487 AL671710.1-201ENST00000610245 2349 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
DSC2Q02487 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
DSC2Q02487 RER1-202ENST00000378512 1404 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
DSC2Q02487 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
DSC2Q02487 SNX33P1-201ENST00000592116 1762 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
DSC2Q02487 URAHP-203ENST00000517889 1381 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
DSC2Q02487 LCA10-201ENST00000618311 1392 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
DSC2Q02487 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
DSC2Q02487 C2orf27A-205ENST00000624391 1335 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
DSC2Q02487 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
DSC2Q02487 RGS3-206ENST00000374136 2092 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
DSC2Q02487 CSNK1A1L-201ENST00000379800 2406 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
DSC2Q02487 PPA2-201ENST00000341695 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
DSC2Q02487 WLS-202ENST00000354777 2037 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
DSC2Q02487 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
DSC2Q02487 MRNIP-201ENST00000292586 1238 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
DSC2Q02487 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
DSC2Q02487 HS6ST1P1-201ENST00000481504 1234 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
DSC2Q02487 BX890604.1-208ENST00000490920 726 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
DSC2Q02487 MRVI1-AS1-203ENST00000529979 784 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
DSC2Q02487 SEC23A-206ENST00000553970 574 ntTSL 4 BASIC17.05■□□□□ 0.32
DSC2Q02487 GIPC1-213ENST00000591349 1068 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
DSC2Q02487 AC140113.2-201ENST00000604370 208 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
DSC2Q02487 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
DSC2Q02487 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
DSC2Q02487 ATXN2-219ENST00000550104 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
DSC2Q02487 HLA-A-202ENST00000376806 1854 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
DSC2Q02487 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
DSC2Q02487 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
DSC2Q02487 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
DSC2Q02487 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
DSC2Q02487 BCAT2-209ENST00000599246 1449 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
DSC2Q02487 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
DSC2Q02487 MAN1C1-201ENST00000263979 2627 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
DSC2Q02487 TDRD7-201ENST00000355295 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
DSC2Q02487 WDR90-209ENST00000547944 1672 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
DSC2Q02487 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
DSC2Q02487 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
DSC2Q02487 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
DSC2Q02487 FAM131A-207ENST00000450976 1335 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
DSC2Q02487 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
DSC2Q02487 CRADD-201ENST00000332896 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
DSC2Q02487 ICAM2-202ENST00000418105 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
DSC2Q02487 MED15P5-201ENST00000423150 992 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
DSC2Q02487 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
DSC2Q02487 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
DSC2Q02487 AL133375.1-201ENST00000500590 980 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
DSC2Q02487 IL18BP-211ENST00000531053 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
DSC2Q02487 TPD52L1-211ENST00000532429 1022 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
DSC2Q02487 AP005019.1-201ENST00000545254 664 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
DSC2Q02487 CD63-210ENST00000550776 870 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
DSC2Q02487 AC096734.2-201ENST00000562054 433 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
DSC2Q02487 ANAPC11-210ENST00000574924 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
DSC2Q02487 ICAM2-208ENST00000579788 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
DSC2Q02487 CYP2A7P1-201ENST00000595391 815 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
DSC2Q02487 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
DSC2Q02487 AC112229.1-202ENST00000490013 2918 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
DSC2Q02487 TVP23C-201ENST00000225576 1527 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
DSC2Q02487 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
DSC2Q02487 HARS-203ENST00000431330 1774 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
DSC2Q02487 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
DSC2Q02487 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
DSC2Q02487 ANAPC13-206ENST00000514612 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
DSC2Q02487 OS9-205ENST00000413095 1660 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
DSC2Q02487 ANKRD23-203ENST00000418232 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
DSC2Q02487 TRPC6-202ENST00000348423 2448 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
DSC2Q02487 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
DSC2Q02487 ZNF133-205ENST00000401790 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
DSC2Q02487 ZNF133-206ENST00000402618 2622 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
DSC2Q02487 TOM1-210ENST00000449058 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
DSC2Q02487 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
DSC2Q02487 GLOD4-202ENST00000301329 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
DSC2Q02487 FLYWCH1-203ENST00000416288 4963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
DSC2Q02487 AC073957.2-201ENST00000549241 1562 ntTSL 4 BASIC17.03■□□□□ 0.32
DSC2Q02487 THTPA-203ENST00000554789 1595 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
DSC2Q02487 ZFAND6-211ENST00000559157 1559 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
DSC2Q02487 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
DSC2Q02487 BEND4-203ENST00000611697 1348 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
DSC2Q02487 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
DSC2Q02487 STK32C-204ENST00000368622 2010 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
DSC2Q02487 AC079328.2-201ENST00000561241 3354 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
DSC2Q02487 ABTB1-201ENST00000232744 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
DSC2Q02487 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
DSC2Q02487 BEX3-201ENST00000361298 921 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
DSC2Q02487 PLA2G16-203ENST00000415826 1099 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
DSC2Q02487 BATF2-204ENST00000527716 1230 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
DSC2Q02487 CYB561D1-208ENST00000528785 1271 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
DSC2Q02487 AC025162.1-201ENST00000554022 565 ntTSL 4 BASIC17.03■□□□□ 0.32
DSC2Q02487 AC087641.1-201ENST00000557561 1021 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
DSC2Q02487 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
DSC2Q02487 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
DSC2Q02487 AC027601.4-201ENST00000611259 610 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.1 ms