Protein–RNA interactions for Protein: Q01892

SPIB, Transcription factor Spi-B, humanhuman

Predictions only

Length 262 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPIBQ01892 TICAM2-201ENST00000427199 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SPIBQ01892 HNF1A-215ENST00000615446 2344 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SPIBQ01892 NSMF-205ENST00000371474 3571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SPIBQ01892 NSMF-208ENST00000437259 3577 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SPIBQ01892 TTYH2-206ENST00000529107 2015 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SPIBQ01892 ELMSAN1-201ENST00000286523 8091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SPIBQ01892 CTCF-201ENST00000264010 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SPIBQ01892 PEA15-202ENST00000368076 2694 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SPIBQ01892 AEBP1-206ENST00000450684 2571 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SPIBQ01892 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SPIBQ01892 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SPIBQ01892 PSD-201ENST00000020673 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SPIBQ01892 SAP130-203ENST00000357702 4173 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SPIBQ01892 PI16-201ENST00000373674 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SPIBQ01892 KIF3A-202ENST00000378746 6325 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
SPIBQ01892 TINF2-208ENST00000558566 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
SPIBQ01892 SLC17A7-204ENST00000600601 2237 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
SPIBQ01892 CSAD-208ENST00000444623 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SPIBQ01892 GATA3-201ENST00000346208 2654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SPIBQ01892 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SPIBQ01892 NR2C1-201ENST00000330677 2014 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
SPIBQ01892 AL021920.2-201ENST00000624828 1351 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
SPIBQ01892 SYBU-209ENST00000446070 2919 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SPIBQ01892 NR2C1-203ENST00000393101 1822 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SPIBQ01892 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SPIBQ01892 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SPIBQ01892 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SPIBQ01892 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
SPIBQ01892 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
SPIBQ01892 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
SPIBQ01892 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SPIBQ01892 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
SPIBQ01892 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
SPIBQ01892 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
SPIBQ01892 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
SPIBQ01892 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
SPIBQ01892 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.67■□□□□ 0.1
SPIBQ01892 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
SPIBQ01892 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
SPIBQ01892 IQCC-202ENST00000537469 2252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SPIBQ01892 KCNJ12-201ENST00000331718 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SPIBQ01892 C12orf66-204ENST00000544871 2441 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
SPIBQ01892 TGIF1-201ENST00000330513 1980 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SPIBQ01892 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SPIBQ01892 AFTPH-201ENST00000238855 4113 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
SPIBQ01892 MDFIC-202ENST00000393486 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SPIBQ01892 PPAN-P2RY11-202ENST00000428358 2661 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
SPIBQ01892 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SPIBQ01892 OSBPL9-222ENST00000531828 2210 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
SPIBQ01892 APLNR-203ENST00000611099 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SPIBQ01892 UNC13A-204ENST00000550896 5200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
SPIBQ01892 AMN1-201ENST00000281471 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SPIBQ01892 DLG4-201ENST00000302955 3184 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
SPIBQ01892 SEMA7A-201ENST00000261918 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SPIBQ01892 FYCO1-205ENST00000535325 8578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
SPIBQ01892 SHMT2-232ENST00000557487 1918 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SPIBQ01892 GALE-216ENST00000617979 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SPIBQ01892 NORAD-201ENST00000565493 5339 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
SPIBQ01892 ZNF84-208ENST00000539354 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SPIBQ01892 PDE3A-201ENST00000359062 7576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SPIBQ01892 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SPIBQ01892 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
SPIBQ01892 SPOCK2-202ENST00000373109 5445 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SPIBQ01892 MTCL1-203ENST00000400050 6042 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
SPIBQ01892 MYB-242ENST00000618728 3545 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
SPIBQ01892 CCDC40-201ENST00000269318 1970 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
SPIBQ01892 BCAS3-204ENST00000585744 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
SPIBQ01892 SEC14L4-201ENST00000255858 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SPIBQ01892 AC005052.1-201ENST00000625181 2492 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
SPIBQ01892 AVL9-201ENST00000318709 6982 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
SPIBQ01892 ORMDL3-201ENST00000304046 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SPIBQ01892 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SPIBQ01892 PSMA7-201ENST00000370858 925 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
SPIBQ01892 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SPIBQ01892 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SPIBQ01892 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
SPIBQ01892 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
SPIBQ01892 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SPIBQ01892 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SPIBQ01892 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
SPIBQ01892 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
SPIBQ01892 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
SPIBQ01892 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
SPIBQ01892 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
SPIBQ01892 HLA-J-202ENST00000469281 1241 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
SPIBQ01892 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
SPIBQ01892 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
SPIBQ01892 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
SPIBQ01892 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
SPIBQ01892 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC15.66■□□□□ 0.1
SPIBQ01892 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
SPIBQ01892 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SPIBQ01892 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
SPIBQ01892 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
SPIBQ01892 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
SPIBQ01892 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
SPIBQ01892 NKIRAS1-208ENST00000443659 2391 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
SPIBQ01892 ZNF57-201ENST00000306908 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SPIBQ01892 ZNF57-205ENST00000614108 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
SPIBQ01892 TDRKH-202ENST00000368823 2751 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.3 ms