Protein–RNA interactions for Protein: Q01860

POU5F1, POU domain, class 5, transcription factor 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 360 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POU5F1Q01860 SSB-202ENST00000409333 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
POU5F1Q01860 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
POU5F1Q01860 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
POU5F1Q01860 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
POU5F1Q01860 ALDH3A1-212ENST00000494157 1572 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
POU5F1Q01860 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
POU5F1Q01860 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
POU5F1Q01860 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
POU5F1Q01860 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
POU5F1Q01860 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
POU5F1Q01860 GPS1-228ENST00000624957 1825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
POU5F1Q01860 MRGPRD-201ENST00000309106 966 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
POU5F1Q01860 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
POU5F1Q01860 ANP32E-201ENST00000369114 1048 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
POU5F1Q01860 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
POU5F1Q01860 AC002056.1-201ENST00000395613 760 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
POU5F1Q01860 UPF3AP3-201ENST00000420996 769 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
POU5F1Q01860 CR559946.1-201ENST00000453835 531 ntTSL 4 BASIC18.22■□□□□ 0.51
POU5F1Q01860 AL807752.3-201ENST00000456356 748 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
POU5F1Q01860 YBX1P5-201ENST00000509441 847 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
POU5F1Q01860 MARVELD3-206ENST00000567566 850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
POU5F1Q01860 RPL27-206ENST00000589913 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
POU5F1Q01860 ZEB1-AS1-206ENST00000606250 573 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
POU5F1Q01860 SMN2-216ENST00000638794 846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
POU5F1Q01860 GGT6-203ENST00000573591 1730 ntTSL 4 BASIC18.22■□□□□ 0.51
POU5F1Q01860 SDCBP-201ENST00000260130 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
POU5F1Q01860 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
POU5F1Q01860 SCAI-202ENST00000373549 1968 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
POU5F1Q01860 COQ7-201ENST00000321998 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
POU5F1Q01860 PHGDH-223ENST00000641597 2585 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
POU5F1Q01860 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
POU5F1Q01860 STARD3NL-204ENST00000434197 1341 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
POU5F1Q01860 WDR90-209ENST00000547944 1672 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
POU5F1Q01860 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
POU5F1Q01860 CALD1-204ENST00000417172 1915 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
POU5F1Q01860 GLS2-216ENST00000610413 2296 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
POU5F1Q01860 GLOD4-202ENST00000301329 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
POU5F1Q01860 ZBP1-202ENST00000395822 2073 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
POU5F1Q01860 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
POU5F1Q01860 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
POU5F1Q01860 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
POU5F1Q01860 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
POU5F1Q01860 RNF151-201ENST00000321392 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
POU5F1Q01860 IFNL1-201ENST00000333625 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
POU5F1Q01860 AMACR-204ENST00000382085 1195 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
POU5F1Q01860 RNU1-129P-201ENST00000384064 167 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
POU5F1Q01860 EXOSC8-202ENST00000389704 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
POU5F1Q01860 COA5-202ENST00000409997 557 ntTSL 4 BASIC18.21■□□□□ 0.51
POU5F1Q01860 STARD13-205ENST00000439831 945 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
POU5F1Q01860 EHMT1-216ENST00000493484 1182 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
POU5F1Q01860 AC112191.1-201ENST00000523689 701 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
POU5F1Q01860 HAGH-208ENST00000566709 1291 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
POU5F1Q01860 RNF151-203ENST00000569714 796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
POU5F1Q01860 U1.21-201ENST00000580816 167 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
POU5F1Q01860 TEX264-216ENST00000614067 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
POU5F1Q01860 AC104581.1-203ENST00000640240 353 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
POU5F1Q01860 HSD17B6-203ENST00000554150 1547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
POU5F1Q01860 HARS-204ENST00000438307 1789 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
POU5F1Q01860 ALDH3A1-205ENST00000444455 1771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
POU5F1Q01860 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
POU5F1Q01860 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
POU5F1Q01860 HOXA5-201ENST00000222726 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
POU5F1Q01860 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
POU5F1Q01860 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
POU5F1Q01860 SARS2-201ENST00000221431 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
POU5F1Q01860 ZMYM3-203ENST00000373981 1841 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
POU5F1Q01860 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
POU5F1Q01860 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
POU5F1Q01860 TBX4-201ENST00000240335 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
POU5F1Q01860 TMEM143-202ENST00000377431 1960 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
POU5F1Q01860 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
POU5F1Q01860 PAK4-203ENST00000360442 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
POU5F1Q01860 SMUG1-209ENST00000505128 2607 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
POU5F1Q01860 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
POU5F1Q01860 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
POU5F1Q01860 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
POU5F1Q01860 ESR2-205ENST00000358599 1899 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
POU5F1Q01860 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
POU5F1Q01860 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
POU5F1Q01860 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
POU5F1Q01860 PPIC-201ENST00000306442 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
POU5F1Q01860 PRR22-202ENST00000419421 1392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
POU5F1Q01860 TOM1L1-204ENST00000570371 2442 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
POU5F1Q01860 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
POU5F1Q01860 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
POU5F1Q01860 LYPD5-203ENST00000594013 1519 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
POU5F1Q01860 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
POU5F1Q01860 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
POU5F1Q01860 PTHLH-202ENST00000395868 1674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
POU5F1Q01860 C19orf70-201ENST00000309324 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
POU5F1Q01860 SLC2A8-201ENST00000373352 914 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
POU5F1Q01860 RPSAP43-201ENST00000402237 625 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
POU5F1Q01860 AC092474.2-201ENST00000424288 719 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
POU5F1Q01860 GPX1P2-201ENST00000429271 606 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
POU5F1Q01860 WDR53-204ENST00000433160 887 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
POU5F1Q01860 PIGBOS1-201ENST00000436697 866 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
POU5F1Q01860 TTC31-205ENST00000442235 958 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
POU5F1Q01860 FIS1-203ENST00000442303 631 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
POU5F1Q01860 TM4SF19-204ENST00000454715 1061 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
POU5F1Q01860 HELT-204ENST00000515777 841 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.6 ms