Protein–RNA interactions for Protein: Q00978

IRF9, Interferon regulatory factor 9, humanhuman

Predictions only

Length 393 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRF9Q00978 YTHDF1-202ENST00000370339 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
IRF9Q00978 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
IRF9Q00978 SLC27A5-201ENST00000263093 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
IRF9Q00978 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
IRF9Q00978 PNMA6E-202ENST00000633844 2596 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.26
IRF9Q00978 SYT6-205ENST00000609117 4424 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
IRF9Q00978 PAUPAR-201ENST00000630360 2965 ntBASIC16.71■□□□□ 0.26
IRF9Q00978 DLG4-201ENST00000302955 3184 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
IRF9Q00978 MAPK8IP2-202ENST00000329492 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
IRF9Q00978 NTRK2-207ENST00000376214 5608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
IRF9Q00978 CORO2B-201ENST00000261861 3569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
IRF9Q00978 CORO2B-204ENST00000566799 3566 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
IRF9Q00978 ITSN2-201ENST00000355123 6300 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
IRF9Q00978 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
IRF9Q00978 NCF1C-201ENST00000438382 1427 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
IRF9Q00978 VEPH1-218ENST00000494677 1714 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
IRF9Q00978 COQ8B-202ENST00000324464 2443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
IRF9Q00978 WDR81-204ENST00000419248 3315 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
IRF9Q00978 GSAP-201ENST00000257626 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
IRF9Q00978 KEAP1-201ENST00000171111 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
IRF9Q00978 ARVCF-204ENST00000406522 2682 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
IRF9Q00978 CCDC83-201ENST00000280245 2358 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
IRF9Q00978 SARDH-205ENST00000422262 2367 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
IRF9Q00978 SLC6A9-204ENST00000372307 2162 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
IRF9Q00978 NUCB1-202ENST00000407032 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
IRF9Q00978 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
IRF9Q00978 RBPJ-204ENST00000348160 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
IRF9Q00978 PAX3-207ENST00000409551 1782 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
IRF9Q00978 PSMC5-202ENST00000375812 1494 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
IRF9Q00978 AC083864.1-201ENST00000381493 1497 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
IRF9Q00978 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
IRF9Q00978 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
IRF9Q00978 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
IRF9Q00978 PRYP5-201ENST00000451909 266 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
IRF9Q00978 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
IRF9Q00978 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
IRF9Q00978 ITGB1BP1-205ENST00000456913 1043 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
IRF9Q00978 ITGB1BP1-216ENST00000488451 874 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
IRF9Q00978 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
IRF9Q00978 BLOC1S6-202ENST00000562384 494 ntTSL 4 BASIC16.7■□□□□ 0.26
IRF9Q00978 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
IRF9Q00978 MIR22HG-204ENST00000571595 767 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
IRF9Q00978 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC16.7■□□□□ 0.26
IRF9Q00978 TNFRSF13B-206ENST00000583789 859 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
IRF9Q00978 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
IRF9Q00978 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
IRF9Q00978 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
IRF9Q00978 CCT6A-202ENST00000335503 2529 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
IRF9Q00978 AL671710.1-201ENST00000610245 2349 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
IRF9Q00978 MXI1-202ENST00000332674 3470 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
IRF9Q00978 OSGIN1-203ENST00000393306 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
IRF9Q00978 BCRP2-201ENST00000398241 1842 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
IRF9Q00978 DYRK1B-205ENST00000597639 1806 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
IRF9Q00978 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
IRF9Q00978 FAM104A-202ENST00000405159 2865 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
IRF9Q00978 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
IRF9Q00978 TSPAN4-205ENST00000397406 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
IRF9Q00978 CAPRIN1-207ENST00000529307 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
IRF9Q00978 EIF2AK4-201ENST00000263791 5499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
IRF9Q00978 AC004233.2-201ENST00000573315 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
IRF9Q00978 JADE2-201ENST00000282605 2748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
IRF9Q00978 SNX33P1-201ENST00000592116 1762 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
IRF9Q00978 AC105760.2-201ENST00000418430 2341 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
IRF9Q00978 NR2C1-201ENST00000330677 2014 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
IRF9Q00978 PACS1-201ENST00000320580 4392 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
IRF9Q00978 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
IRF9Q00978 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
IRF9Q00978 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
IRF9Q00978 AC013467.2-201ENST00000605472 835 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
IRF9Q00978 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
IRF9Q00978 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
IRF9Q00978 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
IRF9Q00978 AL022326.1-202ENST00000641533 845 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
IRF9Q00978 SIL1-213ENST00000509534 1714 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
IRF9Q00978 VWA1-203ENST00000476993 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
IRF9Q00978 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
IRF9Q00978 CBSL-201ENST00000398168 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
IRF9Q00978 GMPPB-201ENST00000308375 3217 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
IRF9Q00978 APLN-201ENST00000429967 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
IRF9Q00978 AL121845.3-201ENST00000490623 3119 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
IRF9Q00978 STARD7-201ENST00000337288 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
IRF9Q00978 NUTM2F-201ENST00000253262 2561 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
IRF9Q00978 ARFGAP1-220ENST00000547204 1327 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
IRF9Q00978 PGR-209ENST00000617858 2816 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
IRF9Q00978 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
IRF9Q00978 DUSP8-201ENST00000331588 4455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
IRF9Q00978 NFKBIA-201ENST00000216797 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
IRF9Q00978 IL11-201ENST00000264563 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
IRF9Q00978 LTK-204ENST00000561619 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
IRF9Q00978 CYP4F22-202ENST00000601005 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
IRF9Q00978 EPHX2-201ENST00000380476 2064 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
IRF9Q00978 ZSCAN2-214ENST00000546148 2242 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
IRF9Q00978 BRD2-201ENST00000374825 4894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
IRF9Q00978 BTN3A1-204ENST00000425234 1882 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
IRF9Q00978 SIGLEC10-205ENST00000439889 2126 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
IRF9Q00978 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
IRF9Q00978 UCHL1-204ENST00000503431 917 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
IRF9Q00978 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
IRF9Q00978 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
IRF9Q00978 AC002091.2-201ENST00000585297 402 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.4 ms