Protein–RNA interactions for Protein: Q00059

TFAM, Transcription factor A, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 246 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TFAMQ00059 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TFAMQ00059 NFATC2-206ENST00000609943 5690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TFAMQ00059 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TFAMQ00059 CD99L2-202ENST00000355149 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TFAMQ00059 HMGN4-201ENST00000377575 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TFAMQ00059 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TFAMQ00059 MCCD1P2-201ENST00000423228 335 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
TFAMQ00059 AC013270.1-201ENST00000425578 440 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TFAMQ00059 AC105202.1-202ENST00000522060 834 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TFAMQ00059 AC005606.1-201ENST00000567515 504 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TFAMQ00059 MIR4492-201ENST00000581627 80 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
TFAMQ00059 AC010327.4-202ENST00000591484 748 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
TFAMQ00059 MTDHP5-201ENST00000598980 586 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
TFAMQ00059 SMN2-216ENST00000638794 846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TFAMQ00059 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TFAMQ00059 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TFAMQ00059 AC092919.2-201ENST00000623631 1645 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
TFAMQ00059 NPM2-209ENST00000521157 1484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TFAMQ00059 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TFAMQ00059 CORO6-202ENST00000388767 2397 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TFAMQ00059 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TFAMQ00059 TEAD4-202ENST00000359864 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TFAMQ00059 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TFAMQ00059 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TFAMQ00059 AL391256.1-201ENST00000443260 1855 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
TFAMQ00059 FCGBP-203ENST00000620799 4926 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TFAMQ00059 EYA2-201ENST00000317304 1540 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TFAMQ00059 IQCE-217ENST00000623361 6775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TFAMQ00059 ASB1-201ENST00000264607 6994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TFAMQ00059 TATDN3-214ENST00000532324 1381 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TFAMQ00059 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TFAMQ00059 SLFNL1-205ENST00000439569 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TFAMQ00059 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TFAMQ00059 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TFAMQ00059 TTC24-202ENST00000368237 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TFAMQ00059 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TFAMQ00059 SPERT-201ENST00000310521 1613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TFAMQ00059 AC006277.1-201ENST00000624348 1610 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
TFAMQ00059 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TFAMQ00059 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TFAMQ00059 VAV2-202ENST00000371851 5101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TFAMQ00059 KRT18P13-201ENST00000400056 1290 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
TFAMQ00059 CDK2AP2P3-201ENST00000422476 372 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
TFAMQ00059 IL32-212ENST00000526464 1198 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TFAMQ00059 IL32-217ENST00000530538 674 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TFAMQ00059 CYP2A7P1-201ENST00000595391 815 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
TFAMQ00059 AC068137.2-201ENST00000605408 478 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
TFAMQ00059 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TFAMQ00059 TCP1-203ENST00000420894 1671 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TFAMQ00059 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TFAMQ00059 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TFAMQ00059 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TFAMQ00059 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TFAMQ00059 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TFAMQ00059 C4orf50-202ENST00000531445 6860 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TFAMQ00059 RECK-201ENST00000377966 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TFAMQ00059 RDH13-202ENST00000396247 1987 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TFAMQ00059 RPS6KB1-203ENST00000406116 1982 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TFAMQ00059 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TFAMQ00059 TEX264-202ENST00000395057 1555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TFAMQ00059 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TFAMQ00059 SLAIN2-201ENST00000264313 6299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TFAMQ00059 SPOP-201ENST00000347630 2965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
TFAMQ00059 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
TFAMQ00059 CROCCP1-201ENST00000426910 5675 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
TFAMQ00059 ASTN2-205ENST00000361209 4622 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TFAMQ00059 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TFAMQ00059 ATP23-201ENST00000300145 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TFAMQ00059 SPACA4-201ENST00000321762 972 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
TFAMQ00059 TMEM44-201ENST00000330115 1278 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TFAMQ00059 ANP32E-201ENST00000369114 1048 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
TFAMQ00059 PRR29-203ENST00000425164 1266 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
TFAMQ00059 AL049569.1-201ENST00000446261 636 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
TFAMQ00059 DNAJB3-201ENST00000446806 729 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
TFAMQ00059 HOXC-AS3-202ENST00000513165 533 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
TFAMQ00059 AP002490.2-201ENST00000524791 560 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
TFAMQ00059 AP005233.2-201ENST00000561588 372 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
TFAMQ00059 SLC25A3P1-206ENST00000569142 925 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TFAMQ00059 AC007193.2-201ENST00000596807 472 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
TFAMQ00059 AL078644.1-201ENST00000609881 752 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
TFAMQ00059 HOTTIP_1.1-201ENST00000620415 57 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
TFAMQ00059 ZNRF3-201ENST00000402174 2667 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
TFAMQ00059 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TFAMQ00059 CNTNAP3-201ENST00000297668 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TFAMQ00059 ARID1A-205ENST00000457599 6268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
TFAMQ00059 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TFAMQ00059 ZNF57-201ENST00000306908 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TFAMQ00059 ZNF57-205ENST00000614108 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
TFAMQ00059 RRM2B-201ENST00000251810 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TFAMQ00059 TTBK2-208ENST00000622375 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TFAMQ00059 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TFAMQ00059 ZFYVE19-203ENST00000355341 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TFAMQ00059 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TFAMQ00059 ALDH2-202ENST00000416293 1572 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
TFAMQ00059 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
TFAMQ00059 UBAC2-203ENST00000403766 1375 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
TFAMQ00059 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
TFAMQ00059 LINC00895-201ENST00000629028 1637 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
TFAMQ00059 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TFAMQ00059 BLOC1S5-202ENST00000397457 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.7 ms