Protein–RNA interactions for Protein: P51531

SMARCA2, Probable global transcription activator SNF2L2, humanhuman

Predictions only

Length 1,590 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCA2P51531 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
SMARCA2P51531 NCALD-217ENST00000521599 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
SMARCA2P51531 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
SMARCA2P51531 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
SMARCA2P51531 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC29.36■■■□□ 2.29
SMARCA2P51531 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
SMARCA2P51531 AC020915.1-201ENST00000413518 1469 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
SMARCA2P51531 TMEM91-202ENST00000356385 944 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
SMARCA2P51531 AC099336.1-201ENST00000417053 1171 ntBASIC29.36■■■□□ 2.29
SMARCA2P51531 AL033527.5-201ENST00000641382 801 ntBASIC29.36■■■□□ 2.29
SMARCA2P51531 CALD1-204ENST00000417172 1915 ntTSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
SMARCA2P51531 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
SMARCA2P51531 TUBB8P12-201ENST00000308911 1335 ntBASIC29.36■■■□□ 2.29
SMARCA2P51531 TUBB7P-202ENST00000428444 1305 ntBASIC29.36■■■□□ 2.29
SMARCA2P51531 TUBB8P7-204ENST00000567960 1332 ntBASIC29.36■■■□□ 2.29
SMARCA2P51531 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
SMARCA2P51531 TMEM150A-203ENST00000409668 1776 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
SMARCA2P51531 ALDH3A1-212ENST00000494157 1572 ntTSL 3 BASIC29.36■■■□□ 2.29
SMARCA2P51531 BIN3-201ENST00000276416 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
SMARCA2P51531 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
SMARCA2P51531 CLK3P2-201ENST00000427566 1453 ntBASIC29.35■■■□□ 2.29
SMARCA2P51531 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
SMARCA2P51531 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
SMARCA2P51531 GBGT1-202ENST00000372038 847 ntTSL 3 BASIC29.35■■■□□ 2.29
SMARCA2P51531 SPEG-202ENST00000396686 1086 ntTSL 3 BASIC29.35■■■□□ 2.29
SMARCA2P51531 AL162431.1-201ENST00000434447 543 ntTSL 3 BASIC29.35■■■□□ 2.29
SMARCA2P51531 MIR6069-201ENST00000620069 79 ntBASIC29.35■■■□□ 2.29
SMARCA2P51531 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC29.35■■■□□ 2.29
SMARCA2P51531 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
SMARCA2P51531 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
SMARCA2P51531 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC29.35■■■□□ 2.29
SMARCA2P51531 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
SMARCA2P51531 FDPS-201ENST00000356657 1478 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
SMARCA2P51531 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
SMARCA2P51531 TM6SF2-201ENST00000389363 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
SMARCA2P51531 SCP2-201ENST00000371509 1889 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
SMARCA2P51531 C1QC-202ENST00000374639 1183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.35■■■□□ 2.29
SMARCA2P51531 LINC01939-201ENST00000445279 694 ntTSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
SMARCA2P51531 AP000345.1-201ENST00000454863 569 ntTSL 4 BASIC29.35■■■□□ 2.29
SMARCA2P51531 SNAP25-AS1-208ENST00000605592 556 ntTSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
SMARCA2P51531 GPR182-203ENST00000622922 591 ntBASIC29.35■■■□□ 2.29
SMARCA2P51531 FUT5-201ENST00000252675 1916 ntAPPRIS P1 BASIC29.35■■■□□ 2.29
SMARCA2P51531 YPEL3-203ENST00000562641 1941 ntTSL 3 BASIC29.35■■■□□ 2.29
SMARCA2P51531 AL671710.1-201ENST00000610245 2349 ntBASIC29.34■■■□□ 2.29
SMARCA2P51531 FAM49B-224ENST00000522941 1700 ntTSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
SMARCA2P51531 MFNG-201ENST00000356998 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
SMARCA2P51531 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
SMARCA2P51531 PDCD5-203ENST00000419343 1799 ntTSL 2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
SMARCA2P51531 UBA6-AS1-201ENST00000498917 1445 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
SMARCA2P51531 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
SMARCA2P51531 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
SMARCA2P51531 MORN2-204ENST00000409665 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
SMARCA2P51531 AC087612.1-201ENST00000560238 658 ntTSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
SMARCA2P51531 RARRES2P5-201ENST00000564013 466 ntBASIC29.34■■■□□ 2.29
SMARCA2P51531 AC123786.1-201ENST00000581626 661 ntTSL 3 BASIC29.34■■■□□ 2.29
SMARCA2P51531 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
SMARCA2P51531 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
SMARCA2P51531 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
SMARCA2P51531 MRPS21-201ENST00000581066 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
SMARCA2P51531 EYA2-201ENST00000317304 1540 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
SMARCA2P51531 GSKIP-201ENST00000438650 2140 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.33■■■□□ 2.29
SMARCA2P51531 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC29.33■■■□□ 2.29
SMARCA2P51531 EIF4A3-201ENST00000269349 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
SMARCA2P51531 CDC14C-201ENST00000428251 1719 ntBASIC29.33■■■□□ 2.29
SMARCA2P51531 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.33■■■□□ 2.29
SMARCA2P51531 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.33■■■□□ 2.29
SMARCA2P51531 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC29.33■■■□□ 2.29
SMARCA2P51531 PLAC9-201ENST00000372263 785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
SMARCA2P51531 APOC3-202ENST00000375345 604 ntTSL 5 BASIC29.33■■■□□ 2.29
SMARCA2P51531 MDP1-202ENST00000396833 582 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
SMARCA2P51531 P3H2-AS1-201ENST00000412203 730 ntTSL 5 BASIC29.33■■■□□ 2.29
SMARCA2P51531 ZSCAN30-208ENST00000592278 731 ntTSL 4 BASIC29.33■■■□□ 2.29
SMARCA2P51531 KLK15-203ENST00000596931 692 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
SMARCA2P51531 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.33■■■□□ 2.29
SMARCA2P51531 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
SMARCA2P51531 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
SMARCA2P51531 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC29.33■■■□□ 2.29
SMARCA2P51531 CD300LG-206ENST00000588884 1459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.33■■■□□ 2.29
SMARCA2P51531 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
SMARCA2P51531 ZFP64-205ENST00000371518 1841 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
SMARCA2P51531 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
SMARCA2P51531 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
SMARCA2P51531 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
SMARCA2P51531 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
SMARCA2P51531 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
SMARCA2P51531 CARTPT-201ENST00000296777 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
SMARCA2P51531 MAGEA12-203ENST00000393900 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
SMARCA2P51531 CTBP2P5-201ENST00000454986 1264 ntBASIC29.32■■■□□ 2.28
SMARCA2P51531 RNA5SP412-201ENST00000516234 123 ntBASIC29.32■■■□□ 2.28
SMARCA2P51531 AC109479.1-201ENST00000519603 624 ntTSL 2 BASIC29.32■■■□□ 2.28
SMARCA2P51531 AC136475.5-202ENST00000524824 587 ntTSL 4 BASIC29.32■■■□□ 2.28
SMARCA2P51531 C12orf57-206ENST00000544681 980 ntTSL 2 BASIC29.32■■■□□ 2.28
SMARCA2P51531 TROAP-207ENST00000548311 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.32■■■□□ 2.28
SMARCA2P51531 AP001005.4-201ENST00000572530 387 ntTSL 3 BASIC29.32■■■□□ 2.28
SMARCA2P51531 ACTL9-201ENST00000324436 1426 ntAPPRIS P1 BASIC29.32■■■□□ 2.28
SMARCA2P51531 DRG1-201ENST00000331457 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
SMARCA2P51531 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
SMARCA2P51531 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
SMARCA2P51531 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
SMARCA2P51531 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.9 ms