Protein–RNA interactions for Protein: P41271

NBL1, Neuroblastoma suppressor of tumorigenicity 1, humanhuman

Predictions only

Length 181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NBL1P41271 MBD1-207ENST00000398488 1512 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NBL1P41271 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NBL1P41271 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NBL1P41271 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
NBL1P41271 PPA2-201ENST00000341695 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NBL1P41271 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NBL1P41271 LSM10-201ENST00000315732 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NBL1P41271 RGS10-202ENST00000369103 804 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NBL1P41271 AL160290.2-201ENST00000448347 831 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NBL1P41271 SNHG11-212ENST00000449351 954 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NBL1P41271 BX284668.4-201ENST00000453917 508 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
NBL1P41271 AC097717.1-202ENST00000457577 740 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NBL1P41271 AC120498.1-201ENST00000563593 476 ntTSL 4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NBL1P41271 KC6-205ENST00000599934 556 ntTSL 4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NBL1P41271 AL391069.4-201ENST00000609583 481 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
NBL1P41271 ELOA3C-201ENST00000620688 1218 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NBL1P41271 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NBL1P41271 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NBL1P41271 SPIN2A-201ENST00000374906 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NBL1P41271 GRN-222ENST00000639447 1314 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NBL1P41271 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
NBL1P41271 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NBL1P41271 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NBL1P41271 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NBL1P41271 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NBL1P41271 OGG1-206ENST00000349503 1950 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NBL1P41271 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NBL1P41271 SH3GLB2-205ENST00000416629 1415 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NBL1P41271 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NBL1P41271 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NBL1P41271 FDPS-201ENST00000356657 1478 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NBL1P41271 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NBL1P41271 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NBL1P41271 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
NBL1P41271 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
NBL1P41271 PTHLH-202ENST00000395868 1674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
NBL1P41271 KCNJ2-202ENST00000535240 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
NBL1P41271 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
NBL1P41271 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
NBL1P41271 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NBL1P41271 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NBL1P41271 SPAG7-201ENST00000206020 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NBL1P41271 MIOX-201ENST00000216075 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NBL1P41271 RPS3-201ENST00000278572 907 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NBL1P41271 TNFRSF12A-202ENST00000341627 881 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NBL1P41271 C9orf16-201ENST00000372994 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NBL1P41271 CPLX2-202ENST00000393745 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NBL1P41271 TMEM177-203ENST00000409951 1216 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NBL1P41271 AC016723.1-201ENST00000430546 633 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NBL1P41271 AC004898.1-201ENST00000451057 766 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
NBL1P41271 SELENOT-203ENST00000477889 944 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NBL1P41271 TPO-215ENST00000539820 1157 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NBL1P41271 AC009133.1-202ENST00000563806 494 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NBL1P41271 AC013565.3-201ENST00000565547 450 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NBL1P41271 AC012173.1-201ENST00000567942 430 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NBL1P41271 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NBL1P41271 MIR22HG-212ENST00000577164 931 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NBL1P41271 MIR3619-201ENST00000579667 83 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
NBL1P41271 AC061975.2-201ENST00000581722 295 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
NBL1P41271 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NBL1P41271 RPP40-207ENST00000618533 1056 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NBL1P41271 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NBL1P41271 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NBL1P41271 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NBL1P41271 PRPS2-203ENST00000398491 1348 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NBL1P41271 AC092978.1-201ENST00000474979 1309 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NBL1P41271 AC092978.1-202ENST00000637590 1327 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
NBL1P41271 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NBL1P41271 AL021920.2-201ENST00000624828 1351 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
NBL1P41271 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NBL1P41271 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NBL1P41271 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NBL1P41271 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NBL1P41271 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NBL1P41271 C14orf93-205ENST00000397379 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NBL1P41271 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NBL1P41271 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NBL1P41271 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NBL1P41271 P4HA2-201ENST00000166534 2230 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NBL1P41271 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NBL1P41271 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NBL1P41271 NEU2-201ENST00000233840 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NBL1P41271 RHCE-202ENST00000340849 1087 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NBL1P41271 PPIE-203ENST00000372830 1198 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NBL1P41271 ZNF248-202ENST00000374648 1286 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NBL1P41271 RABL2A-203ENST00000393166 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NBL1P41271 AC115284.1-201ENST00000488257 547 ntTSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NBL1P41271 EVX1-AS-202ENST00000519050 576 ntTSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NBL1P41271 FGFR1OP2-206ENST00000546072 956 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NBL1P41271 HADH-212ENST00000638621 741 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NBL1P41271 AL109955.1-201ENST00000417346 1540 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NBL1P41271 HMBS-209ENST00000537841 1559 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NBL1P41271 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
NBL1P41271 MAGEA8-201ENST00000286482 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NBL1P41271 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NBL1P41271 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NBL1P41271 ZBP1-202ENST00000395822 2073 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NBL1P41271 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NBL1P41271 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NBL1P41271 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.7 ms