Protein–RNA interactions for Protein: P32239

CCKBR, Gastrin/cholecystokinin type B receptor, humanhuman

Predictions only

Length 447 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCKBRP32239 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CCKBRP32239 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CCKBRP32239 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CCKBRP32239 KIF13B-206ENST00000524189 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CCKBRP32239 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CCKBRP32239 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CCKBRP32239 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CCKBRP32239 LINC02167-203ENST00000566900 1489 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CCKBRP32239 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CCKBRP32239 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CCKBRP32239 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CCKBRP32239 WWTR1-204ENST00000467467 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CCKBRP32239 JPT1-209ENST00000482348 1614 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CCKBRP32239 ACP5-203ENST00000433365 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CCKBRP32239 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CCKBRP32239 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CCKBRP32239 NBPF11-205ENST00000615281 5494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CCKBRP32239 XPO5-201ENST00000265351 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CCKBRP32239 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CCKBRP32239 PRR15-201ENST00000319694 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CCKBRP32239 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
CCKBRP32239 CABP5-201ENST00000293255 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CCKBRP32239 IFT20-202ENST00000357896 974 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CCKBRP32239 OSTC-201ENST00000361564 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CCKBRP32239 AL732437.1-201ENST00000442008 595 ntTSL 4 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CCKBRP32239 INGX-202ENST00000489074 768 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
CCKBRP32239 MTRF1LP2-201ENST00000506027 1122 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
CCKBRP32239 RPS3A-212ENST00000514682 985 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CCKBRP32239 NRK-203ENST00000536164 908 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CCKBRP32239 AC133550.1-201ENST00000563565 295 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CCKBRP32239 AC087741.1-203ENST00000576824 820 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CCKBRP32239 MIR3909-201ENST00000579518 119 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
CCKBRP32239 GMFG-207ENST00000598034 1028 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CCKBRP32239 AC011491.2-201ENST00000599584 447 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CCKBRP32239 IRF1-211ENST00000613424 821 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CCKBRP32239 AC243571.2-201ENST00000615265 628 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CCKBRP32239 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CCKBRP32239 CFAP77-201ENST00000343036 1818 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CCKBRP32239 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CCKBRP32239 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CCKBRP32239 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CCKBRP32239 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CCKBRP32239 ZFP1-208ENST00000568079 1426 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CCKBRP32239 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CCKBRP32239 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CCKBRP32239 MTDH-201ENST00000336273 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CCKBRP32239 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CCKBRP32239 ZDHHC19-201ENST00000296326 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CCKBRP32239 OTUD5-204ENST00000428668 1493 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CCKBRP32239 CAMKV-204ENST00000466940 1475 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CCKBRP32239 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CCKBRP32239 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CCKBRP32239 SENP6-205ENST00000447266 6501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CCKBRP32239 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CCKBRP32239 WDR74-206ENST00000529106 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CCKBRP32239 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CCKBRP32239 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CCKBRP32239 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CCKBRP32239 LMNB2-201ENST00000325327 4671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CCKBRP32239 DYNLL1-201ENST00000242577 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CCKBRP32239 PODNL1-201ENST00000254320 1859 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CCKBRP32239 WASH6P-202ENST00000359512 1437 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
CCKBRP32239 HDAC8-202ENST00000373556 704 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CCKBRP32239 VCX3A-201ENST00000381089 995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CCKBRP32239 CYB5A-203ENST00000397914 619 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CCKBRP32239 MECP2-203ENST00000407218 1174 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CCKBRP32239 RBM43-202ENST00000409092 579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CCKBRP32239 NR4A2-203ENST00000409108 1735 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CCKBRP32239 SPDYE7P-202ENST00000420373 878 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
CCKBRP32239 AC107890.1-201ENST00000422478 521 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
CCKBRP32239 AL513327.2-201ENST00000432703 490 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CCKBRP32239 NAGK-205ENST00000443938 1221 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CCKBRP32239 AL583722.3-202ENST00000554954 486 ntTSL 4 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CCKBRP32239 CERNA1-201ENST00000559779 908 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CCKBRP32239 TBL3-205ENST00000568546 6803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CCKBRP32239 TMEM88-202ENST00000574668 510 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CCKBRP32239 AC091167.2-201ENST00000579581 588 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
CCKBRP32239 AC104985.1-201ENST00000587528 507 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CCKBRP32239 SNHG8-201ENST00000602414 672 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CCKBRP32239 SNHG8-205ENST00000602819 470 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CCKBRP32239 CBR3-AS1-216ENST00000624883 564 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CCKBRP32239 AC247036.6-201ENST00000632950 410 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CCKBRP32239 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CCKBRP32239 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CCKBRP32239 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CCKBRP32239 EPHX1-206ENST00000614058 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CCKBRP32239 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CCKBRP32239 BORCS8-203ENST00000477565 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CCKBRP32239 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CCKBRP32239 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CCKBRP32239 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
CCKBRP32239 NDUFV1-216ENST00000529927 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
CCKBRP32239 DAB2IP-205ENST00000408936 6784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCKBRP32239 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCKBRP32239 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCKBRP32239 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCKBRP32239 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCKBRP32239 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCKBRP32239 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCKBRP32239 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.5 ms