Protein–RNA interactions for Protein: P15924

DSP, Desmoplakin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,871 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DSPP15924 KLF2P4-201ENST00000451959 1225 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
DSPP15924 TMEM198B-204ENST00000484016 896 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
DSPP15924 FADS2-205ENST00000517839 469 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
DSPP15924 HCG18-245ENST00000602550 559 ntTSL 4 BASIC15.4■□□□□ 0.06
DSPP15924 LINC00623-205ENST00000621058 767 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
DSPP15924 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
DSPP15924 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
DSPP15924 KLRG1-201ENST00000266551 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
DSPP15924 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
DSPP15924 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
DSPP15924 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
DSPP15924 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
DSPP15924 SHISA5-219ENST00000612611 1677 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
DSPP15924 BOLA3-201ENST00000295326 444 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
DSPP15924 LRCOL1-201ENST00000376608 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
DSPP15924 NUS1P3-201ENST00000423502 862 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
DSPP15924 GEMIN4-202ENST00000437269 1182 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
DSPP15924 DGUOK-AS1-202ENST00000439192 563 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
DSPP15924 BTNL8-205ENST00000505126 1294 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
DSPP15924 FAU-205ENST00000527548 538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
DSPP15924 ACTG1P17-201ENST00000558391 1119 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
DSPP15924 AC093726.1-201ENST00000608064 963 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
DSPP15924 LAMTOR5-208ENST00000614544 846 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
DSPP15924 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
DSPP15924 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
DSPP15924 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
DSPP15924 SIGLEC7-201ENST00000305628 1469 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
DSPP15924 DNAJC7-201ENST00000316603 1468 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
DSPP15924 HDHD3-202ENST00000374180 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
DSPP15924 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
DSPP15924 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
DSPP15924 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
DSPP15924 ITPA-202ENST00000399838 897 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
DSPP15924 PP14571-201ENST00000404327 934 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
DSPP15924 RAB34-206ENST00000415040 1293 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
DSPP15924 MDM2-215ENST00000428863 1037 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
DSPP15924 BX324167.1-201ENST00000451118 805 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
DSPP15924 LAMA5-AS1-203ENST00000478167 690 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
DSPP15924 AC074194.1-201ENST00000505025 622 ntTSL 4 BASIC15.39■□□□□ 0.05
DSPP15924 RORA-AS1-205ENST00000559824 761 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
DSPP15924 DERL2-202ENST00000570848 657 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
DSPP15924 IL32-235ENST00000613483 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
DSPP15924 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
DSPP15924 HOXB5-201ENST00000239151 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
DSPP15924 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
DSPP15924 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
DSPP15924 NCALD-217ENST00000521599 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
DSPP15924 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
DSPP15924 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
DSPP15924 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
DSPP15924 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
DSPP15924 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
DSPP15924 FLT3LG-201ENST00000204637 1046 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
DSPP15924 HLA-H-201ENST00000383620 1096 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
DSPP15924 AC006003.1-201ENST00000448541 613 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
DSPP15924 DUSP13-206ENST00000472493 920 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
DSPP15924 AC013565.3-202ENST00000570120 460 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
DSPP15924 PFN1-203ENST00000574872 1173 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
DSPP15924 PIGL-212ENST00000581006 554 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
DSPP15924 OTUB1-206ENST00000535715 1391 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
DSPP15924 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
DSPP15924 SPDYE7P-201ENST00000355920 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
DSPP15924 LYPLA2-201ENST00000374501 1117 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
DSPP15924 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
DSPP15924 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
DSPP15924 AL121983.1-201ENST00000424181 335 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
DSPP15924 AL121845.2-201ENST00000467211 252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
DSPP15924 IL32-215ENST00000529550 772 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
DSPP15924 KRT8P19-201ENST00000551916 1455 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
DSPP15924 AC091167.2-201ENST00000579581 588 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
DSPP15924 SNHG22-201ENST00000589499 1615 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
DSPP15924 IRF3-223ENST00000599223 1055 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
DSPP15924 AL365330.1-201ENST00000607459 531 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
DSPP15924 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
DSPP15924 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
DSPP15924 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
DSPP15924 TBP-207ENST00000616883 1750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
DSPP15924 GALE-216ENST00000617979 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
DSPP15924 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
DSPP15924 AC005229.1-201ENST00000392885 409 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
DSPP15924 AL355334.1-201ENST00000417713 215 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
DSPP15924 AC006033.1-201ENST00000440505 426 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
DSPP15924 TMEM191A-209ENST00000452055 788 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
DSPP15924 LDHBP1-201ENST00000455730 1119 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
DSPP15924 LYRM4-206ENST00000468929 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
DSPP15924 CCKBR-202ENST00000525014 792 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
DSPP15924 ACRV1-202ENST00000527795 782 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
DSPP15924 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
DSPP15924 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
DSPP15924 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
DSPP15924 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
DSPP15924 MTFR2-203ENST00000420702 1793 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
DSPP15924 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
DSPP15924 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
DSPP15924 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
DSPP15924 HILPDA-201ENST00000257696 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
DSPP15924 FLYWCH2-201ENST00000293981 915 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
DSPP15924 S100A16-201ENST00000368703 946 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
DSPP15924 C11orf88-202ENST00000375618 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
DSPP15924 KRT43P-201ENST00000434019 910 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39 ms